翁之琪、张应祥等老将对此深以为然，治军就必须如此，唯有令行禁止，方能练出强兵。吴易、孙兆奎等人虽觉严苛，但也明白这是成为正规强军的必由之路，均表示会严格在所部执行。老将黄蜚则陷入深深的思考中、感叹英雄出少年。
赵高翔要的就是这个效果。他深知，此刻没有时间用温水煮青蛙的方式慢慢感化，必须用最直接、最震撼的方式，将纪律的观念刻进每个人的脑子里，迅速将这支杂合的队伍，锤打成一支听得懂命令、守得住规矩、打得赢硬仗的军队。简单粗暴，但往往最有效果。
军令颁布后，整个根据地的风气为之一肃。各营操练的号子声更加整齐响亮，巡逻队更加警惕，军容军纪肉眼可见地提升了一个档次。
同时，他下达了另外两项指令：
其一，命李恪、刘光标负责，挑选再召集绝对可靠的工匠以及苏州带来的工匠和护卫，秘密进驻远离大陆的嵛山岛（位于福宁州外海），利用岛上隐蔽地形，开设秘密工匠坊，重点研制、改进火器（燧发枪、火炮）、火药以及各类军械。所有物资通过秘密渠道运送。“该岛列为军事禁地，未经李恪或我本人手令，任何人不得靠近，违令者，以通敌论处，格杀勿论！”
其二，再次郑重委托唐晏珠，全面负责童子营学堂事宜。“唐小姐，这些孩子，是我等的未来。不仅教他们识字算术，更要因材施教。细心观察，按其性情天赋，大致分为文、武、工、谍四类。文者，习政务、经济、管理，未来安邦定国；武者，练体魄、学兵法，未来驰骋沙场；工者，授其格物、制造之理，未来改进军械、发展百工；谍者，择其心思缜密、胆大心细者，暗中培养，未来或为‘听风者’。此外，需请黄老将军、陈先生定期前往授课。黄老将军多讲战场铁血、忠勇爱国之故事，传授实战经验；陈先生则讲授天下大势、华夷之辨、忠义气节。务必使这些孩子，皆成栋梁之材！”
唐晏珠领命，深感责任重大，亦觉赵高翔思虑之深远，远超寻常武将。
军令森严，足以立威。大家都知道，欲使将士用命，甘效死力，仅靠严刑峻法是远远不够的。必须让士卒们无后顾之忧，看得见实实在在的好处，方能收揽人心，凝聚死士。在整编军队、颁布军令的同时，他也将粮饷与抚恤这两件关乎军心稳定的头等大事提上了日程。
他再次召集王秀楚、王柱、黄蜚、陈子龙等核心成员，专门商议此事。
“诸位，”赵高翔开门见山，“军令已颁，执法已立。然，刀剑虽利，需以恩义持之。欲令将士们临阵不怯，死不旋踵，必使其家室无忧，生计有靠。今日请诸位来，便是要定下我军粮饷发放与阵亡抚恤之章程。”
王秀楚捻须颔首：“将军所言极是。‘军无财，士不来；军无赏，士不往’。古之明训，不可不察。尤其抚恤一事，关乎忠义，彰显仁德，乃激励生者之要务。”
王柱则面露难色，低声道：“赵哥，呃…将军，按额足饷，所费已是巨万，若再加以厚恤，这银钱开支…恐难以为继啊。”他掌管钱粮，深知压力巨大。
赵高翔摆手道：“银子的事，我来想办法。苏州带来的…库底，还能支撑一段时日。后续，开源节流，总能筹措。但弟兄们的卖命钱和安家费，绝不能省！此事关乎我军根基，必须定下规矩，公之于众，严格执行！”
他结合自己对明末军制弊病的了解（如明军后期因粮饷不足、克扣成风而导致大规模哗变、溃散），提出了一系列旨在收买军心、远超当时普遍标准的制度：
一、 粮饷定制（月饷）：
1. 战兵：每月足色纹银一两五钱，另发米一石（或等价粮食）。绝不折扣，绝不拖延！每月十五，由督战执法处监督，各营主将协同，王柱负责，公开、足额发放至每个士卒手中。
2. 辅兵\/匠兵：每月纹银一两，米一石。
3. 军官饷银：依官职递增，哨长以上军官，除俸银外，另有“带兵恩饷”。具体数额由王柱拟定，原则是使其足以养家、抚恤部下，不至贪墨。
4. 严惩克扣：重复军令，凡有克扣军饷者，无论官职，贪一两即斩！ 士卒可向执法队直接告发。
二、 战功厚赏：
1. 临阵杀敌一级，经核实验明，赏银十两！当场兑现或记功登记，战后发放。
2. 缴获物资、器械、舟船，折价二成归个人，三成归该营，五成归公。由执法处与王柱共同核验分配。
3. 重大战功（如先登、破阵、救主、献城等），另有土地、官职、特殊荣誉称号等重赏。
三、 阵亡抚恤（重中之重）：
赵高翔对此格外强调，他沉声道：“凡我麾下将士，战殁沙场者，其家小由我赵高翔与全军奉养！”
1. 抚恤金：阵亡者， 发放抚恤银三十两予其家属（或同营战友代转）。此为一笔安家费，助其办理后事，度过最初难关。