“信息战”的硝烟渐散，寒川在掌控舆论、巩固内部共识方面初步站稳了脚跟。林牧之与他的重臣们，凭借高超的政治智慧和果断的应对策略，化解了一场旨在动摇国本的无形危机。然而，正当朝廷上下将主要精力重新投注于远洋舰队建设、海外拓殖和技术迭代之时，一些伴随着科技飞速发展而滋生、并逐渐累积的 “内部问题” ，开始如同地下涌动的暗流，悄然浮出水面，其来势之汹涌，影响之深远，丝毫不亚于任何外部威胁。这些，是科技之光投射下，无法避免的阴影，是进步所带来的阵痛与代价。
第一个尖锐的问题，以一种触目惊心的方式，爆发于环境与民生领域。
初春时节，一封由京城府尹递上的紧急奏报，摆在了内阁首辅王玄策的案头。奏报称，流经京城工业区外的 “墨水河” ，近日河水乌黑发臭，鱼虾绝迹，沿岸百姓饮用后，呕吐腹泻者甚众，更有数十人重病不起。几乎同时，工造总局下属最大的“神机坊”周边居民联名上书，投诉坊内日夜不休的锻锤声、锅炉的轰鸣声震耳欲聋，浓密的黑烟遮天蔽日，煤灰粉尘飘散，导致附近孩童多有咳喘之疾，衣物无法晾晒，井水亦有异味。
王玄策不敢怠慢，立即派人调查。结果令人震惊：“墨水河”的污染，源头直指沿河新建的数家大型工坊，它们将未经处理的废水、废料直接排入河道；而“神机坊”周边的环境恶化，更是工业化生产集中带来的典型恶果。这已非个案，在寒川主城及几个工业重镇，类似的情况正在不同程度地上演。
消息传开，朝野震动。以往被科技带来的繁荣和强大所掩盖的环境代价，第一次以如此直接、惨痛的方式呈现在世人面前。以翰林院清流为首的官员们，纷纷上书抨击工造总局“只顾产出，不顾民生”，是“以邻为壑，竭泽而渔”，要求严惩相关官员，甚至暂停部分高污染工坊的生产。受害的百姓更是群情激愤，一度围堵了工造司衙门。
工造总局会办大臣陈烁面临着前所未有的压力。他深知工坊的污染问题，但在“赶超奥伦特”、“加速海军建设”的巨大压力下，环保措施往往被置于次要位置。他试图辩解：“陛下，诸公！工坊废水、废气，实为生产之必然！若要处理，需增建净化池、高烟囱，耗费巨大，且会拖慢‘盘龙五号’蒸汽机与新型舰炮的生产进度！如今外有强敌虎视，岂能因小失大？”
但他的辩解，在百姓的病痛和环境的疮痍面前，显得苍白无力。王玄策痛心疾首地反驳：“陈大人！‘小’？百姓健康、绿水青山，乃是国之根本！若家园不存，纵有万千巨舰，又何以为国？此非‘小失’，乃是动摇国本之‘大患’！”
第二个问题，则源于科技发展导致的社会结构变化，带来了新的社会矛盾。
随着工造业的急速扩张，一个前所未有的阶层——产业工匠和工人——数量急剧膨胀。他们脱离了土地，聚集在城镇工坊，依靠技艺和劳力换取薪酬。然而，他们面临着漫长的工作时间、恶劣的工作环境、低廉的报酬，以及缺乏保障的生活。一些大型官营工坊的管理者，为追求效率，对待工匠苛刻，克扣工钱、随意处罚之事时有发生。
终于，在位于寒川主城最大的“龙威兵器工坊”，爆发了寒川历史上第一次有记录的工匠集体抗议事件。数百名工匠因不满坊主强行延长工时、却拒绝增加薪酬，集体停工，围堵了坊主衙署，要求改善待遇。事件虽很快被官府派兵弹压下去，但其背后折射出的劳资冲突和新兴阶层的权益诉求，却像一记警钟，敲在了统治者的心头。
部分保守派官员视此为“刁民作乱”，主张严厉镇压。但户部尚书王玄策却看到了更深层的社会危机：“陛下，此非简单骚乱。工匠乃我科技兴邦之基石，若其生计无着，怨气积累，则我军工命脉堪忧！需妥善疏导，而非一味强压。”
第三个问题，则更为隐晦，关乎伦理与秩序。
格致学院医药科在磺胺的基础上，尝试利用化学合成技术研制更强效的消炎药。在一次实验中，他们偶然发现了一种具有强烈致幻作用的化合物。此事被一名信奉传统医道、对“格物炼丹”持批判态度的太医捅到了朝廷，斥责格致学院“妄窥天机，炼制邪药，恐为祸人间”，在士大夫中引起了不小的争议，认为科技的发展正在触及不该触碰的领域。
甚至连军事领域也出现了新问题：基于新式望远镜和数学计算的新型“雷龙炮”，射程和精度大增，但也使得战争变得更加残酷和高效，一些老派将领私下担忧，这种“杀人于数里之外”的技艺，是否过于有伤天和？
这一系列纷至沓来的新问题，让林牧之陷入了深深的沉思。他召来了陈烁、王玄策、皇甫嵩以及几位德高望重的宗室元老，在御花园的水榭中议事，气氛凝重。