故而，在军改之下，逐渐衍生出了二元军队制度
“仆从军——精锐军”
然而，在这种情况下，有的军阀却仍然贪军饷，贪上报的名额，导致翻车的事件
永明三年3月10日，原邵阳总兵卢鼎对原本的下属多有苛刻、贪墨军饷，下属军士本就对其怨声载道
而他本身在邵阳的军队便有3万人，然而，能上战场的不过1000人
在接受军改后，被朝廷任命为左军都督府同知，但由于贪了太多，导致连精锐部队都心生不满
最后部分军官忍无可忍，在首领章节、熊锡恩的率领下，在邵阳发动叛乱
叛军趁着夜色围攻同知府，以及各个官署
卢鼎身亡，邵阳巡抚傅作霖连夜翻墙逃到南昌报信，最后由李定国亲自出马，方才平息叛乱
零微之火，转瞬即逝
在稳定内部后
永明三年4月20日，在内阁首辅李永茂、大学士兵部尚书钱澄之的举荐下
召回福建总督周亮工，改以户部尚书
原户部尚书堵胤锡升任东阁大学士、督师福建
大理寺卿任斗墟出任福建巡抚
然而，早在朝会结束后，周亮工回到福建后便快马告知郑成功改革之事，以及朝廷即将大规模对福建用兵
同时，在钱澄之的劝说下
朱由榔诏封在舟山屯兵的王翊为建宁侯、水师提督，王翊虽为鲁王部将
然鹅在部下的劝说之下，在一番思想斗争后，随即应允
然而，这一切早被伏龙卫在永明朝廷的眼线探知，在郑成功的请求下
虽然朱亨嘉命驻守赣州的第三军派遣数万人陈兵广东，借此威慑永明朝廷，同时伏龙卫策动永明朝廷的官员，舆论阻碍
但是永明朝廷君臣的毅力超出所有人预料
大学士兵部尚书钱澄之力排众议，同时对周亮工这个福建回朝的人多有戒备，命户部侍郎卢桂生全权钱粮后勤
永明三年6月20日，前军都督李定国，率领部众八万人北上，进攻黄州、九江，中军都督刘文秀率军8万人东进，进攻漳、泉
永明三年7月10日，黄州、九江等地一听是李定国的威名，当即弃城逃走，李定国兵不血刃，收复湖广、江西北部
与此同时，当蜀王刘文秀的大军来到福建时，郑成功早已将所占之地的军民撤至金厦，刘文秀随即派大将率兵进驻漳州，防备广东
福宁、泉州、漳州再度回到永明帝手中，同时王翊的水师进驻泉州、漳州等地，保卫海上安全
消息传到南昌，永明帝大喜
朝野上下突然狂热起来，纷纷要求进攻收复杭州
然而钱澄之却力排众议
当今国库空虚、各地新附，需休养生息，万万不可滋生兵事，且鲁藩可为藩屏，阻清军南下
若是攻之，当与南京连根拔起，先当休养生息，补充军备粮饷
三年之后，百万雄师北上，一举收复南京！
就在永明朝廷、顺治朝廷纷纷专注内政，改革国事之际
那西南的施工队，却是一片热火朝天......