咸丰六年初秋，杭州城内外已是战云密布。韦昌辉亲率太平军西路主力数万人，挟连克州县之威，进抵杭州城下，将这座东南名城围得水泄不通。城头，清军旗帜猎猎，守军严阵以待，巡抚罗遵殿、八旗将军瑞昌连日登城督战，誓言与城共存亡。然而，看似坚固的城防之下，内部反抗的浪潮却在快速蔓延。
围城数日，太平军并未急于发动总攻。韦昌辉采纳了林阳“攻心为上”的方略，一方面令部队大张旗鼓地挖掘壕沟、构筑工事，摆出长期围困的架势，给守军施加巨大的心理压力；另一方面，利用沈葆等内应提供的城内虚实，不断将劝降书信射入城中，宣扬太平天国“有田同耕，有饭同食”的政策，并重点分化城内团练与八旗、绿营兵之间的矛盾。
这一招果然奏效。城内粮价飞涨，人心惶惶。被强征入城的民夫怨声载道，部分本就对八旗兵待遇优渥不满的绿营兵和团练，在太平军“只诛首恶，胁从不问”的宣传下，开始军心浮动。
时机逐渐成熟。
是夜，月黑风高。杭州城清波门附近，一片死寂中潜藏着躁动。沈葆府中的心腹家丁，借着夜色的掩护，悄然摸近了城门附近的守军驻地。他们并非去厮杀，而是将掺有强效蒙汗药的酒肉，送到了几个关键哨位“犒劳”守夜的绿营兵。这些底层兵丁早已饥肠辘辘，对上司的克扣怨气冲天，见到沈家送来的“好意”，大多未加怀疑。不过半个时辰，几个要害位置的哨兵便已鼾声如雷。
与此同时，在沈葆提供的城防图上标注出的几段相对薄弱的城墙下，太平军工兵营的精锐，正利用夜色的掩护和土工作业的噪音，悄无声息地将tNt炸药埋设到位。
子时三刻，正是人一天中最困倦之时。
韦昌辉站在城外高处，目光如炬，盯着漆黑的城市轮廓。他深吸一口气，猛地挥下手：
“发信号！爆破！三发红色的信号弹蹿上夜空，划出刺目的轨迹。
几乎在信号弹升空的同时——
“轰！”
“轰隆！”
地动山摇般的巨响猛然从清波门、涌金门方向炸响！埋设的炸药被同时引爆，巨大的冲击波将两段城墙连同上面的城楼、守军一起抛向空中，砖石横飞，火光冲天，瞬间撕开了杭州城看似坚固的防御体系！
“天兵进城了！降者免死！”
震天的喊杀声从爆破口外传来！早已蓄势待发的太平军突击队，如同决堤的洪水，从城墙的豁口处汹涌而入！他们三人一组，交替掩护，手中的乌兹冲锋枪喷射出致命的火舌，迅速清理着被炸蒙了的残存守军。
城内的混乱瞬间达到顶点。被爆炸声惊醒的守军仓促应战，指挥系统陷入瘫痪。更致命的是，早已被策反或动摇的部分绿营和团练，此刻非但没有全力抵抗，反而有人调转枪口，高喊着“开城迎天兵”，加入了制造混乱的行列，甚至主动引导太平军向城内纵深冲杀。