医正堂的招生持续了十日，报名者络绎不绝。有寒门学子，有药铺学徒，甚至还有几个被太医院拒之门外的女子。凌云一一面试，最终选定十二人，其中三个最特别：
陆明远，陆文昭之子，因父亲被诬而自卑，却偷偷抄录了父亲所有的医案；
李文轩，铁匠之子，天生巧手，能盲拆复杂机关，曾用废铁打造出能精准切割药材的；
阿芷，药童出身，识百草，懂药性，因女子身份被太医院拒之门外，却能在暴雨天冒死采回稀缺的七叶一枝花。
拜师礼那天，太医院空无一人。杨院判称病不出，老御医们也集体告假。凌云却不以为意，只让弟子们在医正堂的院子里种下十二棵银杏树，寓意杏林春暖。
从今日起，你们不再是寒门子弟、铁匠之子、药童阿芷。 凌云指着院中的《医训碑》，你们是医正堂的弟子，是未来的。记住八个字——医者仁心，实事求是
弟子们齐声应诺。陆明远却注意到，凌云腰间断剑的剑穗上，挂着一枚小小的银质十字架——那是西洋之物。他心中一动：先生游历西洋，究竟看到了怎样的医道？
当晚，陆明远在藏书阁翻阅医书时，发现一本用羊皮纸装订的《西洋解剖图》。翻开第一页，便是一幅人体骨骼图，标注着等名称，与中医的五脏六腑完全不同。
你看这个做什么？ 阿芷端着药膳进来，见他盯着图谱发呆，好奇道。
陆明远指着图谱：中医说心主神明，西洋人说脑主思虑。到底哪个对？
阿芷想了想：先生说过，医道要实事求是。或许……两者都对？
陆明远若有所思。他想起父亲临终前的话：医道如行路，前人指的方向未必对，要自己走一遍才知道。
窗外，月光洒在十二棵银杏树上，枝叶婆娑。医正堂的故事，才刚刚开始。
医正堂的教学，从洗手消毒开始。
医者术前不洗手，与屠夫何异？ 凌云站在讲台上，将一碗浑浊的水泼在地上，这水是你们刚才摸过药材后没洗手的，里面有看不见的，会让伤口溃烂。
弟子们面面相觑。李文轩举手：先生，何为？
凌云取出一个西洋显微镜——那是他用三箱药材从西洋传教士手中换来的。 他将一片发霉的馒头放在载玻片上，对着光源。
弟子们凑过去，只见一片模糊的视野中，有无数细小的在蠕动。
这就是。 凌云解释道，它们藏在脏水、腐肉、病人的脓血中，进入人体就会生病。所以，每次看病前后，必须用皂角水洗三遍手，再用酒擦拭。
阿芷皱眉：先生，这……这会不会太麻烦？
嫌麻烦，就别当大夫。 凌云语气严厉，你们手中的银针、药刀，是救命的工具，不是害人的凶器。若因懒怠让病人染病，与庸医何异？
弟子们不敢再言。陆明远却在笔记本上写下：洗手三遍，皂角+酒，防腐虫。
第一课结束，凌云带着弟子们去了义庄。
义庄内阴气森森，停着几具无人认领的尸体。凌云指着一具溺亡的农妇尸体：今日教你们脏腑如轮，气血为轴。先看这心肺，如同风箱，推动气血运行；再看这脾胃，如同磨盘，消化水谷精微。
他取出手术刀，在农妇腹部划开一道口子。弟子们吓得后退，只有李文轩凑上前：先生，我能摸摸这心脏吗？
凌云点头。李文轩伸手探入尸体胸腔，触到那颗冰冷的心脏。好硬…… 他喃喃道，像块石头。
溺水时，冷水刺激心脏骤停，气血凝滞，故僵硬。 凌云一边讲解，一边用猪羊内脏演示，你们看，这猪心与人心结构相似，都有四个腔室，负责泵血。