黄巢复叛后，立刻挥师渡江，进攻江南地区。他就像一阵旋风，接连攻下虔、吉等州，又攻打浙江东西部。为了避免与劲敌唐镇海节度使高骈决战，黄巢还想出了一个奇招，他从衢州到建州开辟山路 700 里，挺进福建，攻下了福州城。这一招可把唐朝的官员们给惊呆了，纷纷感叹：“这黄巢，真是个不按常理出牌的家伙！”
唐僖宗一看黄巢这么能折腾，又想招安他，委任黄巢为率府帅。可黄巢根本不买账，直接拒绝了。乾符六年（公元879 年）九月，黄巢指挥农民军南下向广州进军，经过一番激烈的战斗，攻占了广州城。
攻下广州后，黄巢自称“义军百万都统”，还发布檄文，斥责朝廷朝政由宦官把持，把唐朝的那些丑事都给抖了出来。这檄文一发布，就像一颗炸弹，在唐朝的官场炸开了锅，那些官员们气得是咬牙切齿，可又拿黄巢没办法。
在广州休整之后，黄巢率军向西北进军，十月，攻取桂州，占据了岭南的大部分地区。广明元年（公元880 年），正好遇到湘江水高涨，黄巢抓住这个机会，挥师自桂林顺湘江乘船北上，连下永州、衡州、潭州，灭敌十万，李系溃逃。这一系列的胜利，让黄巢的名声大振，农民军的士气也达到了顶点。
广明元年（公元880 年）五月，黄巢率军在信州歼灭高骈的大批精锐，接着又连下睦州、婺州等地。十一月，黄巢率领农民军北渡淮河，进颍、宋、徐等州境内，纵横千里。沿途的农民看到黄巢的队伍这么厉害，纷纷踊跃加入，农民军迅速扩展到六十万人。这时候的黄巢，那是意气风发，仿佛天下都在他的掌握之中。
农民军进入汝州后，黄巢向唐军传檄，让他们不要抵抗农民军先锋。然后，兵临东都洛阳。唐东都留守刘允章一看这架势，吓得腿都软了，哪还敢抵抗啊，赶紧率领文武官员开城向黄巢投降。黄巢不费一兵一卒，就拿下了洛阳，这可把他给乐坏了，他自称“率土大将军”，在洛阳城里好好地风光了一把。
同年十二月初，农民军自洛阳西进攻克潼关，唐僖宗一看大事不妙，吓得赶紧携带文武百官南逃。这皇帝都跑了，长安城里的官员们更是乱成了一锅粥。不久，黄巢亲率农民军进入长安，百姓们夹道欢迎，都盼着黄巢能给他们带来好日子。
黄巢带领的农民军，刚开始纪律还挺严明，不掠夺百姓的财产，将士们在街道上每遇到贫民，往往还会对他们加以施舍。百姓们一看，这和之前的官军完全不一样啊，都觉得黄巢是个好领导，对他充满了期待。
黄巢占领长安后，于十二月十三日正式建立农民政权，国号“大齐”，黄巢称帝，年号为“金统”。这一下，黄巢可算是实现了自己的皇帝梦，当年那个落第书生，如今竟然登上了皇位，这简直就像一场传奇的逆袭大戏。
可这大齐政权建立后，黄巢等人就开始安于现状，麻痹轻敌了。他们没有乘胜追击残余唐军，给了唐廷重新调兵遣将的机会。广明二年（公元881 年）三月，唐僖宗任命郑畋为京城四面诸军行营都统，程宗楚为副都统，负责进攻农民军。
黄巢派尚让、王璠带兵五万攻打郑畋，可他们太轻敌了，结果中了郑畋的埋伏，损失两万余人。四月，郑畋指挥唐军从四面围困住长安城。黄巢一看这情况，觉得守在长安城里不是办法，于是主动把农民军撤出长安，东屯灞上。
唐军进入长安后，就露出了他们的真面目，烧杀抢掠，无恶不作，把长安城里搞得是乌烟瘴气。百姓们这才发现，原来官军比农民军还可怕。农民军侦察到唐军入城后的混乱情况后，分兵数万重新杀进长安城，唐军被打得措手不及，死伤惨重。程宗楚、唐弘夫这两个指挥唐军入城的将领，也被农民军杀死。
虽然农民军重新夺回了长安，但他们的处境却越来越艰难。中和二年（公元882 年）正月，唐僖宗任命王铎为宰相，兼任诸道行营都统，统帅各路唐军将黄巢困于长安城。黄巢的军队没有粮食，只能以树皮等物充饥，日子过得那叫一个惨。
与此同时，黄巢任命的同州防御使朱温叛变，这对黄巢的大齐政权来说，无疑是雪上加霜。朱温这家伙，本来是黄巢的得力干将，可他一看黄巢的形势不妙，就脚底抹油，投降了唐朝。唐僖宗还赐名朱温为“全忠”，可这朱温一点也不忠，后来还成了唐朝的掘墓人。
中和三年（公元883 年）四月，黄巢实在是撑不下去了，只好主动把农民军撤出长安，转入河南。他以尚书左仆射孟楷为先锋进攻陈州，可没想到，陈州刺史赵犨早有准备，他坚壁清野，还公开说：“吾家久食陈禄，誓与此州共存亡。”
赵犨的顽强抵抗，让黄巢的农民军吃尽了苦头。他们围攻陈州近三百天，却始终没能攻下陈州。这陈州之战，让黄巢丧失了寻求发展的大好时机，而朱温、沙陀贵族李克用却迅速集结重兵，向黄巢发起了进攻。农民军在内外夹击之下，大部被唐王朝消灭。
中和四年（公元884 年）五月，尚让等一部分农民军将领向朱全忠和武宁节度使时溥投降。黄巢仅率千余人败走山东，兵败如山倒。最后，黄巢退至泰山狼虎谷，关于他的结局，有两种说法，一种是自杀，另一种是被其甥林言所杀，时年六十五岁。黄巢死后，首级被时溥送入长安表功，曾经不可一世的黄巢，就这样落幕了。
黄巢的一生，充满了传奇色彩。他从一个落第书生，成为了唐末农民起义的领袖，建立了大齐政权，差点推翻了唐朝的统治。他的起义，虽然最终失败了，但却给唐朝带来了沉重的打击，加速了唐朝的灭亡。
他提出的“均平”口号，反映了当时百姓对公平、平等的渴望，在中国农民战争史上具有重要的意义。他还横扫大江南北，打击了那些腐朽的官僚、地主，让他们知道，老百姓不是好欺负的。
但黄巢的起义军也有很多残忍的行为，比如攻占广州时的屠城，还有史书中记载的以活人为军粮等。这些行为，让他成为了一个备受争议的人物。有人说他是英雄，有人说他是杀人魔王，褒贬不一。
参考《新唐书》