桓玄于是将他逮捕，又派人问他还有什么要说的。罗企生说：“魏文帝杀了嵇康，嵇康的儿子嵇绍却成了晋朝的忠臣。我请求您留下我一个弟弟，让他奉养母亲！”桓玄最终杀死罗企生，赦免了他的弟弟。
这时，后凉王吕光病重，立太子吕绍为天王，自己号称太上皇帝，任命太原公吕纂为太尉，常山公吕弘为司徒。他对吕绍说：“如今国家多灾多难，三个邻国（指西秦、北凉、南凉）都在伺机而动。我死后，让吕纂统领军队，吕弘掌管朝政，你要恭谨行事，不要主动干预，把大权托付给两位兄长，或许还能渡过难关。如果你们兄弟内部互相猜忌，那么内乱很快就会发生。”
吕光又对吕纂、吕弘说：“吕绍（字永业）的才能不足以平定乱世，只是因为立嫡长子是常规制度，才让他位居君主之位。如今外部有强大的敌寇，人心不安，你们兄弟和睦，国家就能长久；如果内部互相图谋，灾祸很快就会到来。”吕纂、吕弘哭着说：“我们不敢。”吕光又握住吕纂的手告诫：“你性情粗暴，这是我最担忧的。一定要好好辅佐吕绍，不要听信谗言！”当天，吕光去世。
吕绍隐瞒丧事不对外公布，吕纂推门闯入宫中，痛哭哀悼后才出宫。吕绍害怕，要把王位让给吕纂，说：“兄长功劳高、年纪大，应当继承大统。”吕纂说：“陛下是国家的嫡长子，我怎敢冒犯！”吕绍坚持让位，吕纂不肯接受。
骠骑将军吕超对吕绍说：“吕纂担任将领多年，威名震动内外，面对丧事却不安分，举止张扬，必定有谋反之心，应当尽早除掉他。”吕绍说：“先帝的话还在耳边，怎能违背！我年纪轻轻肩负重任，正依赖两位兄长安定国家，即便他们图谋我，我也视死如归，终究不忍心有这样的想法。你别再说了！”
后来吕纂在湛露堂拜见吕绍，吕超持刀侍立在旁，用眼神示意吕绍下令逮捕吕纂，吕绍没有答应。吕超是吕光弟弟吕宝的儿子。
吕弘暗中派遣尚书姜纪对吕纂说：“君主昏庸懦弱，无法承受多灾多难的局面。兄长您威望和恩德向来显着，应当为国家着想，不能拘泥于小节。”吕纂于是在夜里率领几百名壮士翻越北城，进攻广夏门；吕弘则率领东苑的部众用斧头劈开洪范门。
左卫将军齐从驻守融明观，迎面喝问：“是谁？”众人回答：“是太原公。”齐从说：“国家有大丧事，君主刚即位，太原公不按正道行事，夜里闯入禁城，是要作乱吗？”说着抽出剑径直冲向吕纂，砍中吕纂的额头，吕纂的手下将齐从擒获。吕纂说：“他是义士，别杀他！”
吕绍派遣虎贲中郎将吕开率领禁兵在端门抵抗，吕超也率领两千士兵赶来支援；但士兵们一向畏惧吕纂，全都不战而溃。吕纂从青角门进入宫中，登上谦光殿。吕绍登上紫阁自杀，吕超逃奔广武。
吕纂忌惮吕弘兵力强盛，要把王位让给吕弘。吕弘说：“我作为吕绍的弟弟，如果继承王位，众人不会心服，所以才违背先帝遗命废黜他，我已愧对九泉之下的先帝！如今再越过兄长继位，难道是我的本意吗！”吕纂于是让吕弘出宫告诉众人：“先帝临终时，曾下诏让我继位。”群臣都说：“只要国家有君主，谁敢违抗！”
吕纂于是即位为天王，宣布大赦，改年号为咸宁，追谥吕光为懿武皇帝，庙号太祖；追谥吕绍为隐王。他任命吕弘为大都督、督中外诸军事、大司马、车骑大将军、司隶校尉、录尚书事，改封吕弘为番禾郡公。
吕纂对被擒的齐从说：“你之前砍我，下手真重啊！”齐从哭着说：“隐王是先帝所立的君主；陛下虽然顺应天命民心，但我当时没明白您的心意，只担心陛下不死，怎能说下手重呢！”吕纂赏识他的忠诚，善待了他。
吕纂的叔父、征东将军吕方镇守广武，吕纂派遣使者对吕方说：“吕超确实是忠臣，忠义勇敢值得称赞，只是不懂国家大局和灵活变通的道理。现在正需要他效力，来平定国家危难，你可以把我的意思告诉他。”吕超上疏认错，吕纂恢复了他的爵位。
这一年，后燕君主慕容盛任命河间公慕容熙为都督中外诸军事、尚书左仆射，兼任中领军。
前秦刘卫辰的儿子刘文陈投降北魏，北魏君主拓跋珪把同宗的女子嫁给他，任命他为上将军，并赐他姓宿。
公元400年
春季，正月壬子朔日（初一），后燕君主慕容盛宣布大赦，将自己的帝号贬为“庶人天王”。
北魏材官将军和跋在辽西袭击卢溥，戊午日（初七）攻克辽西，擒获卢溥及其儿子卢焕，押送至平城，将二人车裂处死。后燕君主慕容盛派遣广威将军孟广平救援卢溥，未能赶上，于是斩杀北魏辽西地方官员后返回。
乙亥日（二十四日），东晋宣布大赦。
西秦王乞伏乾归将都城迁到苑川。
南凉武威王秃发利鹿孤宣布大赦，改年号为建和。
高句丽国王高安对待后燕的礼节轻慢；二月丙申日（十五日），后燕君主慕容盛亲自率领三万士兵袭击高句丽，任命骠骑大将军慕容熙为前锋，攻克新城、南苏两座城池，开拓疆域七百多里，迁徙五千多户人口后返回。慕容熙的勇猛在众将中居首，慕容盛说：“叔父英勇果敢，有世祖（慕容垂）的风范，只是宏大的谋略稍逊一筹！”
当初，北魏君主拓跋珪娶了刘头眷的女儿，此女在后宫中最受宠爱，生下儿子拓跋嗣。等到攻克中山，拓跋珪又俘获后燕君主慕容宝的小女儿。他准备立皇后时，依照北魏旧制，通过铸造金人来占卜吉凶：刘氏铸造的金人没有成功，慕容氏铸造的金人成功了。三月戊午日（初八），拓跋珪立慕容氏为皇后。
此时，桓玄攻克荆州、雍州后，上奏请求兼任荆州、江州刺史。东晋朝廷下诏任命桓玄为都督荆、司、雍、秦、梁、益、宁七州诸军事、荆州刺史，任命中护军桓修为江州刺史。桓玄上疏坚决请求兼任江州刺史，朝廷于是加授他都督八州及扬州、豫州八部诸军事，同时兼任江州刺史。桓玄擅自任命哥哥桓伟为雍州刺史，朝廷无法反对；又任命侄子桓振为淮南太守。
后凉王吕纂因大司马吕弘功劳高、地位逼近自己，对他心怀忌惮；吕弘也疑心自己会遭迫害，于是率领东苑的士兵发动叛乱，进攻吕纂。吕纂派遣将领焦辨迎击，吕弘的部众溃败，吕弘逃走。吕纂放纵士兵大肆抢掠，把东苑的妇女全部赏赐给士兵，吕弘的妻子儿女也在其中。吕纂笑着对群臣说：“今日这场战事打得怎么样？”侍中房晷回答：“上天降祸给后凉，忧患接连不断。先帝刚去世，隐王（吕绍）就被废黜；先帝的陵墓葬礼刚结束，大司马（吕弘）就起兵叛乱；京城血流成河，兄弟间刀兵相向。虽然吕弘自取灭亡，但也是陛下没有兄弟恩情所致，陛下应当反省自责，向百姓谢罪。如今反而放纵士兵抢掠，囚禁侮辱士人妇女——祸乱虽由吕弘挑起，但百姓有何罪过！况且吕弘的妻子是陛下的弟媳，吕弘的女儿是陛下的侄女，怎能让无赖小人把她们当作婢妾侮辱！天地神明，难道能容忍这种事吗！”说完就抽噎流泪。吕纂脸色变得庄重，向房晷道歉，把吕弘的妻子儿女接到东宫，优厚安抚。
吕弘准备逃奔秃发利鹿孤，路过广武时，去拜见吕方（吕纂叔父）。吕方见到他，大哭道：“天下如此宽广，你为何落到这般地步！”于是将吕弘逮捕入狱，吕纂派遣力士康龙前往广武，将吕弘拉杀（拉拽致死）。
吕纂立妃子杨氏为皇后，任命皇后的父亲杨桓为尚书左仆射、凉都尹。
辛卯日（二十一日），后燕襄平县令段登等人图谋反叛，被诛杀。
后凉王吕纂准备讨伐南凉武威王秃发利鹿孤，中书令杨颖劝谏：“秃发利鹿孤上下齐心、令行禁止，南凉没有可乘之机，不能讨伐。”吕纂不听。秃发利鹿孤派遣弟弟秃发傉檀抵御，夏季四月，秃发傉檀在三堆击败后凉军队，斩杀两千多人。
当初，陇西人李暠喜好文学，有好名声。他曾与郭黁及同母弟敦煌人宋繇同住，郭黁起身对宋繇说：“您终将位居人臣之首，李君最终会拥有国家；母马生下额头带白毛的小马时，就是应验之时。”等到孟敏担任沙州刺史，任命李暠为效谷县令；宋繇侍奉北凉王段业，任中散常侍。孟敏去世后，敦煌护军冯翊人郭谦、沙州治中敦煌人索仙等人因李暠温和坚毅、施政惠民，推举他为敦煌太守。李暠起初推辞，恰逢宋繇从张掖请假回家，对李暠说：“段王没有长远谋略，最终必定一事无成。兄长难道忘了郭黁的话吗？额头带白毛的小马如今已经出生了。”李暠于是接受推举，派遣使者向段业请求任命；段业随即任命李暠为敦煌太守。
北凉右卫将军敦煌人索嗣对段业说：“不能让李暠驻守敦煌。”段业于是任命索嗣接替李暠为敦煌太守，派索嗣率领五百名骑兵前往赴任。索嗣抵达距离敦煌二十里的地方，派人送信给李暠，让他前来迎接自己；李暠既惊讶又疑惑，准备出城迎接。效谷县令张邈和宋繇阻止他说：“段王昏庸懦弱，现在正是英雄豪杰建功立业的时机！将军占据敦煌这一现成的基业，怎能拱手让人！索嗣自恃是本郡人，认为百姓会归附他，没想到将军能突然抵抗他，只需一战就能擒获他。”李暠听从了他们的建议，先派宋繇去见索嗣，用甜言蜜语迷惑他。宋繇返回后，对李暠说：“索嗣志向骄纵、兵力薄弱，容易攻取。”李暠于是派遣张邈、宋繇以及自己的两个儿子李歆、李让迎击索嗣，索嗣战败逃走，返回张掖。李暠一向与索嗣交好，因此更加怨恨他，上疏段业请求诛杀索嗣。沮渠男成也厌恶索嗣，劝说段业除掉他；段业于是杀死索嗣，派遣使者向李暠道歉，晋升李暠为都督凉兴以西诸军事、镇西将军。
此时，吐谷浑王视罴去世，世子树洛干年仅九岁，弟弟乌纥堤继位。乌纥堤娶了树洛干的母亲念氏，念氏生下慕璝、慕延。乌纥堤懦弱荒淫，无法治理国家；念氏独自掌管国家事务，有胆识有智谋，国人都畏惧服从她。
后燕前将军段玑是太后段氏的侄子，因受段登叛乱案牵连，五月壬子日（初三）逃奔辽西。
丙寅日（十七日），东晋卫将军、东亭献侯王珣去世。
己巳日（二十日），北魏君主拓跋珪向东前往涿鹿，向西前往马邑，视察灅水源头。
戊寅日（二十九日），后燕段玑返回龙城请罪；后燕君主慕容盛赦免了他，赐号“思悔侯”，让他娶公主为妻，允许他在宫中任职。
谢琰凭借资历声望镇守会稽，既不能安抚百姓，又不整顿军备。众将都劝谏他：“孙恩的贼寇就在海边，伺机而动，应当给他们一条悔过自新的道路。”谢琰不听，说：“苻坚的百万大军，尚且在淮南送死；孙恩这小贼，战败后逃入海中，怎能再出来！如果他真的敢出来，就是上天要杀他。”不久，孙恩侵犯浃口，攻入余姚，攻破上虞，进军到邢浦。谢琰派遣参军刘宣之击败孙恩，孙恩退走。几天后，孙恩再次侵犯邢浦，官军战败，孙恩乘胜进军。己卯日（三十日），孙恩抵达会稽。谢琰还没吃饭，说：“必须先消灭这伙贼寇再吃饭。”于是跨马出战，军队战败，谢琰被帐下都督张猛杀死。吴兴太守庾桓担心郡中百姓再次响应孙恩，便杀死几千名男女。孙恩转而侵犯临海，东晋朝廷大为震动，派遣冠军将军桓不才、辅国将军孙无终、宁朔将军高雅之率军抵御。
后秦征西大将军陇西公姚硕德率领五千士兵讨伐西秦，从南安峡进入西秦境内。西秦王乞伏乾归率领众将抵御，在陇西驻军。
杨轨、田玄明图谋杀害南凉武威王秃发利鹿孤，被秃发利鹿孤杀死。
六月庚辰朔日（初一），发生日食。
东晋任命琅邪王师何澄为尚书左仆射。何澄是何准的儿子。
甲子日（二十五日），后燕宣布大赦。
后凉王吕纂准备袭击北凉，姜纪劝谏：“盛夏时节农事正繁忙，应当暂且停战。如今远征岭西，秃发氏（南凉）会乘虚袭击京城，该如何应对！”吕纂不听，进军包围张掖，向西攻掠建康。秃发傉檀听说后，率领一万骑兵袭击后凉都城姑臧，吕纂的弟弟陇西公吕纬据守北城自保。秃发傉檀在朱明门上设宴，敲响钟鼓，犒劳将士，在青阳门炫耀兵力，抢掠八千多户人口后离去。吕纂听说后，率军返回姑臧。
秋季七月壬子日（初四），东晋太皇太后李氏去世。
丁卯日（十九日），东晋宣布大赦。
西秦王乞伏乾归派遣武卫将军慕兀等人驻守，切断了后秦军队的砍柴取水之路；后秦君主姚兴暗中领兵救援姚硕德。乞伏乾归听说后，派遣慕兀率领两万中军驻守柏杨，镇军将军罗敦率领四万外军驻守侯辰谷，自己率领几千名轻骑兵前去侦察前秦军队动向。恰逢大风突起、雾气弥漫，乞伏乾归与中军失去联系，被后秦追击的骑兵逼迫，逃入外军阵营。第二天，与后秦军队交战，西秦军大败，乞伏乾归逃回苑川，他的三万六千名部众全部投降后秦。姚兴进军到枹罕。
乞伏乾归逃奔金城，对各部首领说：“我没有才能，窃取王位已超过十二年，如今战败溃散到这种地步，无法抵御敌军，打算向西退守允吾。如果全军撤离，必定无法逃脱；你们留在这儿，各自率领部众投降后秦，以此来保全宗族，不要跟随我。”众首领都说：“无论生死，我们都愿跟随陛下。”乞伏乾归说：“我如今要去寄人篱下，如果上天不亡我，或许将来能收复旧业，再与你们相见。现在跟随我只会一同送死，没有益处。”于是大哭着与众人分别，独自率领几百名骑兵逃奔允吾，向南凉武威王秃发利鹿孤请求投降。秃发利鹿孤派遣广武公秃发傉檀迎接他，将他安置在晋兴，用贵宾之礼对待他。
南凉镇北将军秃发俱延对秃发利鹿孤说：“乞伏乾归原本是我们的属国，趁乱自立为王，如今势穷来归附，并非真心归顺。如果他逃归姚氏，必定会成为我国祸患，不如把他迁移到乙弗部之间，让他无法离开。”秃发利鹿孤说：“他走投无路来归附我，却反而怀疑他的心意，怎能劝勉后来的归附者！”秃发俱延是秃发利鹿孤的弟弟。
后秦军队撤退后，南羌人梁戈等人暗中招引乞伏乾归，乞伏乾归准备响应。他的大臣屋引阿洛将此事告知晋兴太守阴畅，阴畅迅速报告给秃发利鹿孤，秃发利鹿孤派遣弟弟秃发吐雷率领三千骑兵驻守扪天岭。乞伏乾归担心被秃发利鹿孤杀死，就对太子乞伏炽盘说：“我们父子留在这里，必定不会被秃发利鹿孤容忍。如今姚氏正强盛，我准备归降他们。如果全家一同前往，必定会被追击的骑兵赶上，我把你们兄弟和你们的母亲留下作为人质，秃发利鹿孤必定不会怀疑，我在长安，他终究不敢伤害你们。”于是将乞伏炽盘等人送到西平。八月，乞伏乾归向南逃奔枹罕，向姚兴投降。
丁亥日（初九），东晋尚书左仆射王雅去世。
九月癸丑日（初六），发生地震。
后凉吕方投降后秦，广武地区三千多户百姓逃奔南凉武威王秃发利鹿孤。
冬季十一月，高雅之与孙恩在余姚交战，高雅之战败，逃到山阴，士兵死亡十分之七八。东晋朝廷下诏任命刘牢之为都督会稽等五郡诸军事，率领部众攻打孙恩，孙恩逃入海中。刘牢之向东驻守上虞，派刘裕戍守句章。吴国内史袁崧修筑沪渎垒，以防备孙恩。袁崧是袁乔的孙子。
会稽王世子司马元显请求兼任徐州刺史，东晋朝廷下诏任命司马元显为开府仪同三司、都督扬、豫、徐、兖、青、幽、冀、并、荆、江、司、雍、梁、益、交、广十六州诸军事、领徐州刺史，封他的儿子司马彦玮为东海王。
乞伏乾归抵达长安，后秦君主姚兴任命他为都督河南诸军事、河州刺史、归义侯。
过了很久，乞伏炽盘想逃到长安投奔父亲乞伏乾归，被南凉武威王秃发利鹿孤追上擒获。秃发利鹿孤准备杀死乞伏炽盘，广武公秃发傉檀说：“儿子投奔父亲，不值得严惩，应当宽恕他以显示我们的大度。”秃发利鹿孤听从了他的建议。
后秦君主姚兴遣返二百多名东晋将领（如刘嵩等人），让他们回归东晋。
北凉晋昌太守唐瑶反叛，向六郡发布檄文，推举李暠为冠军大将军、沙州刺史、凉公、领敦煌太守。李暠在境内宣布大赦，改年号为庚子。任命唐瑶为征东将军，郭谦为军谘祭酒，索仙为左长史，张邈为右长史，尹建兴为左司马，张体顺为右司马。派遣从事中郎宋繇向东讨伐凉兴，同时进攻玉门以西各城，全部攻克。
北凉酒泉太守王德也反叛，自称河州刺史。北凉王段业派沮渠蒙逊讨伐他。王德烧毁城池，率领部众逃奔唐瑶，沮渠蒙逊追到沙头，大败王德，俘获他的妻子儿女和部落民众后返回。
十二月戊寅日（初二），天津星旁出现彗星。会稽王世子司马元显因星象异常，请求解除录尚书事职务，朝廷又加授他为尚书令。吏部尚书车胤因司马元显骄横放纵，禀报会稽王司马道子，请求约束抑制他。司马元显听说后，未查明详情，就向司马道子问道：“车武子（车胤字武子）屏退众人，跟您说了什么？”司马道子不回答，司马元显坚持追问，司马道子愤怒地说：“你想把我软禁起来，不让我和朝中大臣说话吗！”司马元显出宫后，对亲信说：“车胤离间我们父子。”暗中派人指责车胤，车胤畏惧，自杀身亡。
壬辰日（十六日），后燕君主慕容盛设立燕台，统管各部落的夷族事务。
北魏太史多次上奏说天文现象混乱。北魏君主拓跋珪亲自阅览占卜书籍，书中多称“改朝换代、变更政令”，于是下诏告诫群臣，称帝王传承正统都有天命，不可妄自干预。他又多次变更官名，想以此压制灾异。仪曹郎董谧献上《服饵仙经》，拓跋珪设置仙人博士，建立仙坊，炼制各种丹药，封禁西山作为采药伐木的场所。丹药炼成后，让死罪囚犯试服，大多囚犯死亡，丹药并无效果，但拓跋珪仍相信炼丹之事，不断寻访求购仙药。
拓跋珪常认为后燕君主慕容垂让儿子们分别占据要害职位，导致权力下移，最终败亡，因此深以为戒。博士公孙表迎合他的心意，献上《韩非子》，劝说拓跋珪用严刑峻法驾驭臣下。左将军李粟性情傲慢，常常在拓跋珪面前举止随意、不恭敬，咳嗽吐痰也不加克制；拓跋珪累积他以往的过错，将他诛杀，群臣都震惊恐惧。
丁酉日（二十一日），后燕君主慕容盛尊奉献庄后丁氏为皇太后，立辽西公慕容定为皇太子，宣布大赦。
这一年，南燕王慕容德在广固即位为皇帝，宣布大赦，改年号为建平。慕容德改名为慕容备德，想让官吏百姓更容易避讳。追谥后燕君主慕容暐为幽皇帝，任命北地王慕容钟为司徒，慕舆拔为司空，封孚为左仆射，慕舆护为右仆射，立妃子段氏为皇后。