后燕任命河间公慕容熙为侍中、车骑大将军、中领军、司隶校尉，任命城阳公慕容元为卫将军。慕容元是慕容宝的儿子。又任命刘忠为左将军，张豪为后将军，还赐他们姓慕容氏（赐姓是当时的重要恩宠）。任命李旱为中常侍、辅国将军，卫双为前将军，张顺为镇西将军、昌黎尹，张真为右将军；这些人都被封为公爵。
乙亥日，后燕步兵校尉马勤等人发动谋反，被处死；此事牵连到骠骑将军高阳公慕容崇、慕容崇的弟弟东平公慕容澄，两人都被赐死。
东晋宁朔将军邓启方、南阳太守闾丘羡率领两万士兵进攻南燕，在管城与南燕中军将军慕容法、抚军将军慕容和的军队交战，邓启方等人兵败，只有他一人骑马逃走，得以幸免。
魏王拓跋珪命令有关部门划定都城周围的疆域，标注道路里程，统一重量单位（权衡），审定长度、容量单位（度量）；还派遣使者巡视各个郡国，举报上奏不守法度的地方长官，拓跋珪亲自考察，决定他们的罢免或升迁。
九月，辛卯日，朝廷授予会稽王司马道子黄钺（古代帝王或重臣持黄钺，象征掌握生杀大权），任命世子司马元显为征讨都督，派卫将军王珣、右将军谢琰领兵讨伐王恭，派谯王司马尚之领兵讨伐庾楷。
乙未日，后燕任命东阳公慕容根为尚书令，张通为尚书左仆射，卫伦为尚书右仆射，慕容豪为幽州刺史，镇守肥如（今河北迁安附近）。
己亥日，谯王司马尚之在牛渚（今安徽马鞍山采石矶，长江要隘）大败庾楷，庾楷独自骑马逃往桓玄那里。会稽王司马道子任命司马尚之为豫州刺史，任命他的弟弟司马恢之为骠骑司马、丹杨尹，司马允之为吴国内史，司马休之为襄城太守，让他们各自统领兵马，作为自己的外援。
乙巳日，桓玄在白石（今安徽马鞍山附近）大败朝廷军队。随后桓玄和杨佺期进军到横江（今安徽和县附近，长江渡口，与牛渚隔江相对），司马尚之率军后退逃走，司马恢之所率领的水军全军覆没。
丙午日，司马道子驻扎在中堂（建康城内重要建筑，常用于集会、驻军），司马元显防守石头城（建康军事要塞）；己酉日，王珣防守北郊，谢琰驻扎在宣阳门（建康城南正门），各自防备桓玄等人的进攻。
王恭向来凭借自己的才能和门第轻视别人，处死王国宝后，更觉得自己的威势无人敢违抗。他把刘牢之当作心腹，但只把他当作普通的部曲将领对待（没给予相应的礼遇和地位），刘牢之自负有才能，对此深感耻辱和怨恨。司马元显知道这件事后，派庐江太守高素去劝说刘牢之，让他背叛王恭，许诺事成之后就把王恭的官职爵位都授予他；还把司马道子的亲笔信送给刘牢之，向他陈述背叛王恭的利弊。
刘牢之对儿子刘敬宣说：“王恭从前蒙受先帝的大恩，现在又是皇帝的舅舅，却不能辅佐王室，反而屡次领兵进攻京城，我没法判断他的真实志向——就算他这次起兵成功，将来一定能屈居在天子和相王（司马道子）之下吗？我想凭借国家的威势，以顺应朝廷的名义讨伐叛逆，你觉得怎么样？”刘敬宣说：“朝廷虽然没有周成王、周康王那样的盛世，也没有周幽王、周厉王那样的暴政；但王恭依仗手中的兵权，轻视、冒犯王室。您和他既没有骨肉亲情，也没有君臣之义，就算一起共事过一段时间，彼此心意也不合，现在讨伐他，在情义上有什么不妥呢！”
王恭的参军（官职）何澹之知道了刘牢之的谋划，就把这事告诉了王恭。王恭因为何澹之向来和刘牢之有矛盾，就不相信他的话。反而设宴邀请刘牢之，在众人面前拜刘牢之为兄长，把精锐的士兵、坚固的铠甲都交给刘牢之，让他率领帐下督（官职）颜延担任前锋。刘牢之率军抵达竹里（今江苏南京附近，通往建康的要道），斩杀颜延，向朝廷投降；还派刘敬宣和自己的女婿东莞太守高雅之返回，袭击王恭。
当时王恭正在出城检阅军队，刘敬宣率领骑兵从侧面突袭，王恭的士兵瞬间溃散。王恭想退回城中，高雅之已经关闭了城门。王恭独自骑马逃往曲阿（今江苏丹阳），他向来不擅长骑马，大腿都磨出了疮。曲阿人殷确是王恭过去的部下，用船载着王恭，准备逃往桓玄那里；到了长塘湖（今江苏常州附近），被人告发，王恭被抓获，押送到京城，在倪塘（今江苏南京附近）被斩首。
王恭临刑前，还在整理自己的胡须鬓发，神色镇定自如，对执行死刑的人说：“我错在轻信他人，才落到今天这个地步，但推究我的本心，难道不是忠于国家社稷吗！只希望百年之后，还有人知道有我王恭这个人。”王恭的子弟和党羽也都被处死。朝廷任命刘牢之为都督兖、豫、冀、幽、并、徐、扬州、晋陵诸军事（管辖多地军事），接替王恭的职位。
不久后，杨佺期、桓玄率军抵达石头城，殷仲堪率军抵达芜湖。司马元显从竹里快马返回京城，派丹杨尹王恺等人征发京城的士人百姓几万人，驻守石头城，抵抗杨佺期等人。杨佺期、桓玄等人上奏朝廷，为王恭辩冤，请求处死刘牢之。刘牢之率领北府军（东晋精锐军队，主力为北方流民）快马赶赴京城，驻扎在新亭（今江苏南京附近，军事要地）。杨佺期、桓玄看到北府军，大惊失色，率军退回蔡洲（今江苏南京西南长江中岛屿）。
朝廷不知道西边（指殷仲堪、桓玄等人）军队的虚实，而殷仲堪等人率领几万士兵，遍布京城郊外，朝廷内外都被逼迫，陷入忧虑之中。
左卫将军桓修是桓冲的儿子，他对司马道子说：“西边的军队是可以通过劝说解散的，我知道他们的内情。殷仲堪、桓玄等人之所以敢起兵，全是依靠王恭，现在王恭已经被消灭，西边的军队肯定士气低落、心怀恐惧。现在要是用丰厚的利益拉拢桓玄和杨佺期，两人一定会心中欢喜；桓玄能牵制殷仲堪，杨佺期也能被劝说倒戈，进而除掉殷仲堪。”司马道子采纳了桓修的建议，任命桓玄为江州刺史；征召郗恢回朝廷担任尚书，任命杨佺期接替郗恢，担任都督梁、雍、秦三州诸军事、雍州刺史；任命桓修为荆州刺史，暂时统领左卫将军府的文武官员，前往荆州镇守，还命令刘牢之率领一千士兵护送他；把殷仲堪贬为广州刺史，派殷仲堪的叔父、太常（官职，掌管礼仪祭祀）殷茂宣读诏书，命令殷仲堪率军撤回。
张骧的儿子张超收拢了三千多户人家，占据南皮（今河北沧州南皮区），自称乌桓王，劫掠周边各郡。魏王拓跋珪命令庾岳率军讨伐他。
杨轨驻扎在廉川（今青海乐都附近），招集夷人、汉人，部众达到一万多人。王乞基对杨轨说：“秃发氏（指秃发乌孤）才能出众且兵力强盛，况且他原本就是我的君主，不如归降他。”杨轨于是派遣使者，向西平王秃发乌孤投降。不久后，杨轨被羌人首领梁饥打败，向西逃到??海（今青海湖附近），袭击乙弗鲜卑部落，占据了他们的地盘。
秃发乌孤对大臣们说：“杨轨、王乞基真心归降我，你们却不赶紧出兵救援，让他们被羌人击败，我对此深感愧疚。”平西将军浑屯说：“梁饥没有长远的谋略，一次交战就能活捉他。”
梁饥率军进攻西平郡（今青海西宁附近），西平人田玄明抓住太守郭幸，自己取而代之，率军抵抗梁饥，还派儿子到秃发乌孤那里做人质，请求救援。秃发乌孤想出兵救援，大臣们忌惮梁饥兵力强盛，大多对此犹豫不决。左司马赵振说：“杨轨刚刚战败，吕氏（后凉）势力正强，洪池岭以北的地区，我们暂时不能指望夺取。但岭南（洪池岭以南）的五个郡，或许可以拿下。大王如果没有开拓疆域的志向，我就不敢多说；如果想治理天下，这个机会不能错过。要是让羌人占领西平，汉人、夷人都会震动，这对我们不利啊。”
秃发乌孤高兴地说：“我也想趁机建立功业，怎么能困在偏远山谷里死守呢！”于是对大臣们说：“梁饥要是占领西平，凭借山河险阻据守，我们就再也控制不了他了。梁饥虽然勇猛，但军队纪律混乱，很容易打败。”随后率军进攻梁饥，大败梁饥的军队。梁饥后退，驻扎在龙支堡（今青海民和附近）。秃发乌孤继续进军，攻破龙支堡，梁饥独自骑马逃往浇河郡（今青海贵德附近）。此战中，秃发乌孤的军队俘虏、斩杀敌军几万人，他任命田玄明为四平内史。乐都太守田瑶、湟河太守张裯、浇河太守王稚，都率领本郡投降；岭南地区几万部落的羌人、胡人，也都归附了秃发乌孤。
西秦王乞伏乾归派遣秦州牧乞伏益州、武卫将军慕兀、冠军将军翟瑁，率领两万骑兵讨伐吐谷浑。
冬季，十月，癸酉日，后燕大臣们再次请求长乐王慕容盛登基称帝；丙子日，慕容盛正式即位，大赦天下，尊奉皇后段氏为皇太后，尊奉太妃丁氏为献庄皇后。当初，兰汗执掌朝政时，慕容盛跟随后燕君主慕容宝出逃，兰汗的女儿（慕容盛的妻子）侍奉丁氏更加恭敬。等到兰汗被处死，慕容盛认为兰妃应当受牵连治罪，想杀死她；丁氏因为兰妃曾有保全自己的功劳，坚决为她求情，兰妃才得以幸免，但最终没能被立为皇后。
东晋朝廷大赦天下。
殷仲堪收到朝廷贬他为广州刺史的诏书后，勃然大怒，催促桓玄、杨佺期进军京城。桓玄等人对朝廷授予自己的官职（桓玄为江州刺史、杨佺期为雍州刺史）感到满意，想接受任命，却又犹豫不决。殷仲堪听说后，立刻从芜湖向南返回荆州，还派使者告知蔡洲的士兵：“你们要是不各自解散回家，等我回到江陵，就把你们留在荆州的家人全都处死。”杨佺期的部将刘系率领两千士兵，率先撤回荆州。桓玄等人十分害怕，慌忙向西撤退，追到寻阳（今江西九江），才赶上殷仲堪。
殷仲堪已经失去了荆州刺史的职位，只能依靠桓玄等人作为外援；桓玄等人也需要借助殷仲堪的兵力，两人虽然内心互相猜忌隔绝，但形势逼迫，不得不联合。于是他们互相交换子弟做人质，壬午日，在寻阳结盟，都不接受朝廷的任命，还联合署名上奏，为王恭辩冤，请求处死刘牢之和谯王司马尚之，同时申诉殷仲堪没有罪过，却唯独被降职罢免。朝廷对他们十分忌惮，内外一片混乱。于是朝廷只好又罢免桓修的荆州刺史职位，把荆州还给殷仲堪，还下了措辞优厚的诏书安抚他，以求和解，殷仲堪等人才接受了诏书。御史中丞江绩上奏弹劾桓修，说他只考虑自身利益，误导朝廷，朝廷下诏罢免了桓修的官职。
当初，桓玄在荆州时，行为放纵蛮横。殷仲堪的亲信都劝他杀死桓玄，殷仲堪没有听从。等到在寻阳结盟时，殷仲堪凭借桓玄的声望和门第，推举他为盟主，桓玄从此更加傲慢自大。杨佺期性格骄横强悍，桓玄却常常把他当作出身低微的人对待，压制他的气焰。杨佺期对此怨恨不已，暗中劝说殷仲堪，认为桓玄终究会成为祸患，请求在结盟的祭坛上袭击桓玄。殷仲堪忌惮杨佺期兄弟勇猛健壮，担心杀死桓玄后，无法控制杨佺期，就极力阻止了他。之后，几人各自返回自己的镇守之地。桓玄也知道杨佺期的谋划，暗中有除掉杨佺期的打算，于是率军驻扎在夏口（今湖北武汉附近），征召始安太守、济阴人卞范之担任长史，把他当作主要谋士。当时，朝廷的诏书中唯独没有赦免庾楷，桓玄就任命庾楷为武昌太守。
起初，郗恢为朝廷抵抗西边（殷仲堪、桓玄）的军队，桓玄还没得到江州时，想夺取郗恢的雍州，改任郗恢为广州刺史。郗恢听说后，十分害怕，向手下人询问对策，众人都说：“如果是杨佺期来接替您，我们谁不会尽力抵抗；但要是桓玄来，恐怕很难和他对抗。”不久后，郗恢听说接替自己的是杨佺期，就和闾丘羡谋划起兵抵抗。杨佺期得知后，故意宣称桓玄要率军进入沔水（汉江），让自己担任前锋。郗恢的部众相信了这话，听到消息就四散溃逃，郗恢只好请求投降。杨佺期进入雍州府衙，斩杀闾丘羡，放郗恢返回京城；郗恢走到杨口（今湖北潜江附近）时，殷仲堪暗中派人杀死了他和他的四个儿子，对外谎称是被蛮族部落杀死的。
西秦乞伏益州和吐谷浑王视罴在度周川（今甘肃岷县附近）交战，视罴大败，逃到白兰山（今青海玉树附近）据守，派儿子宕岂到西秦做人质，请求和解。西秦王乞伏乾归把宗室女子嫁给宕岂，同意了和解。
后凉建武将军李鸾率领兴城（今青海民和附近）军民，向秃发乌孤投降。
十一月，东晋朝廷任命琅邪王司马德文为卫将军、开府仪同三司（古代高级官职，享受与三公同等的待遇），任命征虏将军司马元显为中领军，任命领军将军王雅为尚书左仆射。
辛亥日，魏王拓跋珪命令尚书吏部郎邓渊制定官制，协调音律；命令仪曹郎、清河人董谧制定礼仪；命令三公郎王德制定法令；命令太史令晁崇观测天象；由吏部尚书崔宏总领各项事务，进行裁定，作为永久的制度。邓渊是邓羌的孙子。
杨轨、王乞基率领几千户人家，主动归附西平王秃发乌孤。
十二月，己丑日，魏王拓跋珪正式即位为皇帝，大赦天下，改年号为天兴。他命令朝廷内外官员百姓都束起头发，戴上帽子（改变过去的鲜卑习俗）；追尊远祖拓跋毛以下二十七代祖先都为皇帝；追谥六世祖拓跋力微为神元皇帝，庙号始祖；追谥祖父拓跋什翼犍为昭成皇帝，庙号高祖；追谥父亲拓跋寔为献神明皇帝。
魏国过去的习俗是：初夏时节祭祀上天和东庙，仲夏时节率领部众到阴山祈求消除霜灾，初秋时节在西郊祭祀上天。到这时，拓跋珪开始依照古代制度，确定祭祀天地、宗庙以及朝会宴饮的礼仪音乐，但只有初夏祭祀上天是他亲自举行，其余的祭祀大多由有关部门代为执行。他还采纳崔宏的建议，自称是黄帝的后代，以土德称王（古代王朝更替的“五德终始说”）。
拓跋珪迁徙六个州、二十二个郡的地方长官和豪杰之士两千户到代都（今山西大同）；划定疆域：东边到代郡，西边到善无（今山西右玉附近），南边到阴馆（今山西代县附近），北边到参合（今内蒙古凉城附近），这一区域都作为都城周围的畿内之地；畿外的四方（东、南、西、北）和四维（东南、东北、西南、西北），设置八部师，负责监督当地事务。
己亥日，后燕幽州刺史慕容豪、尚书左仆射张通、昌黎尹张顺，因谋反罪被处死。
起初，琅邪人孙泰在钱塘人杜子恭那里学习妖术，士人百姓大多信奉他。王珣厌恶孙泰，就把他流放到广州。王雅向晋孝武帝推荐孙泰，说他懂得养生之道，孝武帝把孙泰召回京城，孙泰逐步升迁，最终担任新安太守。孙泰知道东晋的国运将要终结，借着王恭叛乱的机会，以讨伐王恭为名，收拢士兵，聚集了巨额财物，三吴地区（今江苏、浙江、安徽一带）很多人都追随他。
有见识的人都担心孙泰会发动叛乱，但因为中领军司马元显和他关系要好，没人敢揭发。会稽内史谢輶发现了孙泰的谋反计划，己酉日，会稽王司马道子让司马元显引诱孙泰前来，将他斩杀，还处死了他的六个儿子。孙泰哥哥的儿子孙恩逃到海上，愚昧的百姓还认为孙泰是像蝉蜕壳一样脱胎不死，纷纷到海上资助孙恩。孙恩于是聚集逃亡的人，得到一百多人，谋划为孙泰复仇。
西平王秃发乌孤改称武威王。
这一年，杨盛派遣使者归附魏，魏任命杨盛为仇池王。