林灵溪捏碎传送符后，未如预期抵达预设的炼丹秘境，反而被一股莫名力量牵引，坠落至“陨星古地”——这片曾因上古仙魔大战碎裂的星域残片，地表覆盖着能腐蚀灵力的“星尘锈”，空气中弥漫着若有若无的界渊戾气。她刚稳住身形，便察觉储物袋中的灵髓玉碎片异动，碎片表面浮现出细碎的金色纹路，与古地深处传来的能量波动产生共鸣。
在探查四周时，林灵溪遭遇“陨星蚁”袭击——这种以星尘为食的异兽，体内蕴含微量界渊戾气，寻常术法难以击杀。危急时刻，她想起枉死城主赠予的“冥界幽火”（此前对话中未提及，此处补充为城主暗中附加在传送符上的防护），引幽火灼烧蚁群，却意外发现幽火与灵髓玉碎片的金色纹路相互滋养，碎片光芒更盛。
清理蚁群后，林灵溪在一处坍塌的祭坛遗迹中，发现一缕被困的上古丹师残魂——云松子。残魂感知到灵髓玉碎片的纯净能量，主动现身，告知陨星古地曾是上古“丹道圣坛”，后因界渊戾气侵袭而废弃，自己当年为守护“九转炼心鼎”，魂魄被戾气束缚于此。
云松子提出交易：他愿献出九转炼心鼎的蓝图，助林灵溪完善医鼎炼制之法，但需林灵溪以医道之力净化他魂魄中的戾气，助他入轮回。林灵溪应允，以自身灵力为引，结合灵髓玉碎片的能量，耗时三日为残魂驱散戾气。过程中，她发现界渊戾气竟能与魂魄中的“执念”结合，形成更难清除的“戾念”，这让她意识到净化三界生灵与亡魂的难度远超预期。
云松子消散前，提醒林灵溪尽快离开陨星古地——每百年一次的“星核喷发”即将来临，届时古地深处的界渊戾气会随星核能量涌出，形成“戾气潮”，足以吞噬任何生灵。林灵溪按照蓝图指引，前往古地中心寻找炼制医鼎所需的“星髓砂”，却在途中遭遇另一伙探寻者——“血魂宗”弟子。
血魂宗以吸食亡魂精气修炼，此次前来是为夺取灵髓玉碎片，用于炼制能操控戾气的“血戾幡”。双方爆发冲突，林灵溪虽凭借医道术法压制对方，但血魂宗弟子临死前引爆随身携带的“戾气珠”，提前触发了小规模的戾气潮。为躲避潮涌，林灵溪被迫躲入一处上古丹炉遗迹，却意外发现炉壁上刻有与灵髓玉碎片同源的金色纹路。
躲入丹炉遗迹后，林灵溪发现这竟是上古时期的“混沌炼神炉”，虽已残破，却仍残留着微弱的混沌之气。灵髓玉碎片贴近炉壁时，金色纹路完全激活，与炉壁纹路相连，形成一幅完整的“医鼎炼制图谱”——图谱显示，医鼎需以灵髓玉为核心，融合星髓砂、冥界幽火、天界“月华晶”、人界“生灵之心”四种材料，且炼制过程中需以“医道本源之力”为引，否则医鼎会被界渊戾气反噬。
与此同时，混沌炼神炉传来认主意念，林灵溪以自身医道感悟沟通炉灵，成功将其收服，作为炼制医鼎的基础炉具。认主瞬间，炉灵传递出一段记忆碎片：上古时期，曾有一位“医道圣人”炼制过类似的医鼎，却因中途被“戾魔”偷袭，医鼎碎裂，圣人陨落，灵髓玉碎片也因此散落三界。
离开陨星古地后，林灵溪决定先前往冥界，向枉死城主告知上古医鼎的秘辛，同时补充冥界幽火的储量。抵达枉死城时，却发现城内气氛异常——亡魂数量骤减，守城鬼将神色凝重，城中四处可见被戾气侵蚀的残魂。
找到枉死城主后，林灵溪得知，自她离开后，冥界“枉死渊”（冥界与界渊的连接点）的戾气浓度突然飙升，大量戾气溢出，不仅侵蚀亡魂，还催生了“戾鬼”（被戾气完全控制的亡魂）。更严重的是，血魂宗残余弟子联合冥界的“黑莲教”（信奉戾魔的邪教组织），试图破坏枉死渊的封印，释放更多戾气。
枉死城主虽奋力抵抗，但黑莲教教主持有“戾魔之爪”（戾魔的本命法器），城主节节败退，身受重伤。林灵溪立即以医道术法为城主疗伤，同时以灵髓玉碎片净化城内残留的戾气。疗伤过程中，城主告知林灵溪：月华晶藏在天界“广寒宫”的“月桂树”根部，生灵之心则需在人界“万灵谷”中，从自愿献祭的生灵体内提取（需生灵主动献出一丝本源生命力，无性命之忧）。
为获取月华晶，林灵溪前往天界。抵达南天门时，却被天兵阻拦——天界近期因“月华异常”（月华能量中混入戾气），禁止三界生灵随意出入。林灵溪表明来意，提及上古医鼎与戾魔的威胁，天兵将其带至“凌霄宝殿”，面见玉皇大帝。
玉皇大帝对医鼎之事半信半疑，但广寒宫的月桂树确实出现枯萎迹象，月华能量中的戾气已影响到天界仙娥的修为。为验证林灵溪的说法，玉皇大帝派人陪同她前往广寒宫，面见嫦娥仙子。
抵达广寒宫后，嫦娥仙子告知，月桂树枯萎始于三个月前，当时广寒宫出现过一名神秘黑衣人，试图挖掘月桂树根部的月华晶，被她击退，但黑衣人留下的戾气却附着在月桂树上，导致月华能量被污染。嫦娥仙子怀疑黑衣人是血魂宗或黑莲教的人，但其修为极高，远超普通仙魔。
林灵溪以灵髓玉碎片净化月桂树中的戾气，过程中发现，月桂树根部的月华晶已被黑衣人取走大半，仅剩一小块残留。嫦娥仙子告知，剩余的月华晶虽不足以支撑医鼎的核心需求，但天界“瑶池”的“莲台玉露”可暂时替代月华晶的能量，不过莲台玉露由“王母娘娘”掌管，需得她同意才能取用。
林灵溪与太白金星前往瑶池，面见王母娘娘。王母娘娘提出条件：若想获取莲台玉露，林灵溪需先治愈“瑶池仙草”的“枯萎症”——这种病症是因月华异常导致，仙草叶片发黄，濒临死亡，天界御医束手无策。
林灵溪查看仙草后，发现其病因并非单纯的戾气侵蚀，而是仙草的“本源灵气”与月华能量中的戾气产生了“排斥反应”。她以灵髓玉碎片为媒介，引导自身医道本源之力，将仙草体内的戾气与本源灵气分离，再以少量莲台玉露滋养仙草根系。三日过后，仙草恢复生机，王母娘娘如约赠予莲台玉露，但同时提醒林灵溪：人界万灵谷近期也出现了异常，谷中生灵陷入沉睡，疑似与界渊戾气有关，让她务必小心。
离开天界后，林灵溪前往人界万灵谷。万灵谷是人界生灵的聚居地，谷中草木繁盛，生灵和睦，却在林灵溪抵达时呈现出一片死寂——谷中飞禽走兽全部陷入沉睡，体表覆盖着一层淡淡的灰色戾气，谷内的灵脉也因戾气堵塞而变得微弱。
在谷中心的“万灵树”下，林灵溪遇到了谷主“灵犀婆婆”——一位修炼千年的树精，也是唯一未陷入沉睡的生灵。灵犀婆婆告知，半月前，谷中突然出现一股浓郁的戾气，生灵吸入后便陷入沉睡，她虽以自身修为抵抗，但也只能勉强维持清醒，无法驱散戾气。
林灵溪检查沉睡的生灵，发现它们体内的“生灵之心”（本源生命力的凝聚点）并未受损，只是被戾气包裹，无法与外界能量流通。她尝试以灵髓玉碎片净化生灵体内的戾气，却发现单个生灵的净化速度极慢，而谷中生灵数量庞大，若逐一净化，至少需要数月时间，届时冥界枉死渊的封印可能已被破坏。
灵犀婆婆提出建议：万灵树是谷中灵脉的核心，若能净化万灵树中的戾气，激活灵脉，便可借助灵脉之力同时净化所有生灵体内的戾气。但万灵树的根系已深入地底，与界渊的支流相连，树体内的戾气浓度极高，净化过程中可能会引发界渊支流的反噬。