寒川的科技树经过林牧之的艰难抉择与精心修剪，发展方向趋于明晰，资源分配的矛盾得以暂时缓解。军工、基础研究、民生设施各领域在划定的轨道上稳步推进。然而，一个新的、更为隐性的危机，却随着技术发展的深入而悄然滋生，并因几起看似不大的事件而浮出水面，直指一个关乎创新持续动力的根本性问题。
第一件事，发生在麒麟工业区的一家农具工坊。一位名叫林铁锤的中年匠师，祖传铁匠手艺，在吸收了工造总局推广的标准化理念和新式钢材料后，苦心钻研数年，成功改良了传统的耧车（播种器），设计出一种结构更精巧、下种更均匀、且能调节行距和深度的“匀播耧”。他兴冲冲地制作了几台，效果极佳，附近农户争相借用，交口称赞。然而，好景不长，区内其他几家更大的工坊很快依样画葫芦，大量仿制并售卖，却无人给林铁锤分文报酬，甚至无人提及他的首创之功。林铁锤愤而理论，反被讥讽“天下技艺，本为公用，岂容独占？”林铁锤心灰意冷，自此不再琢磨新物件，手艺也日渐荒疏。
第二件事，涉及药石司下属的一个研究小组。他们受华棠之前研究磺胺的启发，在大量筛选本地草药时，偶然发现一种名为“紫云草”的提取液对某些外伤溃烂有奇效，初步命名为“紫云生肌散”。消息不慎走漏，很快，军医院内和市面上出现了多种成分不明、质量参差不齐的“仿制紫云散”，有的甚至无效有害，败坏了名声，也打击了原研发小组的积极性。
第三件事，则更令人忧心。工造总局一位参与过“银龙术”（炼钢）核心工艺的年轻工匠，因觉待遇不公、晋升无望，竟被萧铁心派来的细作重金诱惑，险些携关键工艺图纸叛逃，幸被皇甫嵩的情报司及时侦破。
这几件事接连报至林牧之案头，令他陷入了深思。他意识到，寒川以往的技术进步，多依赖于禽滑略、华棠等顶尖人才的个人智慧与奉献精神，或是举国体制下的集中攻关。这种模式在初期成效显着，但随着技术体系日益复杂、参与人员越来越多，其弊端凸显：个体发明者的权益得不到保障，创新热情受挫；核心技术易于扩散，难以形成持续优势；甚至可能因内部不公导致人才流失。
“有发明创造者，其心血如得不到珍视，其权益如得不到保护，则创新之源必将枯竭！”林牧之在召见核心重臣时，语气沉重，“长此以往，谁还愿殚精竭虑，推陈出新？若寒川之技，人人可随意仿冒窃取，则我辈辛苦积累之优势，必将如沙上筑塔，顷刻瓦解！”
王玄策深有同感：“确是如此。赏罚不明，则人心不齐。于技艺创新，亦需有激励与保护之策。”
禽滑略从技术角度补充：“许多精巧改进，皆源于一线工匠之日积月累。若其利不被承认，其法不被保护，则此类‘微创新’必将湮灭，于我整体工艺提升，损失巨大。”
苏婉清也从经济角度分析：“若能明确技艺之权属，亦可使其如物产般，进行交易、许可，或能促进技艺流通与优化，繁荣百工。”
经过深入研讨，一个前所未有的概念被提上日程：建立一套保护发明创造、激励技术创新的制度。林牧之将其命名为“专营之利，以奖创制”，简称“专利”制度。其核心是：通过授予发明者在一定期限内独家实施其技术的权利，并给予相应奖励，来保障其利益，激发创新活力。
然而，此议一出，朝野哗然，反对之声甚烈。
“技艺乃天下公器，岂可据为私有？此乃与民争利，违背圣贤之道！”一些儒生出身的文官激烈反对。
“若行此制，大工坊可凭财势垄断技艺，小民何以生存？”部分商会代表表示担忧。
“军工重技，若也专利，如何保障军需？”甚至有将领疑虑。
面对阻力，林牧之力排众议：“非常之功，必待非常之制！ 昔日论功行赏，以首级、战功为凭；今日兴邦之道，当以创制之功为赏！此非私利，乃励公心、强国本之策！”
他定下基调：“专利之制，势在必行！然，需兴利除弊，谨慎施策。”他亲自指导制定了《寒川创制专利律例（试行）》，要点如下：
1. 专利范围：仅限于新颖、实用、非显而易见的技术发明与重大改进（如新机械、新配方、新工艺），基础科学发现与传统技艺不在其列。
2. 申请与审查：发明人需向新成立的“工造专利司”提交详细说明（图纸、配方、制法），由禽滑略、华棠等专家组成的“专利评审会”进行核实与评估，确认其新颖性和实用性后，方可授予。
3. 专利期限：根据不同技术重要性，授予五至十五年不等的独家实施权。期满后，技术归公，天下共用。
4. 权利与义务：专利权人可自营、可转让、可许可他人使用并收取费用。但涉及军国重器或重大公共利益时，官府有权在给予合理补偿后，强制许可实施。