但是，很快美军发现这些暴徒充斥在城市和乡村各个角落，有白人、黑人、印第安人、拉丁人什么样的人都有，到处袭击自己国家的政府军。
在这个时候，后撤的墨西哥人民革命军又出现了，配合这些暴民，歼灭进入这些地区的美军。
接下来，美军除了在个别地方取得进展之外，在大部分地区遭受了巨大损失，当地原有秩序更是无法再恢复。
为了能够理顺这些地区，尽快将墨西哥军队赶出美国，美国政府宣布对美国西南部四个州颁布特赦令，规定只要不是他们通过犯罪而获得的无主财产将得到美国政府的承认。
这个特赦令等于变相承认墨西哥人民革命军在占领区分配财产的法律后果，争取这帮从中获利益的美国人能够放弃敌视政府军。
这个特赦令确实起到了效果，美军收复被占领的城市不再遭到如此大的仇视，那些通过这场变乱的既得利益者甚至会帮助政府军恢复秩序。
1911年12月25日，圣诞节这一天，在美墨边界防御工事修理好了之后，墨西哥人民革命军宣布对美国自卫反击战取得了胜利，为了保持与美国人民的友谊，墨西哥人民革命军将逐步撤回墨西哥境内。
短短四个多月的战乱搅得美国西南部四州发生了翻天覆地的变化，美国损失也相当惨重。在四个月的战斗中，美军竟然伤亡20多万人，其中不少还是美国平民打死打伤的。
如果加上平民伤亡的话，这场动荡共造成美国军民近百万伤亡，美国西南部四个州陷入混乱之后，这四个州成为少数族裔居多，并处于主导的四个州，以后随着来自中南美洲的移民的输入以及国内其他州的移民迁来，这四个州开始出现与美国其他地区迥异的经济文化。
但是此时美国政府受限于选举制度和政党斗争，无法从根源上解决这个问题，可以说美国在这场战争不仅损失了数十亿美元，还被深刻改变。
1912年1月29日，在基本上恢复被占领的四个州秩序之后，美军在美墨边界集结了50万大军，对美墨边境的墨西哥工事发动猛烈进攻。
此时，墨西哥人民革命军早已利用这半年多的时间里面，在墨西哥北部修筑一套完整的防御体系。
而美国这边大部分官兵是临时征召拼凑起来的，那些重炮等重武器还没有生产出来。
所以美军的进攻仿佛手掌拍在刺猬身上，刺猬痛手掌更痛，还痛得鲜血直流。
美军连续在边界进攻了两个多月，不仅毫无进展，还新增了八万多人死伤，而且据美军所知这阶段墨西哥人民革命军伤亡绝对不超过一万人。
越打下去美国越没脾气。
最后，在中华共和国政府的促和之下，1912年4月7日，美利坚合众国政府与墨西哥人民共和国政府签订了《美国与墨西哥边境停战协议》，结束了第二次美墨战争。
这场战争可以说也是墨西哥人民共和国的立国之战，也让拉丁美洲不少国家看到美国貌似强大实为虚弱的事实。