一是维持现状，继续隐瞒身份，用谎言打消毛利兰疑虑。
二是坦白一切，向毛利兰揭示组织真相及Aptx4869秘密。
三是服用临时解药，变回工藤新一现身学园祭，灰原哀自己则用变声器假扮柯南。
江户川柯南选了二，但也要三，他选择恢复工藤新一的身份去向毛利兰坦白一切，哪怕解药副作用未知，药效也不稳定。
灰原哀用看疯子的眼神看着江户川柯南，声音都变得有些尖利了，“你知不知道，如果她知道这一切的话，万一一切败露，她一定会被组织列为灭口对象的！”
江户川柯南苦笑了一下，没有解释，在他发现自己没有瞒住小兰的时候，他就想过这个问题了。
一开始，他和灰原哀的想法一样，以为只要毛利兰不知道那些事情就不会有危险，但随着他和组织接触的增多，知道那个组织的行事手段有多酷烈之后，他才恍然意识到，他的存在本身已经给小兰他们带来足够多的危险了。
在俄罗斯的时候，当他发现小兰躺倒在树下的时候他真的一瞬间双脚都软了，他以为小兰被琴酒杀了。
虽然后来发现是虚惊一场，但他知道，小兰没出事，是因为她遇到的是号称不杀人的伊奈弗，以及那个时候琴酒他们明显有别的任务，不想节外生枝。
他也终于意识到，如果组织想灭口，并不需要确认小兰知道些什么，只需要怀疑就够了，而从他住进毛利侦探事务所的时候，祸根就已经埋下，早已经没有转圜余地了。
在未来的很长一段时间里，只要那个组织没有被端掉，那么在他看不到的地方，小兰就依旧可能和那天晚上一样和组织的人遭遇上，这个时候完全没有防备或者防备不足反而更危险。
江户川柯南看着灰原哀，就像看着以前那个自己，整个人都透着一种自以为是的天真和隐隐的傲慢。
灰原哀面临的情况和他类似。
和灰原哀同住阿笠博士其实也是一样的处境，只要他们两个中的任何一个暴露，另外一个注定逃不掉，同时他们亲近的人，小兰和大叔逃不掉，阿笠博士也逃不掉。
灰原哀认识到了组织的残酷，又没有充分认识到这一点，如他以往那般，似是还觉得，只要不是知情人，就有机会逃脱组织的报复。
他们两个作为被组织迫害追杀的人，有什么资格去揣测对方会不会放过“无辜”的人，难不成要赌一下到时候处理他们的人是不是不杀人的伊奈弗吗？
伊奈弗不杀人，就永远不会杀人吗？伊奈弗不杀人，就没有其他针对他们的手段了吗？他经历了那么多案子，怎么会不知道，有时候死了反而是个解脱。
对这么多隐患视而不见，可不就是天真又傲慢吗。
但他也并不把这个现实在灰原哀面前点破，因为除了平添担忧之外，什么都做不了。
总而言之，他是打定了主意要对毛利兰坦白的。