瞿式耜虽主张与农民军联合，但却是正统优先下的有限联合抗清。
瞿式耜一直以来的核心政治主张以坚守南明正统、以抗清为第一要务、整顿内政固本为核心。
对孙可望大西军的联合态度是支持联合但严守底线，绝非无条件依附。
始终反对任何割据自立、挑战皇权的行为。
强调君为臣纲，主张朝廷集权，反对地方将领，包括农民军首领拥兵自重、擅自称王。
重视礼仪名分，认为名不正则言不顺，任何联合都必须以承认永历帝的正统地位为前提。
而孙可望如今在云南的所作所为，分明是有意自立。
顿了顿，瞿式耜继续道：“陛下，诸公。孙可望在云南之所作所为，绝非寻常武将镇守地方，其志非小啊！他不行大明律法，不委朝廷流官，自设章法，以兵管民。此与当年张献忠据蜀称帝之初衷，何其相似！”
他转向御座，目光恳切：
“老臣深知，抗清需力，联合一切可联之力，亦是老臣一贯主张。”
“然，联合须有联合之体统，招抚须有招抚之规矩。”
“观孙可望如今之势，他会甘于接受朝廷节制吗？老臣恐其羽翼丰满之日，非但不是朝廷臂助，反成心腹大患！”
“届时，我大明将腹背受敌，北有清虏铁骑，西有割据强藩，局势危矣！故，老臣以为，朝廷当早做准备，未雨绸缪。”
瞿式耜的担忧，立刻引起了圜殿内一众官员的共鸣。
他们欢迎联合抗清的“义军”，但一个不受控制的“割据军阀”他们并不愿与之联合。
朱由榔点点头，他同样赞同这一点。
若是刚刚穿越之初，自己还是一个流亡皇帝，朝廷仍旧是一个流亡朝廷，在西南并无根基的时候。
恐怕只能接受与孙可望部的联合，以孙可望为主导。
但现在的情况与历史上完全不同。
自己已经在西南有了立足之地，整个广西掌控在手。
接下来只要建奴主力无法突破湖广防线，广东以及江南沿海有张煌言、朱成功、陈子壮、陈邦彦等人牵制建奴大军。
待锦衣卫抄家回来，届时手中有了足够钱粮，半年时间，自己手下绝对能拉起一支规模在五万左右的大军。
无论是打出广西，还是应对云南，就都有了底气。
而且大西军之中，自己最想要的将领是李定国，至于孙可望，在心中早已将其化为与陈邦傅一类的军阀。
大西军要招抚，但不能如同原本历史上那般，以孙可望为主导。
此时，兵部兵部尚书吕大器迈步出列，脸庞上带着焦虑。
“瞿公之虑，正是我等之忧！然则，正因孙可望势大难制，朝廷才更不能坐视不理！”
他的声音清越，在殿中回响：
“如今孙可望尚未遣使来朝，此正是关键之时！”
“若我等无所作为，任其在云南自成一体，待其根基稳固，他为何还要尊奉我桂林朝廷？他若自行称王，甚至称帝，我等又将如何？”
“因此，朝廷必须主动出手！绝不能等他兵精粮足，打上门来，才仓促应对。
当趁其立足未稳，内部尚未铁板一块之际，派遣使者，携陛下诏书，主动前往云南，宣示朝廷恩威，抢先一步，定下这名分大义！”
吕大器的主张极具进攻性，他要抢在孙可望提出条件前，先把朝廷的框架套上去。