三个月后，“奇点一号”战舰完成了迷雾象限的探索任务，带着新加入的五个本源宇宙的信息，向超宇宙共生联盟总部返航。此次探索行动取得了巨大的成功，不仅绘制了迷雾象限的完整星图，更将超宇宙共生联盟的成员扩展至十一个本源宇宙，极大地增强了联盟的整体实力。沿途，林辰通过超宇通讯系统，将探索过程中的发现与成果实时传回总部，引发了整个联盟的轰动。
当“奇点一号”战舰抵达超宇宙共生联盟总部时，联盟的十一个本源宇宙代表早已齐聚港口，为探索队举行了盛大的欢迎仪式。晶宇联盟的晶宇尊者与新加入的两个小型本源宇宙——“星尘宇宙”与“潮汐宇宙”的首领，在仪式上正式签署了《超宇宙共生联盟加盟协议》，成为联盟的正式成员。
欢迎仪式后，联盟理事会召开了紧急会议，林辰向所有代表详细汇报了迷雾象限的探索经历、晶宇联盟的危机化解过程以及腐蚀能量源的清除情况。“腐蚀能量源的存在绝非偶然，”林辰严肃地说道，“它蕴含的超混沌与虚空能量混合特质，表明超宇宙中可能存在一个未知的邪恶联盟，专门针对本源宇宙进行侵蚀破坏。我们必须加快探索进度，联合更多同源宇宙，同时强化超宇宙防御体系，做好应对大规模冲突的准备。”
元初尊者深表认同：“本源奇点的感知显示，超宇宙的‘暗影象限’也出现了异常能量波动，与腐蚀能量源的波动存在微弱共鸣。建议后续探索重点转向暗影象限，查明邪恶势力的真实身份与目的。”
会议最终决定，启动“超宇防御强化计划”与“暗影象限探索计划”双轨并行：一方面，整合十一个本源宇宙的技术力量，升级超宇联合防御大阵，在联盟边界部署更多的超宇能量监测站与防御堡垒；另一方面，组建五支精锐探索队，由林辰、苏清月、暗宇、晶宇尊者与星尘宇宙首领分别带队，前往暗影象限展开深度探索。
就在联盟紧锣密鼓推进计划时，超宇监测网络突然传来紧急警报——联盟边界的“星桥象限”出现大规模能量冲击，十艘负责巡逻的联盟战舰遭遇不明势力袭击，全部失联，最后传回的画面显示，袭击者是一群通体覆盖黑色装甲、驾驭着混沌能量的“暗影战士”，他们的攻击手段与腐蚀能量源的邪恶气息高度一致。
“是暗影势力！他们主动发起攻击了！”钢核快速解析着残留的能量数据，“暗影战士的装甲融合了超混沌金属与虚空晶体，能量核心搭载了‘腐蚀混沌引擎’，能同时释放混沌能量与腐蚀能量，破坏力极强。”
林辰当机立断：“暂停暗影象限探索计划，所有探索队立刻返回，组建联合防御舰队，前往星桥象限抵御暗影势力进攻！”
十一个本源宇宙的舰队迅速集结，组成一支规模庞大的联合防御舰队，在林辰的统一指挥下，向星桥象限全速进发。当舰队抵达星桥象限时，眼前的景象触目惊心——星桥象限的超宇能量网络已被严重破坏，无数能量节点处于瘫痪状态，地面上布满了战舰残骸，黑色的腐蚀能量与混沌能量交织成一片邪恶的能量海洋，数百名暗影战士正围绕着一座重要的超宇能量枢纽疯狂攻击，枢纽的防御屏障已濒临破碎。
“全员出击！光之源与灵之源舰队负责净化腐蚀能量，暗之源与土之源舰队负责牵制暗影战士，晶宇联盟舰队负责修复能量枢纽防御，本源宇宙与星尘、潮汐宇宙舰队随我正面突破！”林辰的命令通过超宇通讯传遍整个舰队。
联合舰队如同猛虎下山，向暗影战士发起猛烈反击。光之源舰队释放金色的净化能量，如同阳光驱散阴霾，快速清除着战场上的腐蚀能量；灵之源舰队的精神能量形成无形的冲击波，干扰着暗影战士的意识与行动；暗之源舰队的黑色凝聚能量与土之源舰队的棕色固化能量交织，形成一道道能量牢笼，将部分暗影战士困住；晶宇联盟舰队的蓝色晶体能量如同溪流般注入能量枢纽，快速修复着破损的防御屏障；林辰带领主力舰队，驾驶着“奇点一号”战舰，直冲暗影战士的核心阵型。
“奇点一号”战舰的超宇共生能量炮全力开火，七彩的能量光束如同利剑般刺穿暗影战士的阵型，沿途的暗影战士被能量光束击中后，黑色装甲瞬间崩解，身体化为灰烬。但暗影战士的数量远超预期，且战斗方式极为凶悍，他们不惜自爆身体，释放出大量腐蚀混沌能量，对联合舰队造成了不小的伤亡。
激战中，一名身披黑色披风、散发着恐怖能量波动的暗影首领从暗影战士中走出，他手中握着一把黑色的“混沌腐蚀剑”，剑身上流淌着粘稠的黑色能量，仅仅是能量波动，就让周围的超宇空间出现扭曲。“超宇宙共生联盟？一群自以为是的蝼蚁，也敢阻碍伟大的暗影计划，”暗影首领的声音冰冷而沙哑，“这个超宇宙，终将成为暗影的囊中之物，所有本源宇宙都将被腐蚀同化！”
林辰驾驶着“奇点一号”战舰，直面暗影首领：“你的邪恶计划注定不会得逞！超宇宙的平衡与共生，绝非你能撼动！”
暗影首领冷哼一声，挥动混沌腐蚀剑，一道巨大的黑色能量波向“奇点一号”战舰劈来。林辰早有准备，启动战舰的超宇能量护盾，同时操控战舰避开能量波，超宇共生能量炮再次开火，精准击中暗影首领。但暗影首领体表的黑色披风爆发出强烈的能量，挡住了攻击，毫发无损。
“仅凭这点力量，还不够看！”暗影首领身形一闪，瞬间出现在“奇点一号”战舰前方，混沌腐蚀剑直刺战舰的能量核心。千钧一发之际，苏清月操控战舰启动空间折叠装置，瞬间避开攻击，同时灵汐释放精神能量，干扰暗影首领的行动，暗宇则带领一支精锐小队，乘坐穿梭艇从侧面突袭。
暗影首领被多方牵制，动作逐渐迟缓。林辰抓住机会，催动体内的超宇共生能量，通过战舰的能量核心，凝聚成一道巨大的能量剑，从战舰顶端射出，直刺暗影首领的破绽。能量剑精准击中暗影首领的胸口，黑色披风瞬间破碎，暗影首领发出一声凄厉的惨叫，身体向后倒飞出去，体表的黑色装甲开始崩解。
“不可能！我怎么会输给蝼蚁！”暗影首领疯狂地嘶吼，体内的混沌腐蚀能量疯狂涌动，试图自爆。林辰果断下令：“启动超宇能量封印阵，阻止他自爆！”
联合舰队的能量同时注入封印阵，七彩的能量符文将暗影首领牢牢包裹，阻止了能量的外泄。暗影首领在封印阵中不断挣扎，最终能量耗尽，身体化为一道黑色流光，被封印在一枚特制的能量晶体中。
失去首领的暗影战士们士气大跌，联合舰队趁机发起总攻，将剩余的暗影战士彻底清除。星桥象限的危机暂时解除，但联合舰队也付出了沉重的代价，近三分之一的战舰受损，数千名超宇战士牺牲。
清理战场时，联盟科学家在暗影首领的能量晶体中，解读出了部分关键信息——暗影势力名为“超宇暗影教派”，起源于超宇宙边缘的“暗影深渊”，由一群被超混沌能量与虚空能量侵蚀的堕落本源宇宙生灵组成，他们的目标是收集超宇宙中所有本源宇宙的核心能量，唤醒沉睡在暗影深渊的“暗影本源巨兽”，彻底摧毁超宇宙的平衡，建立由暗影统治的秩序。
“暗影本源巨兽是超宇宙诞生时的邪恶产物，实力远超超混沌核心与虚空奇点，若被唤醒，后果不堪设想，”元初尊者的意识信号带着凝重，“暗影教派已在超宇宙多个象限建立了据点，腐蚀能量源只是他们的小动作，他们真正的目标，是超宇宙本源奇点。”
林辰脸色凝重：“暗影教派的实力远超我们预期，必须立刻调整战略。一方面，加快联合所有同源本源宇宙，组建更强大的超宇宙联军；另一方面，深入研究暗影能量的特性，研发针对性的克制武器；同时，派遣精锐小队潜入暗影深渊，查明暗影本源巨兽的具体情况，制定针对性的摧毁计划。”
联盟理事会紧急商议后，通过了林辰提出的“暗影应对总计划”，整个超宇宙共生联盟进入战时状态。十一个本源宇宙全力投入到武器研发、舰队建设与人员培训中，超宇研修院开设了“暗影能量防御与反击”专项课程，培养对抗暗影教派的专业人才；超宇联合防御大阵升级为“超宇暗影防御网”，能自动识别并拦截暗影能量；科学家们则夜以继日地研发“暗影净化武器”，旨在彻底清除暗影能量的侵蚀。
与此同时，林辰亲自挑选了一百名最顶尖的超宇领航者与战士，组成“暗影潜入小队”，乘坐最先进的“暗影猎手号”隐形战舰，前往暗影深渊执行潜入任务。“暗影猎手号”战舰采用了晶宇联盟的晶体隐形技术与本源宇宙的空间折叠技术，能在暗影能量环境中完美隐藏，不易被发现。
出发前夜，林辰站在“暗影猎手号”战舰旁，对小队成员说道：“此次任务九死一生，暗影深渊是暗影教派的老巢，危险程度远超想象。我们的目标是查明暗影本源巨兽的位置与状态，获取暗影教派的核心机密，为联盟的总攻提供情报支持。记住，我们是超宇宙的希望，无论遇到什么，都要坚守共生信念，活着回来！”