说完，伽罗转身离开了寝殿，此后数日都闭门不出。杨坚心中愧疚，多次前来道歉，伽罗却始终不愿见他。直到有一天，杨坚处理完朝政，亲自来到伽罗的宫殿外，站在雪地里等待。伽罗透过窗户看到丈夫冻得瑟瑟发抖的身影，想起这些年他对自己的深情与信任，心中的坚冰渐渐融化。她打开房门，递给杨坚一件厚厚的披风：“陛下身系天下，若是冻坏了，如何对得起百姓？只是臣妾希望，陛下能记住今日的寒冷，也记住我们曾经的约定。”
杨坚接过披风，紧紧握住伽罗的手：“皇后放心，朕知错了。从今往后，朕定不会再让你伤心。”他当即下令，将宣华夫人迁居到偏僻的宫殿，不再召见。这场风波虽然平息，但伽罗心中却留下了一道难以磨灭的伤痕。她开始意识到，权力或许能带来尊荣，却也能轻易改变一个人，即便是与自己相濡以沫的丈夫，也无法完全抵御诱惑。
随着隋朝的日益强盛，杨坚与伽罗的儿子们也渐渐长大。长子杨勇被立为太子，次子杨广封为晋王，三子杨俊为秦王，四子杨秀为蜀王，五子杨谅为汉王。在这五个儿子中，伽罗最初最疼爱太子杨勇。杨勇性格直率，为人宽厚，颇有文采，只是生活上有些奢侈，还娶了不少姬妾，这让崇尚节俭、坚守“一夫一妻”理念的伽罗颇为不满。
开皇十年（公元590年），杨勇的正妃元氏突然病逝。元氏是伽罗亲自为杨勇挑选的妻子，出身名门，性格温顺，伽罗对她十分满意。元氏的死让伽罗疑心重重，因为她知道杨勇最宠爱姬妾云昭训，两人早已生下多个孩子，而元氏生前与云昭训矛盾颇深。伽罗派人暗中调查，虽未发现杨勇谋害元氏的证据，却也认定是杨勇宠妾灭妻，对他更加失望。
与此同时，次子杨广却渐渐进入了伽罗的视线。杨广长相俊美，才华横溢，且十分善于伪装。他知道母亲厌恶奢侈和纳妾，便故意将府中的财物封存，穿着粗布衣裳，还只与正妃萧氏相处，对其他姬妾视而不见。每次伽罗派人前往晋王府探望，杨广都会与萧氏一同出门迎接，还将府中的姬妾都藏起来，只让老弱仆妇伺候。派去的人回禀伽罗时，无不称赞杨广“节俭持家、夫妻和睦”，这让本就对杨勇不满的伽罗，对杨广愈发喜爱。
杨广深知，要想取代杨勇成为太子，必须彻底赢得母亲的信任。他常常借着入宫请安的机会，在伽罗面前诉说自己对兄长的“担忧”：“母亲，大哥近日频繁宴请大臣，府中夜夜笙歌，恐会影响朝政。儿臣虽远在扬州（当时杨广任扬州总管），却也听闻不少大臣对大哥颇有微词，若长此以往，恐对国家不利。”他一边说，一边装作忧心忡忡的样子，还不忘强调自己“一心为国，只求辅佐陛下和太子，绝无他念”。
伽罗本就对杨勇的奢侈和宠妾行为耿耿于怀，听到杨广的话，更是坚定了“杨勇不堪大任”的想法。她开始在杨坚面前频繁提及杨勇的“过失”，说他“沉迷酒色，不顾朝政”“宠妾灭妻，有失皇家颜面”，同时极力夸赞杨广“贤明能干，体恤百姓”。杨坚起初并不在意，认为杨勇只是性格直率，并无大错，但架不住伽罗日日在耳边念叨，加上朝中一些见风使舵的大臣（如杨素）也趁机弹劾杨勇，渐渐对杨勇产生了不满。
杨勇得知母亲和弟弟在父亲面前诋毁自己，心中十分焦急，却不知如何挽回。他试图通过增加朝见次数、表现得更加勤勉来改变杨坚和伽罗的看法，却因行事笨拙，反而弄巧成拙。有一次，杨勇为了讨好伽罗，特意按照她的喜好准备了一桌素宴，席间却不小心说起“府中姬妾近日又生下一子”，伽罗听后脸色骤变，拂袖而去。杨勇看着母亲决绝的背影，知道自己与太子之位的距离，越来越远了。
开皇二十年（公元600年），储位之争终于达到了白热化。杨广暗中买通杨勇府中的下人，让他们向杨坚告发“杨勇谋反”——所谓的“证据”，不过是杨勇因焦虑而制作的一些象征皇权的玩偶。杨坚本就对杨勇心存疑虑，接到告发后，当即下令杨素彻查此事。杨素早已投靠杨广，自然是“顺藤摸瓜”，将一些无关紧要的小事夸大其词，最终“坐实”了杨勇的谋反罪名。
杨坚召集朝臣，宣布要废黜杨勇的太子之位。朝中虽有少数大臣提出异议，却被杨素等人以“维护皇权”为由打压下去。伽罗坐在帷帐之后，看着朝堂上一片附和之声，心中却没有预想中的喜悦，反而泛起一丝不安。她想起杨勇小时候，总是跟在自己身后，甜甜地喊着“母亲”；想起自己曾亲手为他缝制衣裳，教他读书写字；想起元氏刚嫁入太子府时，一家三口其乐融融的场景……可这些温馨的画面，都被“太子不贤”的执念和对杨广的偏爱所掩盖。
当杨坚最终下令将杨勇贬为庶人，囚禁在东宫，而立杨广为太子时，伽罗闭上了眼睛，一滴泪水从眼角滑落。她知道，自己亲手改变了两个儿子的命运，却不知道这个决定，会给隋朝带来怎样的未来。
成为太子的杨广，很快便露出了真面目。他不再伪装节俭，开始大肆修建宫殿，搜罗美女；他对杨坚和伽罗也渐渐失去了往日的恭敬，甚至暗中培养自己的势力，排挤异己。伽罗得知后，悔恨交加。她试图向杨坚说明杨广的真实面目，可此时的杨坚年事已高，精力不济，加上杨广早已买通了他身边的宦官和宫女，每次伽罗提及此事，都被杨广用花言巧语蒙混过去。
仁寿二年（公元602年），伽罗的身体日渐衰弱。她躺在病榻上，看着窗外飘落的落叶，心中充满了愧疚和遗憾。她想起了父亲独孤信的惨死，想起了与杨坚患难与共的岁月，想起了被自己废黜的杨勇，更想起了那个被自己推上太子之位的杨广。她知道，自己错了，错在被杨广的伪装所迷惑，错在因个人喜好而干涉储位，错在辜负了杨坚对自己的信任。
杨坚守在伽罗的病榻前，紧紧握着她的手，眼中满是心疼：“皇后，你放心，朕定会好好照顾自己，也会好好治理国家，不会让你失望。”伽罗看着杨坚，虚弱地说：“陛下……杨勇……他是无辜的……你……你要善待他……还有杨广……你要小心他……”话未说完，伽罗便永远地闭上了眼睛，享年五十九岁。
伽罗的去世，让杨坚陷入了巨大的悲痛之中。他下令为伽罗举行了隆重的葬礼，追谥她为“文献皇后”，还亲自为她撰写了墓志铭，追忆两人相伴四十五年的点点滴滴。然而，失去了伽罗的约束，杨坚也彻底放纵了自己。他开始沉迷酒色，将宣华夫人、容华夫人等妃嫔纳入后宫，日夜寻欢作乐，身体日渐衰败。
仁寿四年（公元604年），杨坚病重，躺在仁寿宫养病。此时的杨广，早已迫不及待地想要登基称帝。他暗中与杨素勾结，控制了仁寿宫的出入，还试图调戏宣华夫人，被杨坚发现。杨坚怒不可遏，捶着床骂道：“畜生何足付大事！独孤误我！”他当即下令召杨勇入宫，想废黜杨广，重立杨勇为太子。
可此时的皇宫，早已被杨广掌控。杨广得知杨坚的意图后，毫不犹豫地派心腹进入杨坚的寝殿，将杨坚杀害。随后，杨广伪造遗诏，赐死杨勇及其诸子，顺利登上了皇帝的宝座，是为隋炀帝。
杨广即位后，彻底暴露了他暴君的本性。他征发数百万民工修建大运河、营建东都洛阳，还多次发动对外战争，搞得民不聊生，天下大乱。大业十三年（公元617年），李渊在太原起兵反隋，次年便攻占长安，立杨侑为帝（隋恭帝）。大业十四年（公元618年），杨广在江都被宇文化及等人缢杀，隋朝灭亡，享国仅三十八年。
当隋朝灭亡的消息传来，那些曾经见证过“二圣共治”盛世的老臣们，无不感慨万千。他们想起独孤伽罗辅佐杨坚建立隋朝、统一全国、开创“开皇之治”的功绩，也叹息她因储位之争而犯下的错误，更惋惜那个曾经繁荣昌盛的隋朝，最终毁于杨广之手。
独孤伽罗的一生，是传奇的一生。她出身名门，却历经家破人亡的劫难；她与杨坚患难与共，辅佐他从一个受猜忌的将军成为一代帝王；她以皇后之尊，与皇帝“共治天下”，推行节俭、重视人才，为隋朝的发展奠定了坚实的基础。可她也是一个普通的女人，有着对爱情的执着（要求杨坚“一夫一妻”），有着母亲的偏爱（偏爱杨广、厌弃杨勇），这些“人性的弱点”最终让她在储位之争中做出了错误的抉择，也间接导致了隋朝的灭亡。
历史对独孤伽罗的评价，历来褒贬不一。有人称赞她“有吕武之才，无吕武之恶”，认为她是中国历史上少有的杰出女性政治家；也有人批评她“干涉朝政，偏爱幼子，导致亡国”。可无论如何，都无法否认她在隋朝历史上的重要地位。她与杨坚“二圣共治”的时代，是隋朝最繁荣、最稳定的时期，她推行的一系列政策，不仅影响了隋朝，也为后来的唐朝奠定了基础。
如今，在陕西咸阳的杨陵，还保存着杨坚与独孤伽罗的合葬墓——泰陵。墓前的石碑早已风化，上面的字迹模糊不清，但往来的游客们，都会在墓前驻足沉思，缅怀这位传奇的皇后。她的故事，就像一部跌宕起伏的史诗，既有荣耀与辉煌，也有遗憾与悲凉，让后人在感叹之余，也对“权力”“爱情”“亲情”有了更深刻的思考。