当三酸尽数被封印于玻璃瓶中，工坊内的气氛并未因此松弛。所有人都以为，这场惊心动魄的造化仪式已经结束。他们开始清理场地，准备将那些反应后剩下的、看起来毫无用处的残渣废料倒掉。
“住手！”
方琅琊的声音，第一次带上了真正的怒意。
她快步走到那堆从盐酸蒸馏瓶中刮出的、灰白色的粉末状固体前。那是硫酸氢钠 (NahSo4) 和硫酸钠 (Na2So4) 的混合物，在匠人们眼中，这是不折不扣的“药渣”，是仪式结束后理应被抛弃的“秽物” 。
“在真正的炼金术中，没有废物。”方琅琊的目光扫过众人不解的脸，声音变得深沉而富有哲理，“万物循环，阴阳相生。阳之极，便是阴之始。一种衍化的终结，恰是另一种衍化的开端。”
这番话，如同晨钟暮鼓，敲在了每个人的心上。他们看着那堆平平无奇的白色粉末，眼神开始发生变化。
方琅琊要向他们展示的，是这场仪式中最精妙、最不可思议的一环——点石成金，化腐朽为神奇。她要用所有人都视为废物的“药渣”，来炼制“二碱”——纯碱（碳酸钠, Na23）与烧碱（氢氧化钠, Naoh）。
第一场嬗变，她称之为“黑石联姻”。
她命人将那些硫酸钠残渣，与早已准备好的木炭粉、石灰石粉末，按照精确的比例混合。这三种颜色、质地截然不同的粉末混合在一起，形成了一种混沌的、灰黑色的混合物。
Na2So4+4a2S+4↑
Na2S+caa23+caS
这“混沌之物”，被重新装入坩埚，送入了熊熊燃烧的熔炉之中。这是一场在烈火中进行的、混乱而狂暴的“联姻”。当坩埚再次被取出时，里面盛放的，是一块乌黑、多孔、散发着怪异气味的熔渣，方琅琊称之为“黑灰”。
第二场嬗变，是“恶臭中的重生”。
“黑灰”被投入巨大的水缸中，用热水进行溶解。就在热水接触到黑灰的瞬间，一股浓烈到极致的、如同千万颗臭鸡蛋同时破碎的恶臭，猛地爆发出来！那是剧毒的硫化氢气体，是“黑灰”中副产物硫化钙水解的产物 。
这一次，匠人们有了准备，他们早已按照方琅琊的吩咐，站到了上风口，并用醋浸湿的布巾捂住了口鼻。饶是如此，那股无孔不入的恶臭，还是熏得他们头晕眼花，几欲作呕。
方琅琊却仿佛对此毫无察觉。她亲自用长长的木棍，在那散发着地狱气息的浑浊液体中缓缓搅动，神情专注而平静。在她眼中，这恶臭，不是腐败的象征，而是新生命诞生前，必然经历的阵痛。
当恶臭散尽，浑浊的液体经过反复的过滤、沉淀，最终只剩下一锅清澈的、略带咸味的溶液时，所有人都松了一口气。他们知道，最艰难的一步已经过去。
最后，是“静默中的升华”。
方琅琊将这锅清澈的纯碱溶液，与早已备好的熟石灰（氢氧化钙）溶液混合在一起，然后缓缓加热。
Na23+ca(oh)2→2Naoh+ca3↓
没有剧烈的反应，没有骇人的声光。一切都进行得悄无声息。只见锅底，开始缓缓地生成一层白色的、如同沉淀的月光般的物质（碳酸钙）。那“土石之浊气”，在这场静默的嬗变中，被彻底剥离、沉降。