经过协商，南北两朝宣布合一，共尊后小松天皇为共主，集结所有能调动的兵力，包括各地守护大名的武士、甚至还有浪人和农民，号称五十万，重点布防于九州岛和本州岛，企图利用地形和流传的“神风”庇佑，阻挡明军攻势。
然而，在绝对的实力差距面前，任何挣扎都是那么的苍白无力。
洪武十七年八月，在傅友德的增援到来后，总兵力已达十一万的明军，开始进攻九州岛。
以船上用火炮猛烈轰击九州岛沿海防线，随后大军登陆。
倭军倚仗的竹木栅栏和石头碉堡，在明军的火炮炮击中不堪一击，数万武士组成的防线如同儿戏。
蓝玉和傅友德身先士卒，率军冲杀在前。
九州岛上，除了少数提前表示臣服的，大部分进行抵抗的都遭到了明军的屠戮。
明军严格执行了楚宇的净化政策，近半数的倭人被屠戮，鲜血染红了九州的海岸与河流。
仅十天，九州岛的反抗势力被肃清。
明军的残酷手段起到了极强的震慑效果，当明军登上面积最小的四国岛时，岛上的豪族闻风丧胆，没有做出任何抵抗，纷纷投降。
楚宇鉴于其恭顺懂事，遵守诺言，未在四国岛进行大规模屠戮，四国岛绝大部分倭人得以幸免。
占领九州岛和四国岛后，明军兵锋直指倭国核心——本州岛。
在本州岛，明军遇到了自开战以来倭军最顽强的抵抗。
倭军利用熟悉的地形，层层设防，尤其是在一些险要的关隘，进行了阻击。
他们甚至发动了自杀性的夜袭，给明军造成了不小的麻烦。
然而，武器的差距难以用这样的方式去弥补。
明军的火炮可以将倭军固守的关隘轰塌，密集的火铳射击能让挥舞武士刀的武士成片倒下。
朱樉、朱棡和朱棣三兄弟也在此战中立下战功。
足利义满见大势已去，明军直逼京都，不得不效仿当年倭国应对元军之策，仓皇携天皇以及皇室珍宝、公卿贵族，乘船渡海，逃往被称为倭国荒凉之地的北海道。
洪武十七年十月，明军攻陷京都，本州岛北部宣布投降。
明军在京都举行了庄严的祭奠仪式，告慰在战斗中战死的明军将士。
逃到北海道的足利义满，并未放弃最后一丝希望，他再次派出使者，前往驻扎在本州岛北部的明军大营，向楚宇求和。
帅帐中，使者匍匐在地，泣涕横流，表示愿去掉皇号，永为大明治下之藩王，年年朝贡，只求保留北海道那一隅之地苟延残喘。
楚宇打了哈欠，看向对方，淡淡道，“早知如此，何必当初？都已经打到这了，还想保留你们倭国？你们只有投降的选择，且倭人将来都会是我华夏人的奴仆。”
说完，不给使者开口的机会，挥手令锦衣卫将人给拖了出去。
洪武十七年十一月，明军经过休整后，跨海进攻北海道。
北海道的残存倭军士气低迷，衣甲不全，在明军面前，毫无抵抗能力。
明军如同摧枯拉朽般横扫北海道，最终，足利义满和小松天皇在海边一个渔村被明军俘获。
战争结束的几天后，小松天皇身着素衣，双手捧着降表，来到楚宇面前。
这位倭国名义上的统治者，卑微的跪了下来，将降书高高举过头顶。
“小国昏昧，触怒天威...今愿率土归降，倭人永为天朝奴仆，乞饶性命...”
楚宇接过降书，看都没看，随手就丢给了一旁的蓝玉。
“倭国，自今日起，不复存在。此地，为大明行省，华夏国土！”
洪武十七年十二月，足利义满及其家族成员、倭国贵族，被以谋逆天朝之罪，公开枪决，倭国皇室成员被押解回应天圈禁。
倭国国祚至此断绝，四岛被划分为大明的四个行省，派遣官吏前来治理，还将十多万百姓移民到了这里。
此战统计，搜刮到了白银四千八百万两、黄金一百三十万两和数百万石粮食；蓝玉被封为梁国公，傅友德被封为颍国公。
......