当她赶到苏禾被困的山谷时，苏禾正靠在岩石后，灵植能量几乎耗尽，身边堆满了变异体的残骸。小林立刻喷射孢子雾，清空周围的变异体，拉起苏禾：“快走！溯源者快到了！”
两人刚冲出山谷，就看到一道巨大的黑影从远处袭来——末日溯源者高达十五米，身体由病毒液和信念能量编织而成，胸口镶嵌着一颗跳动的黑色核心，正是病毒意识本体，它的手臂能化作病毒长枪，所到之处，灵植尽数枯萎。
“就是现在！”小林将喷射器递给苏禾，“你吸引它的注意力，我绕到背后，将孢子注入核心！”
苏禾点头，举起喷射器朝着溯源者喷射孢子雾。溯源者嘶吼着，病毒长枪朝着苏禾刺来，苏禾侧身躲开，长枪刺穿岩石，岩石瞬间被腐蚀成粉末。小林趁机绕到溯源者身后，灵植法杖凝聚成尖刺，朝着核心刺去。
可就在尖刺即将碰到核心时，溯源者突然转身，病毒长枪刺穿了小林的肩膀，黑色病毒液顺着伤口蔓延。小林强忍剧痛，将孢子弹舱塞进核心，按下引爆器：“给我碎！”
孢子在核心内爆发，绿色光芒从溯源者体内涌出，它发出凄厉的嘶吼，身体开始寸寸瓦解，病毒液蒸发成白雾，胸口的核心彻底碎裂。小林倒在地上，肩膀的伤口在孢子光芒中渐渐愈合，面板弹出【溯源警报解除：病毒意识本体彻底摧毁，末日病毒永久清零，信念之钟能量恢复】。
苏禾冲过来，扶起小林：“成功了……我们成功了！”
两人返回青禾城时，城门处的战斗已经结束，阿凯的虚影正指挥守护者清理变异体残骸，信念之钟重新响起，钟声比以往更响亮，化作金色的光雨，滋养着全城的灵植和幸存者。
小林、苏禾和阿凯的虚影站在信念钟楼下，望着重新焕发生机的城市，望着远处嬉戏的孩子，心里无比平静。面板弹出【终极提示：末日所有根源彻底清除，地球进入“永恒守护新纪元”】。
“以后，再也不会有灾难了吧？”苏禾轻声说。
阿凯的虚影笑着点头：“嗯，再也不会了。”
小林望着世界树顶端的阳光，握紧两人的手：“就算有，我们也会一起面对。因为我们记住了苦难，守住了信念，更守住了彼此。”
信念之钟的钟声在青禾城上空回荡，世界树的光芒与钟声交织，化作一道永恒的屏障，守护着这片历经千难万险却始终坚韧的土地。他们知道，末日的阴影已彻底消散，未来的每一天，都将是阳光明媚的和平之日，而这份守护，会永远延续下去，直到时间的尽头。