联盟中心的晚宴尚未落幕，星海却独自来到了顶层的观测平台。晚风拂过她的发梢，黑色裂空座安静地盘旋在她身旁，深邃的鳞片在夜色中泛着冷冽的光泽。她手中握着一枚从被捕获黑衣人身上搜出的徽章，徽章上刻着缠绕着荆棘的齿轮图案，边缘还残留着微量的特殊能量结晶。
“这枚徽章的材质很特殊，里面混入了混沌宝石的碎片。”布拉塔诺博士的声音从身后传来，他拿着检测报告，神色凝重，“结合之前破解的数据来看，这个犯罪集团名为‘荆棘齿轮’，他们不仅在研发控心药剂，还在试图利用混沌宝石的能量制造更强大的武器。”
小智和志米也随后赶来，小智看着徽章，眼神中充满了愤怒：“他们竟然还在打混沌宝石的主意，绝对不能让他们得逞！”志米补充道：“联盟已经锁定了‘荆棘齿轮’在卡洛斯地区的最后一个据点，位于卡洛斯高原的废弃研究所。那里地势险要，防御严密，我们需要制定周密的计划。”
星海将徽章收好，冷静地分析道：“废弃研究所周围有复杂的地形和能量磁场，普通的通讯设备可能会受到干扰。我的路卡利欧可以用波导之力传递信息，沙奈朵的精神力也能覆盖一定范围。小智，你的甲贺忍蛙战斗力强劲，负责正面突破；志米先生，你率领部分联盟成员从侧面牵制；我则带着宝可梦潜入研究所内部，摧毁能量核心和数据中心。”
她顿了顿，看向身边的伙伴们：“另外，三冠卫星赛的后续活动已经结束，爱儿和皮耶尔他们会留在联盟中心处理后续事宜，我们尽量避免让无关人员卷入危险。明天一早，我们就出发前往卡洛斯高原。”黑色裂空座似乎感受到了即将到来的战斗，发出一声低沉的咆哮，充满了斗志。
次日清晨，朝阳为卡洛斯高原镀上了一层金色的光晕。星海、小智和志米率领着一支精锐的联盟小队，乘坐喷火龙和联盟的直升机，朝着废弃研究所进发。红色暴鲤龙沿着高原下的河流前行，随时准备从水路提供支援，黑色裂空座则在高空侦察，传回研究所的实时画面。
“研究所的外围布置了大量的能量陷阱，还有两只宝可梦在巡逻。”星海通过裂空座传回的画面，快速分析着，“左边是沙漠蜻蜓，右边是波士可多拉，都是擅长防御和突袭的宝可梦。”志米看着画面，说道：“我先让比雕和赫拉克罗斯去引开它们，为大部队创造机会。”
“等等，”星海拦住了他，“沙漠蜻蜓的速度很快，波士可多拉的防御极强，硬拼会浪费时间。小智，你让甲贺忍蛙用羁绊进化，用水流斩制造混乱，吸引它们的注意力；我让耿鬼用暗影分身从背后偷袭，控制住它们。”
小智立刻点头，放出甲贺忍蛙：“甲贺忍蛙，羁绊进化！”水蓝色的羁绊之力瞬间爆发，甲贺忍蛙进化成羁绊形态，手中凝聚出巨大的水之手里剑，朝着研究所外围的空地劈去，巨大的水花溅起，成功吸引了沙漠蜻蜓和波士可多拉的注意。
“就是现在！耿鬼，上！”星海下令道。耿鬼化作一道黑影，迅速绕到两只宝可梦的身后，分出多个分身，用暗影球干扰它们的视线，同时本体用催眠术将它们催眠。整个过程一气呵成，没有触发任何陷阱。
“太厉害了！星海，你的战术太精妙了！”小智兴奋地说道。星海笑了笑，继续说道：“大家保持警惕，研究所内部的防御肯定更严密。”
众人小心翼翼地潜入研究所内部，昏暗的走廊里布满了监控摄像头和能量感应装置。星海让沙奈朵用精神力干扰监控信号，路卡利欧则用波导之力探测感应装置的位置，逐一避开。突然，走廊前方的大门打开，几名穿着黑色制服的守卫带着三只宝可梦走了出来——电击魔兽、黑鲁加和巨钳螳螂，正是之前与他们交过手的宝可梦。
“又是你们！”为首的守卫咬牙切齿地说道，“这次一定要让你们有来无回！电击魔兽，十万伏特！黑鲁加，喷射火焰！巨钳螳螂，合金爪！”三种攻击同时袭来，气势汹汹。
“甲贺忍蛙，用水墙防御！”小智立刻下令。水墙瞬间升起，挡住了攻击。志米也放出大针蜂：“大针蜂，用双针攻击电击魔兽！比雕，翅膀攻击牵制黑鲁加！”大针蜂迅速俯冲而下，双针精准地刺向电击魔兽的弱点，比雕则用翅膀拍击黑鲁加，打乱它的攻击节奏。
星海观察着战局，发现这三只宝可梦的攻击比之前更加狂暴，身上的能量波动也更加不稳定。“它们体内的控心药剂被强化了！”星海惊呼道，“这样下去，它们的身体会承受不住的！路卡利欧，用波导弹攻击它们身上的药剂注射装置！沙奈朵，用安抚之波缓解它们的痛苦！”
路卡利欧迅速凝聚出波导弹，精准地射向三只宝可梦身上的注射装置，装置被击碎，紫色的药剂流淌出来。沙奈朵释放出柔和的安抚之波，三只宝可梦狂暴的情绪逐渐平复，攻击速度也慢了下来。小智抓住机会：“甲贺忍蛙，用水之手里剑结束战斗！”羁绊形态的甲贺忍蛙将水之手里剑掷出，精准地命中三只宝可梦，它们倒在地上，失去了意识。
解决掉守卫后，众人继续深入研究所。来到研究所的核心区域，他们看到了一个巨大的能量装置，装置中央镶嵌着一块巨大的混沌宝石碎片，周围连接着无数的线路，正在不断吸收着周围的能量。“这就是他们的能量核心！”星海说道，“必须尽快摧毁它，否则一旦能量过载，整个高原都会受到波及。”
就在这时，研究所的主控室里传来一个冰冷的声音：“没想到你们能走到这里，真是出乎我的意料。”一个穿着白色实验服的男子走了出来，他的身边站着一只被铁链束缚的超梦，超梦的眼中充满了痛苦，身上连接着多根能量导管。
“是你在控制超梦！”小智愤怒地喊道。男子冷笑一声：“超梦的力量真是太强大了，有了它和混沌宝石的结合，我的伟大计划很快就能实现了！”他按下手中的遥控器，超梦发出一声痛苦的咆哮，身上爆发出强大的能量，朝着众人发起了攻击。
超梦释放出的精神冲击威力惊人，整个核心区域都在剧烈摇晃，天花板上的石块不断掉落。“甲贺忍蛙，用水墙防御！”小智喊道。水墙瞬间升起，但在超梦的攻击下，很快就出现了裂痕。志米立刻下令：“比雕，用旋风挡住石块！赫拉克罗斯，大针蜂，攻击超梦的能量导管！”
比雕扇动翅膀，形成巨大的旋风，将掉落的石块卷走。赫拉克罗斯和大针蜂朝着超梦身上的能量导管冲去，但被超梦用念力挡住，狠狠击飞出去。星海冷静地观察着，发现超梦的攻击虽然强大，但动作却很僵硬，显然是被强制控制的。
“不能攻击超梦，它只是受害者！”星海对着众人喊道，“我们必须先切断它与能量装置的连接！小智，你让甲贺忍蛙用羁绊之力吸引超梦的注意力；志米先生，你负责牵制能量装置的防御系统；我让黑色裂空座和红色暴鲤龙联手破坏能量导管！”