木叶在千手玄的铁腕整合下，如同一块被反复锻打的精钢，外部袭击的阴影非但没有使其碎裂，反而让内部结构变得更加致密坚韧。“清影”部队在宇智波镜的带领下，以极高的效率运转起来，结合暗部原有的情报网络和各族提供的特殊能力，开始对村子内部及火之国境内进行一轮彻底的梳理。数名被“晓”以重利或把柄操控、散布谣言的底层人员被揪出，其下场自然不言而喻，起到了极强的震慑作用。
与此同时，与岩隐、云隐的停战谈判也在一种微妙而紧张的氛围中展开。木叶凭借着战场上的绝对优势和道义制高点，态度异常强硬。最终，岩隐和云隐不得不接受了以赎金（大量战略物资和金钱）换回战俘的条款，并在名义上承认了此次冲突是由他们“误信谗言”所引发，灰头土脸地撤回了全部军队。尽管所有人都知道这不过是暂时的休战，但木叶无疑赢得了宝贵的喘息和发展时间。
战争的创伤需要抚平，胜利的果实也需要消化。木叶进入了短暂的战后重建与深化改革的时期。
忍者学校的建设工地上，热火朝天。来自各家族的工匠和普通工人混杂在一起，按照由玄和扉间共同审核的设计图，建造着兼具防御性、实用性与教育功能的校舍。这所学校的意义，早已超越了单纯的教育机构，它被视为木叶未来的基石，是打破家族隔阂、培养“木叶意识”的最重要摇篮。玄甚至亲自参与了部分基础课程的设定，将团队协作、战术推演基础、查克拉性质普及知识以及木叶建立的理念和历史（经过他“润色”的版本）纳入其中。
贡献点银行正式挂牌运营，其背后由任务公会、物资储备库和封印术式三重保障，很快便赢得了村民的信任。贡献点不仅可以兑换忍术、忍具、药材，甚至可以兑换土地（村外划定区域）的使用权、定制忍具服务乃至申请研究经费。这套经济体系的初步成功，极大地促进了村子内部的资源流动和活力，也让“努力就有回报”的观念深入人心。
然而，千手玄的推演之瞳，始终注视着那平静水面下的汹涌暗流。
一日深夜，星影办公室。
宇智波镜无声无息地出现，脸上带着一丝疲惫，但眼神依旧锐利。
“玄大人，‘清影’对境内可疑人员的初步清理已完成，效果显着，内部流言已基本绝迹。但关于‘晓’的核心踪迹……依旧渺茫。他们似乎彻底潜入了地下，或者转换了活动方式。”镜汇报道，语气中带着不甘。
玄点了点头，似乎并不意外。“如果他们这么容易被找到，也就不配成为能搅动忍界风云的黑手了。镜，你有没有发现，他们近期的行动模式，似乎有所改变？”
镜沉思片刻：“您是指……他们不再直接针对我们的军事目标或高层，而是转向更隐蔽的渗透和煽动，甚至……像是在刻意规避与‘清影’和暗部的正面冲突？”
“没错。”玄走到巨大的忍界地图前，手指划过川之国、雨之国，以及火之国那些曾经发现异常能量残留的区域，“他们在收缩，在潜伏。就像毒蛇，在等待更好的时机，或者……在准备更致命的毒液。”
他转过身，看向镜：“我怀疑，他们下一个目标，可能不再是木叶本身。”
镜微微一怔：“不是木叶？”
“木叶刚刚经历大战，内部凝聚，外部警惕，并非下手的最佳目标。”玄分析道，“他们的目的是制造混乱，收集能量，推动某种仪式或计划。既然硬骨头难啃，他们很可能会选择更脆弱的目标下手，或者……寻找能够从内部撬动木叶的‘杠杆’。”