洪武二十六年（4090年）秋季七月甲辰日初一，皇帝祭祀太庙。发生了日食。
丙午日，皇帝下诏罢除各布政司的宝泉局，因为铸钱扰民的缘故，在京城则依旧铸造。
戊申日，选拔秀才张宗濬等人，让他们跟随詹事府左右春坊的官员按班次进入文华殿值班。讲读结束后，进言讲述民间的利弊、田间庄稼种植等事情，偶尔陈述古今孝顺父母、敬爱兄长、忠诚守信、文学才华和技艺等各类旧事，每天都把这些当作常事。
辛亥日，命令辽东都指挥使司谨慎防守边境，断绝与朝鲜国的贡使往来。又命令左军都督府派人前往辽东、金州、复州、海州、盖州这四个州，增设关卡和险要之处，修缮城墙和护城河，派遣骑兵巡逻，到达鸭绿江才返回。
壬子日，信国公汤和之子汤燮上奏，把原先配给自家奴仆的四十八人的仪仗侍从归还官府，让这些人隶属官籍成为平民。
癸丑这天，任命长兴侯耿炳文之子耿璇担任前军都督府都督佥事，中军都督府都督佥事刘德、左军都督府都督佥事袁洪一同担任本府左都督。左军都督府的都督佥事徐增寿被任命为右军都督府都督佥事，右军都督府的都督佥事李增枝被任命为左军都督府都督佥事。
设置甘州左护卫指挥使司。
乙卯日，云南武定军民府女知府商胜进献马匹。
丁巳日，朝廷将有罪的府军前卫将士调到甘州左护卫，赐给他们不等的路费。
二十一日，辛酉。钦天监监副李德秀进言说：臣按照旧元朝至元辛巳年作为历元，向上推算远古的时间，每过一百年就会长出一天，每过一百年又会消去一天，这种规律永远都不可以改变。现在钦天监监正元统把历元改成洪武甲子年，没有使用消长之法。考查春秋历法，鲁献公十五年是戊寅年，距离至元辛巳年已经有两千一百六十三年了。
以辛巳年作为历元，推算出天正冬至在甲寅日夜子初三刻，与当时实测的结果相符。把洪武甲子年作为元年，向上距离献公戊寅年有2266年，推算得出天正冬至在己未日午时三刻，和以辛巳年为元年相比，相差4天6个时辰5刻，有这样不相符合的情况。
现在应当用至元辛巳年作为历法的开端，同时采用日、月、五星消长的法则，这样才符合天道。奏疏呈上以后，董统又说：“我所推算的甲子历元，实际上与旧法相符合，没有一点差错，所以才敢上报给您。”皇上说：“两种说法都难以作为依据，只有通过检验日月五星的交会行度没有差错的才是正确的。”
癸亥日，任命吏科给事中张迪署理吏部事务，吏部印信仍让署理吏部事务的司封主事翟善掌管。
甲子日，设置宁夏卫，征调甘州左护卫的将士守卫此地。当初，朝廷将有罪的府军前卫将士派到甘州左护卫服役。不久后，因为有罪之人不能担任亲王的随从侍卫，于是就把他们迁徙到宁夏设置卫所，另外调派兵士作为亲王的护卫。
乙丑日，再次赐给故东川侯胡海田地。当初，胡海曾经有罪，他的禄田被没收，到这时他的儿子胡观娶了公主，皇帝下诏又赐给了他禄田。
丙寅日，礼部上奏确定武职官员的随从人数：一品到三品的官员随从六人，四品到六品的官员随从四人，七品到九品的官员随从二人，都使用正规军人担任随从，每三天轮换一次。
戊辰日，广东韶州府乐昌县出现盗贼，他们杀害县官，打开仓库，抢夺百姓的财物。命令清远卫指挥雍文率领士兵讨伐、逮捕他们。
任命代理北平布政使司事务的华敏为该司参议。
己巳日，设置各处布政使司的司狱官，品秩为从九品。
都督聂纬因是蓝玉同党而被诛杀。
河南卫军王狗儿的妻子周氏一胎生下三个男孩，这件事被朝廷听说后，朝廷派使者前去赏赐财物。使者给她赏赐钞十锭，米五石，而且命令将她的两个儿子分给没有儿子的人家抚养，每月供给米五斗。过了两年，停止了赏赐，将此事记录在条例中。
辛未日，派遣礼部员外郎潘善应、司务谭孟高前往庐山祭祀，为周颠仙立碑。颠仙姓周，不知道他的名字，他自己说是建昌人。他身材高大健壮，相貌奇特，举止和常人不同。他十多岁的时候患了疯病，曾经拿着一个瓢进入南昌城在街市上讨饭。过了很久，来到临川。
不久，他又回到南昌，每天都尽力帮助别人，晚上睡在里巷的屋檐下，严寒酷暑、刮风下雨都能泰然处之。曾经赶到省府，说：‘报告太平。’人们都觉得他的话很奇异，于是就称呼他为颠仙。没过几年，天下果然大乱。
陈友谅占据江汉地区后，率领军队攻入南昌，颠仙隐藏行迹，不见踪影。等到皇上亲自率军讨伐陈友谅，平定南昌之后，准备返回时，周颠仙在路边拜见皇上，暗中跟随皇上到了金陵。每当皇上外出，他就小步快走上前说：‘报告太平，报告太平！’偶尔相见，有时他一边捉着虱子一边交谈，有时一边拍着节拍一边唱歌，歌词大多是隐晦的话语。皇上很讨厌他，特意命令人用烧酒让他喝，他畅快不停地喝着。
第二天他又来到宫中，皇帝命令赐给他新衣服，看到他旧衣带里系着一根约三寸长的菖蒲，说：‘细细咀嚼菖蒲，喝下水，腹中就不会疼痛。’又说自己进入火中不感到热，就用大瓮把他盖住，堆积了大约五尺厚的芦苇和柴薪，点燃了大瓮的四周，火烧完后，打开大瓮看，他像原来一样端坐着，像这样的事情共有三次。
等到他寓居在蒋山寺一个多月的时候，寺里的僧人说：‘颠仙和小和尚争抢饭食，他生气得半月都没有吃饭了。’皇帝驾临翠微亭，召见他，他的步态和平时一样，于是皇帝赏赐他食物，他这才进食。皇帝问：‘你能一个月不吃饭吗？’他回答说：‘可以。’于是皇帝把他安置在一间密室中，他已经二十三天没有吃东西了。
皇上要去寺庙，赐给士兵们食物，京城的将士们听说后，争相拿着酒菜去给他们吃，他们吃了之后全都吐了出来。不一会儿皇帝到了，赐给他食物，他又像往常一样吃喝。皇帝喝醉以后，准备回宫，颠仙在道路旁边用手画了一个圈，说：‘打破一个桶，就会成就一个桶。’
这时中原还没有平定，陈友谅又包围了南昌，皇上想要亲自率领军队前去救援，就问周颠：‘陈友谅已经僭越称帝，我这次前去会怎么样？’颠仙抬头看了很久，说：“可以行动。”皇上的脸上没有这个人的情分。说：‘我和你一起去，可以吗？’皇帝说：‘可以吗？’他就跳跃着拿起木杖摇晃舞动，像壮士挥舞兵器的样子，用来表示必定胜利的征兆。
船停泊在皖城，没有风不能前行。颠仙说：‘行动就会有，不行动就不会有。’不久之后他们走了没几里路，风果然猛烈地刮起来。船行至马当，他看见江豚在水中嬉戏，就说：‘水怪出现在前面，死的人一定很多。’皇帝说：‘颠者说的是什么胡话啊！如果再这样，就把你扔到江里。’于是自己说能入水不被浸湿，就命人把他扔到江里。
过了很久，他又来拜见皇帝，想要一点食物，皇帝就命令赐给他食物。吃完以后，他整理好衣襟，把脖子向前伸着说：“现在可以杀我了。”皇帝笑着说：“杀你干什么？”于是就放他回庐山。等到陈友谅兵败身死，太祖派人前往庐山寻找他周颠仙。
到太平宫附近时，有人说有一个老人住在民房里，说：‘我是太平宫的使者，半个月没有吃东西了，现在离开了，不知道去了哪里。’洪武癸亥年秋天，有一个名叫觉显的僧人，自称是庐山岩中的老人，派人前来相见。皇上认为他虚妄荒诞，拒绝了他。
到这时，皇帝身体不适，服用药物也没有痊愈。之前的那个僧人又赤着脚来到，说周颠仙人派他来送药。皇上没有采纳他的建议。和尚详细说了以前的事，于是朱元璋就服下了那种药，觉得有菖蒲、丹砂的气味。当天晚上，皇帝的病就好了，僧人也离开了，不知去了哪里。于是他亲自写文章刻在石碑上记录这件事，命令善应等人前往祠堂祭祀。
恩明府知府黄广平派他的弟弟黄忠华进献地方特产。
壬申日，普定卫西堡长官司阿德诸寨长卜剌赞等聚众作乱，朝廷命令贵州都指挥顾成率领军队讨伐平定了叛乱。
八月甲戌日初一，散骑舍人刘昌逮捕了强盗王天锡，将他斩首后把首级献给了京城。天锡是真定元氏县人，他聚集众人抢劫掠夺，在山谷间出没，有时变换服装偷偷进入城市，行踪踪迹诡异隐秘。广平、顺德、辽、沁、山东、山西、河南各郡都被他们所侵害。这一年五月，朝廷命令刘昌率领力士官军分别到各个县去抓捕盗贼。天锡走投无路，逃入李相山北面的山沟里，上吊自杀而死。刘昌将他的首级斩下献给朝廷，盗贼终于被平定。
丁丑日，派遣官员到先师孔子庙举行释奠礼。
戊寅日，祭祀大社、大稷。
己卯日，曲靖府马龙州知州法灯等人派使者来朝进贡马匹和土特产。
庚辰日，朱元璋命令吏部：“从今以后授予官员职务，就给予正式职务，不要再让他们试职。”这些规定都写成了法令。
辛巳日。任命王晟为浙江布政使司左参议。起初，侯晟代理广东布政使司事务，到这时被任命为浙江参议。
代理吏部事务的主事翟善进言：朝廷内外的杂职官员任职三年后接受考核，没有私罪的，未入流的官员升为从九品；有私罪的降职任用。有关部门的官员任期三年届满，不称职的就罢黜降职。称职以及表现平常的官员即使有私人犯罪的情况，也让他们前往任职。
现在建议：杂职官员犯了私罪，还有降职使用的条款，何况是有司官员曾经犯了私罪，却不加以罢黜降职，那就无法体现劝勉和惩罚了。皇帝说：‘有关部门官员犯了私罪而被宽恕，是希望他们改过自新，不应该降低他们的等级。’
壬午日，皇帝的第三十九个孙子朱有光出生，是周王的第六个儿子。
癸未日，秦王朱樉、晋王朱?、当今皇上、周王朱橚、齐王朱榑到达京城。
开始命令天下府、州、县儒学的训导穿戴冠带。在此之前，训导的帽子和服饰与尚未做官的士人相同。到这时，河南布政使司右参议董伦上奏：“各地儒学的训导应该与医学训科、阴阳训术一样都穿戴冠带，以此来区分士类。”命令礼官集中商议这件事，但没有得出结论。