熵族战士见防御阵被摧毁，立刻发起反击，数千道紫色的熵能长刀朝着联盟舰队射来。深海族的珊瑚舰释放出蓝色的水脉灵能，形成一道巨大的 “水幕屏障”，挡住了熵能长刀；冰霜族的冰灵舰则发射冰棱，将冲在最前方的熵族战士冻结，为后续舰队开辟通道。
战斗持续了两小时，三道星盟遗留防御阵被全部摧毁，熵族战士的伤亡超过七成。当联盟舰队靠近熵寂深渊的核心区域时，午夜时分的 “能量低谷期” 恰好到来 —— 熵能漩涡的转速明显减慢，紫色的能量流如同退潮般减弱，露出一条通往熵寂圣殿的狭窄通道。
“核心小队，立刻进入通道！支援舰队，继续抵挡外围的熵族残余势力！” 林羽下令道，创世号、生命舰、科技舰同时启动引擎，朝着通道冲去。通道内的熵能浓度虽仍很高，但舰身的熵能净化藤快速工作，淡绿色的藤蔓吸收着周围的熵能，转化为灵脉能量，为战舰提供持续动力。
当三艘战舰终于冲出通道，熵寂圣殿的全貌终于在眼前展开 —— 这座由黑色 “熵能岩” 搭建的圣殿，通体散发着紫色的光芒，圣殿顶端的 “熵寂核心” 悬浮着一颗巨大的紫色球体，正是熵寂君主的能量形态，他的周围，十颗被吸干生机的星球残骸环绕，如同祭品般缓慢旋转；圣殿的大门上，一道巨大的熵能封印闪烁着与假本源之心相似的光芒，封印中央的凹槽，恰好能容纳假心的大小。
“就是现在！用假本源之心打开封印！” 苏瑶大喊道，林羽将假心放入凹槽。金色的能量与紫色的熵能瞬间融合，封印缓缓打开，露出圣殿内部的景象 —— 中央的石台上，一颗通体金色的 “本源之心” 悬浮在半空，散发出纯净的生机能量，正是他们寻找的真正本源之心！
但就在林羽准备进入圣殿时，熵寂君主的声音突然响起，带着腐朽的气息：“欢迎你，星盟传承者，你终于帮我打开了圣殿的大门！这颗本源之心，将成为我复活的最后一块拼图，而你，将成为我第一个‘熵能容器’！”
紫色的熵能核心突然爆发出强烈的能量，朝着创世号的方向袭来。林羽立刻下令启动反虚空护盾，同时释放出所有的熵能净化藤，淡绿色的藤蔓缠绕住战舰，形成一道坚固的防御层。熵能与净化能量碰撞的瞬间，紫色与绿色的光芒交织，整个圣殿都在剧烈摇晃。
“苏瑶，带领灵植小队，趁机进入圣殿，夺取本源之心！” 林羽握紧雷电长矛，纵身跃出创世号，金色的星盟能量在矛尖凝聚，“我来挡住熵寂君主，为你们争取时间！”
苏瑶没有犹豫，带领十名灵植小队成员，乘坐小型登陆舱，朝着圣殿的入口冲去。登陆舱的熵能净化藤快速工作，避开周围的熵能攻击，顺利降落在圣殿内部。当苏瑶的手指即将触碰到本源之心时，圣殿的墙壁突然裂开，无数道黑色的 “虚空触手” 从裂缝中伸出 —— 埃尔德的虚空族援军，终于到了！
“林羽，我们被夹击了！虚空族的舰队正在靠近，埃尔德的虚影出现在圣殿外围！” 赵凯的声音带着急促，“支援舰队已与虚空族展开战斗，但敌人数量太多，防御圈快撑不住了！”
林羽回头望去，圣殿外围的星空中，黑色的虚空战舰如同蝗虫般涌现，埃尔德的虚影站在虚空主母的旗舰上，正朝着他冷笑：“林羽，你以为能赢吗？今天，熵寂君主将复活，虚空族将占领宇宙，而你，将成为这场‘新生’的祭品！”
熵寂君主的能量形态也在此时发生变化，紫色的球体逐渐凝聚成一个人形，他的手中，一把由纯熵能构成的 “寂灭之剑” 缓缓成型：“传承者，你的灵脉能量，我收下了！”
林羽握紧雷电长矛，金色的星盟能量与传承戒的光芒融合，形成一道巨大的能量刃：“想要我的灵脉？想要占领宇宙？先过我这一关！苏瑶，快激活本源之心，启动星盟生机核心！我来挡住他们！”
苏瑶的手指终于触碰到本源之心，金色的生机能量顺着她的指尖蔓延，与圣殿的能量产生共鸣。星盟秘录突然从星启长老手中飞出，自动翻页至 “生机核心激活页”，金色的符文在圣殿中流动，与本源之心的能量形成一道巨大的 “净化光罩”。
“星盟生机核心，激活开始！预计需要五分钟！” 苏瑶的声音带着坚定，“林羽，坚持住！五分钟后，所有的熵能与虚空能量，都将被净化！”
熵寂君主与埃尔德见势不妙，同时发起猛攻 —— 紫色的寂灭之剑与黑色的虚空触手交织，形成一道致命的攻击网，朝着林羽的方向袭来。林羽挥动能量刃，金色的光芒与紫色、黑色的能量碰撞，发出震耳欲聋的爆炸声。他的身体在能量冲击下不断后退，嘴角渗出鲜血，但手中的长矛却始终没有放下 —— 他知道，只要再坚持五分钟，宇宙的生机就能得以延续。
圣殿外围，联盟的支援舰队与虚空族、熵族的战斗仍在继续。石心长老的磐石舰被虚空战舰击中，舰身的星骸岩护盾出现裂纹，但他仍坚持指挥战斗；澜语女王的珊瑚舰释放出最后的水脉灵能，形成一道巨大的水幕，保护着身后的灵植运输舰；影族的隐杀舰则潜入虚空舰队的后方，用影能匕首摧毁了数艘敌舰的引擎。
当五分钟的倒计时终于结束时，本源之心突然爆发出耀眼的金色光芒，星盟生机核心的 “净化洪流” 如同瀑布般从圣殿中涌出，覆盖了整个熵寂深渊。紫色的熵能与黑色的虚空能量在洪流中快速消退，熵寂君主的人形形态逐渐透明，埃尔德的虚影也发出一声痛苦的嘶吼，彻底消散；外围的虚空战舰与熵族战舰在净化洪流中化为一堆废铁，宇宙中的熵能云与虚空裂隙也被彻底清除。
当光芒逐渐消退时，林羽瘫坐在圣殿前的广场上，手中的雷电长矛已失去能量，传承戒的光芒也变得暗淡。苏瑶、星启长老、赵凯等人快步跑到他身边，眼中充满了喜悦与关切。远处的星空中，联盟舰队的成员们欢呼起来，金色的阳光穿透云层，洒在熵寂深渊的每一个角落，原本黑色的熵能岩，竟开始长出嫩绿的灵植幼苗。
“我们…… 赢了？” 林羽的声音带着疲惫，却难掩激动。苏瑶点头，将本源之心递到他手中：“是的，我们赢了！星盟生机核心成功激活，熵寂君主与埃尔德被彻底消灭，虚空族与熵族的威胁，终于解除了！”
林羽握紧本源之心，感受着其中纯净的生机能量，心中明白，第三阶段的终极危机已圆满解决 —— 他们不仅阻止了熵寂君主的复活，摧毁了埃尔德的阴谋，还彻底清除了宇宙中的熵能与虚空能量，守护了无数星球的生机。
当联盟舰队带着胜利的荣光，朝着联盟总部的方向驶去时，林羽站在创世号的观测窗前，看着远处逐渐清晰的星海。他知道，第四阶段的 “宇宙秩序重塑篇” 已正式开启 —— 修复星系灵脉、推广灵植生机、探索更遥远的宇宙，还有那些隐藏在宇宙深处的秘密，都在等待着他们去完成。而宇宙生机联盟的使命，也将从 “对抗危机”，转向 “守护生机，探索未来” 的全新征程。
夕阳下，联盟舰队的光芒与本源之心的金色能量交织，在星空中形成一道美丽的光带。林羽握紧手中的传承戒与本源之心，眼中闪烁着坚定的光芒 —— 只要联盟的文明团结一心，灵植的生机永不熄灭，这片星海的未来，必将充满希望与光明。