医道纪元开启后的第三千年，新生宇宙已呈现出前所未有的繁荣景象。秦墨与苏清婉隐居在昆仑山巅的医道圣殿中，通过宇宙医者系统默默观察着这个世界的变迁。
这日清晨，苏清婉在整理药圃时，发现一株普通的灵芝竟然自然进化出了治愈时空创伤的特性。她轻轻触碰灵芝叶片，感受到其中蕴含的宇宙级医道韵律。
墨哥，看来医道纪元正在孕育我们未曾预料的可能性。她将灵芝递给刚结束冥想的秦墨。
秦墨接过灵芝，太极道境自然运转：不仅是他。最近三个月，宇宙医者系统记录了十七万种全新的医道变种。有些文明甚至开始将医道与科技融合，创造出能够治愈规则损伤的装置。
就在二人探讨之际，圣殿中央的宇宙星图突然发出刺目的红光——这是最高级别的警报。
出什么事了？苏清婉快步走到星图前。
星图上显示，在距离地球三百万光年的天医星域，整个星系的规则结构正在发生诡异蜕变。不是崩溃，也不是进化，而是一种超越现有认知的。
这不是危机。秦墨眼中闪过明悟，而是医道纪元必然要经历的成年礼
他们立即动身前往天医星域。当穿越维度通道抵达目的地时，眼前的景象令他们震撼：这里的星辰不再遵循物理法则，而是按照医道原理重新排列。行星如同药草般生长，恒星如同针灸穴位般闪烁，星云则化作一味味宇宙级药方。
欢迎来到医道实验室。一个温和的声音响起。只见星空中浮现出宇宙医者的虚影，经过三千年的积累，医道纪元终于迎来了质变时刻。
宇宙医者展示了一幅宏伟蓝图：它计划将整个宇宙重构为一个巨大的医道生命体，每个星系都是一个器官，每个文明都是一组细胞。这个生命体将具备自我完善、自我治愈的能力，甚至能够帮助其他宇宙解决。
但这需要付出代价。宇宙医者语气凝重，重构过程中，所有现有文明都将经历医道飞升。成功者将融入新体系，失败者则会...消散。
苏清婉担忧地问：不能循序渐进吗？如此剧烈的变革，恐怕很多文明难以适应。
时间不多了。宇宙医者切换星图，显示宇宙边缘出现诡异的规则疲劳现象，医道纪元加速了宇宙的新陈代谢，但也导致本源力量过度消耗。若不进行重构，整个宇宙将在万年内自然衰亡。
秦墨沉思片刻：所以重构不是选择，而是必然。但我们需要确保这个过程尽可能平稳。
三人开始制定详细的医道重构方案。秦墨负责推演规则转换的路径，苏清婉设计文明过渡的方案，宇宙医者协调整个系统的运行。
然而，就在方案即将完成时，异变突生！一股强大的抗拒力量从宇宙深处爆发，直指重构计划的核心！
这是...文明集体意识的反弹！苏清婉震惊地发现，许多高度发达的文明不愿放弃现有形态，联合起来抵制重构。