王政君看到这种情况，心里虽然很不痛快，但也知道不能和新皇帝硬来。于是，她选择了避让，让自己的侄子大司马王莽“乞骸骨”回家。虽然汉哀帝没有批准王莽的辞职请求，但对王氏家族却日渐疏远。
在汉哀帝的打压下，王氏家族的势力逐渐衰落。建平元年（公元前6年）秋天，曲阳侯王根与成都侯王况被查出了罪名，王根被迫返回自己的封地，王况被贬为庶民。建平二年（公元前5年），王莽也被弹劾，不得不卸职回到封地新都，闭门不出。这期间，王氏家族在朝廷中的地位一落千丈，几乎到了任人宰割的地步。
而傅氏和丁氏家族呢，在汉哀帝的支持下，开始在朝廷中飞扬跋扈起来。傅氏被尊为“帝太太后”，丁氏被尊为“帝太后”，她们的家族成员也纷纷加官进爵，掌握了朝廷的重要权力。这两大家族和王氏家族之间的矛盾越来越深，一场激烈的外戚争斗即将爆发。
就在这个时候，汉哀帝却做出了一件让人意想不到的事情。他居然爱上了一个名叫董贤的男子，而且爱得死去活来。他对董贤的宠爱，简直超乎了想象。不仅赏赐给他大量的金银财宝，还让他担任了大司马的重要职位，甚至还想把江山都送给他。这一下，可引起了朝廷上下的轩然大波。
傅氏和丁氏家族本来就对董贤得宠感到不满，现在看到汉哀帝居然要把大司马的位置让给他，更是气得七窍生烟。她们觉得董贤是个祸害，必须要除掉他。于是，她们联合起来，准备向董贤下手。
可是，汉哀帝却坚定地站在了董贤一边。他为了保护董贤，不惜和自己的祖母傅氏、母亲丁氏翻脸。这祖孙三人之间的矛盾越来越深，最终导致了傅氏含恨而终。而汉哀帝呢，也因为过度放纵自己，在元寿二年（公元前1年）病逝，年仅二十五岁。
汉哀帝的去世，让西汉朝廷再次陷入了混乱之中。而王政君，这个历经风雨的太皇太后，也再次迎来了她人生中的又一个重要转折点。
汉哀帝去世后，由于他没有子嗣，皇位一下子就空了出来。王政君得知哀帝死讯后，立刻展现出了她的果断和睿智。她迅速移驾未央宫，部署王氏子弟控制中枢，第一时间夺得传国玉玺，把持了国政。
随后，王政君诏命王莽再任大司马，录尚书事，兼管军事令及禁军。这一次，王氏家族再次掌握了朝廷的大权。在王政君和王莽的商议下，他们推举中山王刘衎继承皇位，即汉平帝。
汉平帝当时只有九岁，还是个小孩子，根本无法处理朝政。于是，王政君临朝听政，将政事都托付给了王莽处理。一开始，王莽还表现得兢兢业业，对王政君也十分恭敬。他在朝廷中推行了一系列改革措施，赢得了不少人的支持和赞誉。王政君看到王莽如此能干，也对他越来越信任，逐渐把更多的权力交给了他。
可是，随着权力的不断增大，王莽的野心也开始膨胀起来。他不再满足于仅仅做一个大司马，他想要的，是整个天下。于是，他开始一步步地谋划着篡汉自立的计划。
元始五年（公元6年），汉平帝突然驾崩，年仅十四岁。对于汉平帝的死，历史上一直存在着争议，很多人都怀疑是王莽下的毒手。但不管真相如何，汉平帝的死，无疑给了王莽一个绝佳的机会。
汉平帝死后，王莽为了方便自己掌控朝政，推举汉宣帝的玄孙、广戚侯的儿子，当时只有2岁的刘婴继位。刘婴年纪太小，根本无法理政，于是王莽就以摄政皇帝的身份，总揽朝政大权。
此时的王莽，已经完全不把王政君放在眼里了。他的野心已经暴露无遗，他想要的，就是推翻西汉，建立自己的王朝。终于，在公元9年，王莽撕下了最后的伪装，正式建立新朝，向王政君索要传国玉玺。
王政君这才如梦初醒，她终于意识到，自己一手扶持起来的侄子王莽，居然是个狼子野心的叛徒。她又惊又怒，坚决不肯交出传国玉玺。她愤怒地对王莽说：“你们父子一家承蒙汉家之力，才能世世代代都得到富贵，既没有报答他们，又在他人托孤之时，趁机夺取国家，完全不顾恩义之道。”可是，在王莽的百般威胁下，王政君最终还是无奈地摔碎了传国玉玺，以此来表达自己的愤怒和反抗。这一摔，不仅摔碎了传国玉玺的一角（后来王莽让人用黄金补上），也摔碎了西汉王朝最后的尊严和希望。
《汉书·元后传》里清清楚楚记着这一幕：“太后闻舜语，怒不肯予玺。舜固请之，太后乃出汉传国玺，投之地以授舜，曰：‘我老已死，如而兄弟，今族灭也！’”
王莽拿到玉玺后，如愿登基，改国号为“新”，西汉就此灭亡。而王政君呢？她被王莽尊为“新室文母太皇太后”，却再也没笑过。她把自己关在长乐宫的寝殿里，不许下人挂新朝的旗帜，也不许用新朝的历法，每天就对着汉宣帝、汉元帝的画像发呆，有时候哭着哭着就睡着了，梦里全是当年刚入宫时的场景——那时候她还是个忐忑的“家人子”，以为只要生下孩子，就能安稳过一辈子，哪想到最后会亲手见证汉朝的覆灭。
有一次，王莽派人给她送新做的礼服，想让她在新朝的祭祀大典上穿。王政君直接把礼服扔到门外，骂道：“这衣服我穿不惯，我只穿汉家的衣裳！”王莽知道她心里不痛快，也不敢过分逼迫，只能任由她在长乐宫里守着汉朝的旧物度日。
王政君的晚年，过得比守寡还难受。以前虽然汉元帝不宠她，汉成帝不争气，但好歹还是汉家天下，王氏家族也靠着她风光无限。可现在，天下换了姓，自己成了“亡国太后”，那些曾经围着她转的侄子们，要么忙着在新朝当官，要么怕被她牵连躲得远远的。只有几个忠心的老宫女陪着她，每天除了吃饭睡觉，就是对着画像叹气。
更让她心寒的是，王莽为了彻底抹去汉朝的痕迹，居然把汉元帝的宗庙改成了“文母庙”，还想把她的灵位迁进去和元帝分开祭祀。王政君得知后，气得差点晕过去，她对身边的人说：“我这辈子嫁的是汉家天子，死了也要跟元帝葬在一起，他王莽算什么东西，也敢改我汉家宗庙！”她坚决不肯去“文母庙”祭祀，王莽没办法，只能作罢。
到了始建国五年（公元13年），王政君已经八十四岁了。这在古代可是实打实的高寿，可她却觉得这长寿是种折磨。那年冬天特别冷，长乐宫的暖气烧得不好，她受了风寒，一病不起。王莽来看过她一次，手里拿着新朝的药，嘴里说着“太后安心养病，新朝定会让您安享晚年”。王政君连眼睛都没睁，只是挥了挥手让他走。
临终前，她拉着老宫女的手，断断续续地说：“我死了以后，一定要把我葬在渭陵（汉元帝的陵墓）旁边，离元帝近一点……千万别忘了，给我穿汉家的皇后礼服，别让我带着新朝的东西去见地下的先帝们……”说完这句话，她就永远地闭上了眼睛。
《汉书》里记载她的谥号是“孝元皇后”，还是按照汉朝的规矩来的，这大概是王莽唯一还顾念一点亲情的地方。可即便如此，她的陵墓也没能完全如愿——王莽虽然把她葬在了渭陵旁边，却故意在她的墓和汉元帝的墓之间挖了一条沟，意思是“你是新朝的‘文母’，不能跟汉朝的皇帝真正葬在一起”。直到后来东汉建立，光武帝刘秀才让人把那条沟填上，让这对生前不睦的夫妻，在地下终于“团聚”。
王政君的一生，实在太传奇，也太悲哀。她从一个“克夫”的民间女子，一步步当上皇后、太后、太皇太后，熬走了六个皇帝（汉宣帝、汉元帝、汉成帝、汉哀帝、汉平帝、孺子婴），见证了西汉从鼎盛到灭亡的全过程。她没什么坏心眼，一开始只是想保住自己和儿子的地位，后来又想扶持娘家人，可偏偏就是这份“护短”和“心软”，让王氏家族越来越膨胀，最后养出了王莽这个篡国贼。
有人说她是“西汉的掘墓人”，可仔细想想，她又何尝不是个受害者？她一辈子都在被动地接受命运的安排——被父亲送进宫，被稀里糊涂地选给太子，被儿子的不争气逼得扶持外戚，最后又被侄子逼着交出玉玺。她就像一片飘在风中的叶子，看似站在权力的顶端，却从来没有真正掌控过自己的命运。
参考《汉书》