冯生在林御史衙中半年，深得信任。这一日，随御史出巡河间府。旧地重游，感慨万千。他抽空悄悄去探柳家，却见宅院荒芜，蛛网纵横，一问邻舍，才知柳员外因一桩官司破家，夫妇双双气死，小姐下落不明。冯生闻此噩耗，肝肠寸断，哭倒在地。
原来那日冯生逃走后，柳员外逼女改嫁。珠娘性情刚烈，深夜悬梁自尽，幸得小鬟发现救下。柳员外又惊又怒，将她锁在房中。不料半月后，有仇家翻出旧案，告他贪赃枉法。官府抄没家产，柳员外一病身亡。柳夫人投井自尽。珠娘被官卖为奴，幸得李馆主兄妹闻讯，凑钱赎出，藏在乡间。这些情节，冯生如何得知？
冯生悲恸之余，辞了林御史，发愿要寻访珠娘下落。他想起李馆主或知内情，便回河间府寻访。到得学馆，只见门户紧闭，问左右邻居，说李馆主携妹搬往乡下已久。冯生依言去寻，奔波数日，全无消息。这一日傍晚，错过宿头，见山脚下有座荒庙，只得进去栖身。庙中供着马头娘娘，神像剥落，香火断绝。冯生又饥又乏，拜祷道：“若娘娘保佑弟子寻得珠娘，定当重修庙宇，再塑金身。”祷毕，和衣卧在神座下。
朦胧间，忽见一女子翩然而入，却是柳珠娘，悲泣道：“相公好狠心！害得奴家好苦！”冯生忙扯住她衣袖，道：“小姐莫走！”猛然惊醒，手中却扯着一幅破幔帐。正怅然间，听得庙外马蹄声响，有人道：“这庙可歇马。”进来两个军汉，押着几辆囚车。冯生借火光一看，惊得几乎叫出声来——最后一辆囚车中囚的竟是李馆主！冯生待军汉睡熟，悄悄摸到车边，低唤：“李兄！”李馆主睁眼见是他，流泪道：“冯兄，我冤沉海底！”原来本地有个豪绅欲强买他家祖坟地，不从，便诬他通匪。冯生道：“兄台放心，我必救你。”问起珠娘，李馆主道：“舍妹与她同在乡间，明日官军必去搜捕，速去报信！”说了一个地址。
冯生不敢耽搁，连夜赶路。天亮时分，找到那处村庄，只见官兵已围住一所宅院。冯生情急智生，大喊：“巡按大人有令，不得骚扰百姓！”官兵一愣，他趁机冲入宅中，见玉娥与一女子相拥发抖，那女子不是珠娘是谁？三人相见，抱头痛哭。冯生道：“外有重兵，如何是好？”珠娘道：“后园有口枯井，可藏身。”三人刚下井，官兵已破门而入，搜了一遍，不见人影，悻悻而去。
冯生等人在井底躲到夜深，方才爬出。计议已定，冯生道：“我今有巡盐御史书信，可直入京城告御状。”便带着二女北上。不料行至黄河渡口，遇着大雨，山洪暴发，冲散行人。冯生与二女失散，急得沿河寻找，见一女子抱浮木漂下，忙跳下水救起，却是玉娥。玉娥哭道：“珠娘姐姐被水冲走了！”冯生眼前一黑，几乎晕倒。
二人沿河寻觅数日，活不见人，死不见尸。玉娥劝道：“姐姐吉人天相，或遇救未可知。兄长冤狱要紧。”冯生只得先赴京城。到得长安，持林御史书信投在一位御史门下。那御史查明冤情，奏明圣上，不仅开释李馆主，还将豪绅治罪。李馆主死里逃生，对冯生感恩戴德。
冯生虽救得李馆主，却失却珠娘，终日郁郁。李馆主道：“舍妹玉娥，对兄台一往情深，若不嫌弃，愿结秦晋。”冯生感玉娥患难相随之情，又见李馆主恳切，便应允了。择吉成亲之日，宾客盈门。忽然门上报说，有故人送贺礼来。冯生出去迎接，却见一辆香车停下，车中走出一位丽人，笑吟吟道：“冯相公，新人如玉，可还记得旧人珠泪么？”冯生定睛一看，竟是柳珠娘！惊得倒退两步，道：“你、你是人是鬼？”珠娘笑道：“青天白日，哪来的鬼？”原来那日她被洪水冲走，恰遇孙老者驾舟经过救起。孙老者实乃异人，算出冯生今日成亲，特送珠娘来会。
冯生悲喜交集，忙请入内堂。珠娘见玉娥，执手道：“妹妹替我陪伴相公，深感大德。我今虽在，岂敢争宠？愿共侍君子。”玉娥亦爱珠娘温婉，欣然应允。李馆主大喜，即命重摆喜宴，双喜临门。次日，冯生往谢孙老者，已不知所踪。
后来冯生连科及第，官至太守。为报马头娘娘庇佑之恩，重修庙宇，再塑金身。因感人生际遇奇巧，将此事写成《珠还合浦记》流传于世。这正是：
姻缘簿上姓名标，方信蓝桥有路通。
明珠不弃贫贱士，双姝共效英皇风。
莫道造化常弄人，至诚感格天亦动。
请看冯生奇遇记，方信人生际遇巧。