夕阳的光芒斜斜地洒在大峡谷的岩壁上，将红褐色的石头染成了温暖的金红色，像是给险峻的峡谷披上了一层鎏金铠甲，每一道岩石的纹路都在光影中清晰可见。小智一行人沿着蜿蜒的石阶往下走，脚下的碎石被踩得“咯吱咯吱”响，每一步都得小心翼翼——石阶边缘就是深不见底的峡谷，风从谷底吹上来，带着草木的清香和岩石的冷意，卷起衣角，让人忍不住抓紧旁边粗糙的岩石扶手。
峡谷两侧的岩壁陡峭如刀削，缝隙中偶尔能看到几株顽强生长的野草，在风中摇曳着细小的身影，还有几簇不知名的紫色野花，在夕阳下绽放出倔强的光彩；远处传来几声野生神奇宝贝的啼叫，空灵的声音在空旷的峡谷里回荡，分不清来自哪个方向，仿佛整个峡谷都在低声吟唱。“哇，这里的景色也太壮观了吧！”小蓝举起相机，对着峡谷深处不停按快门，镜头里，夕阳、岩壁、野草与野花构成了一幅野性又壮丽的画面，“听说大峡谷底下有很多远古神奇宝贝的化石，说不定能拍到很珍贵的照片，要是能遇到活的远古神奇宝贝就更好了，那绝对能登上神奇宝贝杂志的封面！”
小霞蹲下身，捡起一块形状奇特的石头，石头表面布满了螺旋状的纹路，摸起来冰凉又光滑，像是被千万年的流水打磨过：“你看这块石头，上面好像有奇怪的纹路，会不会是化石的一部分？看起来像某种贝壳的印记，说不定是菊石兽的化石呢！”娜姿则闭着眼睛，指尖萦绕着淡淡的超能力光晕，如同悬浮在空中的细小星辰，片刻后缓缓睁开眼，语气带着一丝凝重：“这里的能量波动很特别，带着古老的气息，像是沉睡了千万年的力量在地下涌动。而且……似乎有不安稳的气息在流动，好像有什么沉睡的庞然大物，要被外界的动静唤醒了。”
就在这时，一阵奇怪的“滋滋”声顺着风传了过来，像是电流通过导线时的细微震颤，又像是机械运转的异响。小智警惕地皱起眉头，顺着声音望去——只见峡谷中间的空地上，火箭队三人组正鬼鬼祟祟地围着几个黑色的箱子忙碌着。武藏双手叉腰，对着小次郎大喊：“你动作快点！磨磨蹭蹭的，要是被人发现了，我们辛苦准备了半个月的计划就全泡汤了！到时候坂木老大怪罪下来，你担得起责任吗？”小次郎戴着厚厚的绝缘手套，笨拙地连接着箱子上的导线，额头上渗着冷汗，手都在发抖：“知道了知道了！这炸弹的线路太复杂了，全是精密的导线，一不小心就会短路爆炸，我得慢慢弄，总不能拿我们的命开玩笑吧！”喵喵则蹲在一旁，用爪子扒拉着地上的泥土，在箱子周围挖出一圈小坑，嘴里念叨着：“嘿嘿，只要把这里炸开，肯定能挖出一大堆化石神奇宝贝，到时候献给坂木老大，我们就能升职加薪，再也不用被当成小喽啰使唤，说不定还能成为火箭队的核心成员！”
“火箭队！”小智大喊一声，握紧拳头，带着伙伴们快步冲了过去，脚步声在空地上回荡，“你们在这里干什么？这些黑色箱子里装的是什么？快住手，这里不能随便乱动！”武藏看到小智一行人，先是愣了一下，随即叉着腰，露出嚣张的笑容，下巴都快翘到天上了：“哟，这不是小智吗？真是巧啊！我们要在这里炸开峡谷，挖出藏在底下的远古化石神奇宝贝，等我们收服了它们，就能拥有超强的战斗力，成为全天下最厉害的反派组合，到时候连冠军都不是我们的对手！”
“你们太过分了！”小智愤怒地说，声音都有些发抖，“随意炸山会破坏这里的环境，还会伤害到藏在岩石里的神奇宝贝！这里的生态一旦被破坏，后果不堪设想！快把炸弹停下来，不然会出大事的！”小次郎摊了摊手，无奈地指了指箱子上的计时器，语气带着一丝幸灾乐祸：“晚啦！炸弹的倒计时已经开始了，现在就算想停也停不下来了，除非你能在十秒内破解这复杂的线路，不过我猜你肯定做不到！”小智低头一看，只见其中一个箱子上的红色计时器正飞速跳动着——“00:05”“00:04”“00:03”“00:02”“00:01”……数字越来越小，像催命符一样刺得人眼睛发疼，每跳动一下，心脏都跟着揪紧。
“不好！快躲开！”小智大喊着，一把将身边的小蓝和小琴推开，两人踉跄着摔在地上，刚好避开了碎石坠落的区域；娜姿也立刻用超能力形成一道透明的屏障，将小霞和皮卡丘护在身后，屏障上泛起淡淡的蓝光。就在计时器跳到“00:00”的瞬间，“轰隆——”一声巨响，仿佛天空都被撕裂了！巨大的冲击波瞬间席卷了整个峡谷，碎石像暴雨一样从岩壁上滚落，有的石头甚至有篮球大小，砸在地上发出“砰砰”的巨响；地面剧烈摇晃，仿佛发生了强烈的地震，脚下的石阶开始断裂，裂缝不断蔓延。火箭队三人组被冲击波掀飞，像断线的风筝一样尖叫着掉向峡谷深处；小智和皮卡丘也没能站稳，随着崩塌的石阶和碎石一起往下坠，耳边只剩下呼啸的风声、石头撞击的“砰砰”声，还有伙伴们焦急的呼喊，身体仿佛要被碎石淹没。
不知过了多久，小智重重地摔在地上，疼得他眼前发黑，浑身骨头像是散了架，尤其是后背，像是被巨石碾过一样。他挣扎着爬起来，用手撑着地面，咳嗽了几声，才发现自己身处一个昏暗的地下洞穴中，周围弥漫着潮湿的泥土味和淡淡的硫磺味，空气又闷又冷，让人呼吸困难。皮卡丘从他怀里探出头，小爪子揉了揉被撞疼的脑袋，又用爪子摸了摸小智的脸颊，对着小智“皮卡皮卡”地叫着，眼神里满是担忧，小尾巴紧紧卷着小智的手腕。不远处，火箭队三人组正四脚朝天地躺在地上，武藏捂着脑袋哀嚎：“疼死我了！这是什么鬼地方？黑漆漆的，连个灯都没有，不会是地狱吧？我的发型都乱了！”小次郎和喵喵也挣扎着爬起来，脸上、身上全是灰尘，头发被碎石砸得乱糟糟的，小次郎的眼镜都摔碎了一片，看起来狼狈不堪。
“大家都没事吧？”小智朝着黑暗中大喊，声音在洞穴里回荡。很快，黑暗中传来了小蓝、小霞、小琴和娜姿的回应，带着一丝颤抖，却都没有大碍。几人互相搀扶着，借着从洞穴顶部缝隙透进来的微弱光线——那光线像是从天上漏下来的碎银，勉强照亮了周围的环境，慢慢聚到一起。洞穴里布满了奇形怪状的钟乳石，有的像倒悬的利剑，尖端还挂着晶莹的水珠，随时可能滴落；有的像垂落的冰柱，表面光滑如玉；地面上散落着许多破碎的石头，还有不少带着古老纹路的化石碎片，有的像鱼类的骨骼，有的像甲壳类的外壳，空气中的古老气息比地面上更加浓郁，让人仿佛穿越到了千万年前的史前世界。
突然，小智腰间的一颗神奇宝贝球开始发出微弱的紫色光芒，像是黑暗中跳动的鬼火，紧接着，一道耀眼的紫光闪过，千年鬼斯通从球里飘了出来，周身萦绕着淡淡的紫色雾气。它漂浮在半空中，透明的身体在昏暗的光线下泛着淡淡的光晕，那双红色的眼睛警惕地扫视着四周，瞳孔因紧张而微微收缩，语气带着一丝不安，声音都有些发颤：“这里不对劲，充满了古老又暴躁的气息，好像有什么沉睡已久的东西被刚才的爆炸声惊醒了……这种气息好可怕，比我在幽灵塔见过的任何幽灵系神奇宝贝都要凶，像是来自远古的愤怒！”
鬼斯通的话还没说完，洞穴深处突然传来一阵“沙沙”的声响，像是无数只爪子抓挠岩石的声音，密密麻麻，让人头皮发麻。紧接着，无数双血红的眼睛在黑暗中亮起，像一颗颗诡异的红色灯笼，从洞穴的各个角落冒出来，有的在高处的钟乳石上，有的在地面的石缝里，有的在远处的阴影中，数量多得数不清，看得人浑身发冷。小智和伙伴们瞬间紧张起来，皮卡丘浑身的毛都竖了起来，像一只炸毛的小猫，对着黑暗发出“皮卡皮”的警告声，小爪子紧紧抓着小智的衣服，指甲都快嵌进布料里；小霞下意识地后退一步，握紧了腰间的神奇宝贝球，手心全是冷汗：“这……这么多红色的眼睛，到底是什么东西？太吓人了！”
随着一阵沉重的脚步声，像是巨兽在行走，震得地面都微微颤动，一群巨大的神奇宝贝从黑暗中缓缓走了出来——它们有的长着坚硬的青灰色甲壳，甲壳上布满了尖锐的突起，像是镶嵌着无数把小匕首，长长的镰刀状前肢闪着寒光，每挥动一下都能听到“唰”的破空声，仿佛能轻易斩断钢铁，正是远古化石神奇宝贝镰刀盔；有的背着螺旋状的黄褐色贝壳，贝壳上印着深浅不一的纹路，像是大自然绘制的密码，身体像章鱼一样柔软，十条触须在地上拖曳着，留下一道道湿痕，是同样古老的菊石兽。
这些神奇宝贝的眼睛都是血红色的，瞳孔里充满了狂暴的气息，像是被点燃的火焰，显然是被刚才的爆炸惊扰，从沉睡中被强行唤醒，变得异常暴躁。它们对着小智一行人发出凶狠的吼叫声，镰刀盔挥舞着锋利的前肢，在空中划出一道道寒光，似乎要将眼前的“入侵者”撕碎；菊石兽则喷出一串串冰冷的水柱，水柱打在钟乳石上，发出“砰砰”的声响，将坚硬的岩石都砸出了小坑，显然是把他们当成了破坏家园的敌人。
“这么多镰刀盔和菊石兽！”小霞惊呼道，声音都有些发颤，双腿忍不住微微发抖，“它们看起来好凶，而且数量太多了，我们该怎么办？我们的精灵根本不够对付这么多啊！”小智深吸一口气，强迫自己冷静下来，双手紧握成拳，眼神变得坚定，像是下定了决心：“现在只能战斗了！我们必须想办法让它们冷静下来，不然都会被它们攻击！鬼斯通，用催眠术干扰它们，尽量控制住一部分，先减轻压力！”
鬼斯通飘在空中，看着眼前密密麻麻的远古神奇宝贝，透明的身体虽仍有些发颤，像风中摇曳的烛火，却咬牙稳住心神，眼神变得坚定：“好……好嘞！看我的！”它双眼泛起浓郁的紫色光晕，催眠术的能量如同无形的烟雾，朝着最前排的几只镰刀盔笼罩而去。与此同时，小智迅速抛出神奇宝贝球：“比比鸟，出来吧！用烈暴风牵制它们，别让它们靠近！”白光闪过，比比鸟振翅高飞，在洞穴中盘旋，翅膀扇动出强烈气流，形成一股小型风暴，将几只冲在最前面的镰刀盔吹得东倒西歪，站立不稳。“火恐龙，喷射火焰攻击菊石兽！它们怕火，这是我们的优势！”小智紧接着下令，火恐龙迈着有力的步伐上前，张开嘴，一道炽热的火焰喷射而出，火焰带着“呼呼”的声响，像一条燃烧的火蛇，击中了两只菊石兽。菊石兽发出痛苦的嘶鸣，身体因惧怕火焰而连连后退，甲壳上都被火焰燎得发黑。“暴鲤龙，守住前方，用水炮阻挡冲过来的敌人！”小智最后抛出一颗球，蓝色的暴鲤龙在狭窄的洞穴中勉强舒展身躯，巨大的尾巴摆动间，带起一阵狂风，一道粗壮的水柱从它口中喷涌而出，如同奔腾的小溪，暂时逼退了冲在最前的几只化石精灵，在地面上形成一片水洼。
小霞也立刻掏出自己的神奇宝贝球，眼神变得坚定，不再像之前那样慌乱：“宝石海星，出来支援！用泡沫光线干扰它们的视线和行动！”白光闪过，一只通体湛蓝、带着红色核心的宝石海星漂浮而起，六只腕足灵活摆动，散发着柔和的蓝光，如同黑暗中的灯塔。它对着化石精灵群喷出无数晶莹的泡沫，泡沫在空中飞舞，落在镰刀盔和菊石兽身上，不仅减缓了它们的行动速度，还模糊了它们的视线。娜姿则轻轻抛出一颗精灵球，动作优雅而从容：“胡地，出来吧，用念力控制住左侧的镰刀盔，别让它们包抄过来！”白光闪过，通体金黄、带着超能力气息的胡地出现在场中，它双手交叉于胸前，额前的红色宝石闪烁着光芒，眼神锐利地盯着化石精灵：“胡地，用念力束缚它们！”胡地额前的宝石亮起耀眼的蓝光，几道无形的念力光束射出，如同看不见的绳索，瞬间将三只镰刀盔束缚在原地，让它们无法动弹，只能徒劳地挥舞着前肢，发出愤怒的嘶吼。
火箭队三人组看着眼前的场景，早已吓得魂飞魄散，武藏紧紧抓住小次郎的胳膊，指甲都快掐进他的肉里，声音都变了调，带着哭腔：“这……这些神奇宝贝也太可怕了吧！比坂木老大的大针蜂还要凶！我们还是赶紧跑吧，留在这里迟早要被它们撕碎！”小次郎和喵喵连连点头，小次郎甚至已经迈开了脚步，却被一只挣脱了念力束缚的镰刀盔拦住去路——那只镰刀盔挥舞着锋利的前肢，对着他们发出凶狠的吼叫，唾液顺着前肢滴落，吓得他们立刻缩回脚步，只能瑟瑟发抖地躲在一旁的岩石后面，连大气都不敢喘，恨不得把自己藏进石缝里。
战斗愈发激烈，小智一边指挥精灵作战，一边留意着战场各处的动向，大脑飞速运转，思考着应对之策。鬼斯通的催眠术虽有效，却只能控制少数目标，而且持续时间不长，很快就被剩余的化石精灵用吼叫唤醒；比比鸟的烈暴风威力渐弱，翅膀因持续扇动而微微发酸，羽毛都有些凌乱，飞行速度也慢了下来；火恐龙的火焰也开始黯淡，从最初的炽热红色变成了橘黄色，显然体力消耗巨大，嘴里不停地喘着粗气，胸口剧烈起伏；暴鲤龙在狭窄的洞穴中难以施展，庞大的身躯限制了它的活动范围，只能勉强守住前方，身上还被镰刀盔的前肢划开了几道小口子，流出淡淡的血水；宝石海星的蓝光也黯淡了几分，腕足摆动的速度明显慢了下来，泡沫的数量也少了许多；胡地额前的宝石光芒也变得微弱，显然维持念力消耗了它大量的精力。