行动组的手段高效而隐秘。他们利用“文明火种”带来的神经学知识，开发出了更精密的脑波扫描仪，可以在不惊动目标的情况下，进行大规模筛查。同时，艾米莉亚的黑客技术，像一张无形的大网，撒向了帝国网络的每一个角落，寻找着那些隐藏的、与外部势力连接的蛛丝马迹。
疑点一个个被揪出。
科研部的首席物理学家，在一次实验中“不小心”导致了反物质约束场的短暂失控；
地面基地的后勤主管，其名下的账户有不明来源的资金流动，数额巨大；
甚至连负责守卫“文明火种”晶体存放地的卫队指挥官，都在一次例行检查中，被发现脑波存在间歇性异常……
这些人，曾经都是人类的精英，是凌夜一手提拔起来的心腹。如今，他们却成了最危险的敌人。
抓捕行动在帝国各个角落同时展开。
当两名特别行动组的成员破门而入，出现在那位后勤主管面前时，他甚至没有来得及发出警报。他的眼神空洞，嘴里喃喃着听不懂的词汇，仿佛在听从某个遥远存在的指令。在短暂的抵抗被制服后，秦婉对他进行了脑部深层扫描，结果令人不寒而栗——他的潜意识里，已经被植入了来自“狩猎者”文明的指令代码。
“清除。”凌夜在通讯器里只说了一个词。
这不是审判，这是必要的外科手术。
帝国这艘大船，在驶向星辰大海的途中，必须剔除掉那些试图从内部蛀空的寄生虫。这个过程充满了猜忌、痛苦和决绝。一些曾经与凌夜并肩作战的老部下，在得知真相后，选择了自我了断，不愿接受审判。更多的人，则是在震惊和后怕中，重新审视自己和身边的每一个人。
清洗结束后，帝国上下陷入了一种短暂的、压抑的沉寂。但所有人都明白，这场风暴过后，这艘大船变得更加纯粹，也更加团结。因为他们知道，只有根除病灶，才能在即将到来的更大风暴中，活下去。
凌夜站在舰桥，看着舷窗外那颗蔚蓝的星球。他知道，这只是开始。真正的考验，还在后面。
信任危机——帝国的内部清洗