“空间扭曲·万镜归墟！”空间领主的扭曲杖挥动，无数空间镜面在圣殿内形成，镜面中释放出空间切割刃，朝着众人袭来。“银纹，夹缝通道！”银纹的夹缝杖释放银色能量，在众人前方打开一道夹缝通道，切割刃穿过通道后被引导至虚空之中。陈默的起源平衡剑注入三核能量，剑刃劈开迎面而来的镜面，朝着空间本源晶冲去。空间领主的躯体突然融入空间，出现在陈默身后，扭曲杖刺向陈默的后背。“苏瑶，定位领主实体！”苏瑶的探测器锁定空间能量的波动点，“领主的实体在晶核左侧三米处！”陈默立刻转身，光剑劈向波动点，空间领主的实体显现，晶甲被劈出一道裂痕。
“三核能量·空间稳定！”科伦和伊洛同时注入能量，星律与光韵能量在空间本源晶周围构建“能量稳定阵”，晶核的空间能量无法再被领主操控。阿混沌的机械臂变形为“空间裂解钻”，钻向晶核的弱点；寒的冰蚀风暴矛冻结住晶核的能量流；林羽的生命藤缠绕住晶核，防止其爆炸。陈默抓住机会，光剑刺入晶核核心，四色能量爆发，空间本源晶破碎，空间领主的躯体在空间扭曲中消散。随着晶核破碎，空间迷阵彻底瓦解，被卷入陷阱的战舰通过夹缝通道返回，联战军团朝着第三域——意识域进发。
意识域的环境更为诡异，整个域内没有实体星体，只有一片淡灰色的“意识迷雾”，迷雾能入侵生物的精神世界，让其陷入幻觉。联战军团进入意识域后，半数士兵出现幻觉，挥舞武器攻击同伴。“灵韵族、光韵族，精神屏障全开！”灵韵族的意识核心释放“精神净化波”，光韵族的精神引导者注入“光韵清醒能量”，两种能量融合成“精神守护场”，笼罩整个舰队。士兵们的幻觉逐渐消失，精神状态恢复稳定。苏瑶的探测器显示：“意识域的核心是‘意识本源晶’，位于意识迷雾的中央，意识领主能通过晶核操控迷雾，他的精神力量极强，能同时入侵万人的意识！”
银纹的精神共鸣传来：“意识迷雾中存在‘意识节点’，摧毁节点能削弱迷雾的浓度。但节点由‘意识祭司’守护，他们能将意识能量转化为实体攻击。”陈默立刻下令：“星律-光韵族构建‘精神干扰阵’，干扰意识祭司的能力；自然-神圣族构建‘生命圣光场’，增强众人的精神抗性；攻坚组与夹缝祭司联手，摧毁意识节点，突袭意识本源晶！”命令下达后，星律族的科伦与光韵族的伊洛挥动法杖，星脉与光韵能量交织成“精神干扰波”，意识迷雾的浓度明显降低；自然族的林羽与神圣族的翼卫释放绿色与金色能量，形成生命圣光场，众人的精神抗性大幅提升。
攻坚组在夹缝祭司的带领下，朝着意识节点推进。沿途的意识祭司释放“意识实体刃”，淡灰色的能量刃能直接攻击精神。“莉娅、凯伦，精神反击！”光韵族的两位引导者注入精神能量，形成“精神护盾”，挡住意识实体刃；陈默的起源平衡印释放“平衡精神能量”，净化着靠近的意识迷雾。众人先后摧毁十余个意识节点，意识迷雾的浓度降低至50%，意识本源晶的位置清晰可见。意识域的中央，一座由意识能量构建的“意识圣殿”悬浮着，圣殿中央的意识本源晶泛着淡灰色光芒，意识领主——一位身着意识雾甲、手持“意识入侵杖”的身影，正盘腿坐在晶核旁，他的周身环绕着无数“意识丝线”，连接着晶核。
“意识入侵·万念俱灰！”意识领主的入侵杖挥动，无数意识丝线朝着众人袭来，丝线接触到精神守护场后，试图穿透场域入侵众人意识。“灵韵族，精神反击波！”灵韵族的意识核心释放强烈的精神能量，将意识丝线反弹回去；银纹的夹缝杖释放“夹缝能量刃”，切断领主与晶核的连接。陈默的起源平衡剑注入三核与精神能量，剑刃泛着四色光芒，劈向意识本源晶。意识领主的雾甲爆发，化作巨型意识怪物，试图阻拦陈默。“三核图腾·狮啸破幻！”冬凌的图腾狮发出震天狮吼，金色能量冲击着意识怪物，怪物的躯体出现裂痕；寒的冰蚀矛冻结住怪物的四肢；阿混沌的裂解钻刺穿怪物的核心。陈默趁机刺入意识本源晶，晶核破碎，意识迷雾快速消散，意识领主的躯体化作灰烟。
接连突破三域后，联战军团的士气大振。在夹缝文明的支援下，众人又先后突破能量域、物质域、法则域——能量域中，能量领主试图吞噬联盟的三核能量，却被机械族的“能量反转装置”反弹，最终被陈默的净化能量击败；物质域中，物质领主瓦解联盟战舰的装甲，石灵族的“三核物质稳定锚晶”加固了战舰结构，林羽的生命能量修复着受损装甲，最终能量晶被摧毁；法则域中，法则领主扭曲三核能量的法则，星律族的科伦解读出法则纹路，与光韵族的伊洛联手构建“法则矫正阵”，矫正了能量法则，法则领主被联战军团合力击败。
七域中仅剩圣殿核心域尚未突破，当联战军团抵达域界边缘时，眼前的景象让众人震撼——圣殿核心域的中央，矗立着一座高达十万公里的“虚空本源圣殿”，圣殿由纯黑的“虚空晶石”构建，表面缠绕着能吞噬一切能量的“虚空本源能量流”；圣殿的周围，环绕着“七域联动阵”，阵眼由七颗被暗蚀的“域界本源晶”组成，晶核释放的能量形成巨型能量罩，保护着圣殿；阵外，七领主中的六位（除暗蚀领主外）率领百万艘战舰组成防御阵，舰身的能量波动是之前的三倍，显然已吸收了各域的本源能量。
“跨宇联盟的蝼蚁，竟敢闯到圣殿核心域！”六位领主的声音同时响起，手中的武器挥动，七域联动阵释放出巨型能量洪流，朝着联战军团袭来。“联战军团，三核夹缝联战盾展开！”陈默的起源平衡印与夹缝母晶树的能量联动，金蓝紫银四色能量交织成巨型护盾。能量洪流撞击护盾的瞬间，整个虚空之域都在颤抖，护盾的光芒快速暗淡。“银纹，夹缝通道绕后！”银纹的夹缝杖释放银色能量，在七域联动阵的后方打开一道巨型夹缝通道，联盟的五十艘暗蚀级战舰与夹缝族的三十艘战舰穿过通道，突袭六位领主的旗舰。
“攻坚组，突袭七域联动阵阵眼！”陈默带领攻坚组、银纹及五十名夹缝祭司乘坐突击舱，朝着阵眼的七颗域界本源晶飞去。突击舱的四色能量罩抵御着能量冲击，苏瑶的探测器标记出晶核的弱点；阿混沌的机械臂释放“晶核破解器”，破解晶核的防御符文；寒、冬凌、林羽清理着守护阵眼的虚空守卫；莉娜、凯尔、伊洛注入星律、光韵能量，干扰晶核的能量流动。陈默的起源平衡剑吸收四核能量，剑刃化作巨型光剑，先后劈开六颗被暗蚀的域界本源晶，只剩下最后一颗法则域的晶核。
“法则扭曲·能量禁锢！”法则领主突然出现在阵眼中央，扭曲杖挥动，陈默的光剑被能量禁锢，无法动弹。“虚空本源·吞噬！”其他五位领主同时注入能量，虚空本源圣殿释放出巨型虚空能量手，抓住突击舱。“银纹，夹缝母晶能量！”银纹的眉心夹缝晶核爆发，与夹缝主城的夹缝母晶树产生共鸣，银色的巨型能量流涌入陈默体内。陈默的起源平衡印与能量流融合，爆发出自创以来最强的能量：“四核凝序·万宇归衡！”金色的能量冲破禁锢，光剑劈开最后一颗晶核，七域联动阵彻底瓦解，能量罩消失。
六位领主见状，立刻融入虚空本源圣殿，圣殿的虚空本源能量流暴涨，释放出巨型能量束，朝着联战军团袭来。“所有舰队，能量注入起源号！”陈默的声音传遍舰队，五十艘暗蚀级战舰、三十艘夹缝战舰、二十艘星律光韵战舰的能量同时注入起源号，旗舰的三核凝序主炮释放出四色巨型能量柱，与圣殿的能量束碰撞。能量碰撞的瞬间，虚空本源圣殿的表面出现裂痕，六位领主的惨叫声从圣殿中传出。陈默抓住机会，带领攻坚组冲入圣殿内部，圣殿的中央，一颗直径万米的“万宇本源之心”悬浮着，表面缠绕着淡淡的金色能量，周围环绕着被封印的“虚空之主”的黑影，六位领主的躯体已被虚空本源能量吞噬，化作黑影的一部分。
“平衡守护者，你终于来了！”虚空之主的黑影释放出强烈的虚空能量，“只要吞噬万宇本源之心，我就能解封，统治所有宇宙！”陈默的起源平衡印与万宇本源之心产生强烈共鸣，金色能量顺着印体流入陈默体内：“虚空之主，你的统治妄想，今天就结束了！”陈默的起源平衡剑吸收万宇本源之心的能量，剑刃泛着纯净的金色光芒，朝着黑影劈去。黑影释放出虚空能量抵抗，两种能量碰撞的瞬间，整个虚空之域的能量都在重组，万宇本源之心的光芒覆盖整个虚空之域，暗蚀能量被快速净化。
当光芒消散时，虚空之主的黑影被封印回万宇本源之心内，六位领主的躯体化作能量粒子，虚空本源圣殿的虚空晶石逐渐转化为金色的本源晶石。联战军团的士兵们欢呼雀跃，陈默走到万宇本源之心前，手掌轻轻触碰晶核，一段古老的意识流传入脑海：“万宇本源之心是所有宇宙的能量源头，虚空之主是本源能量的负面产物，需由平衡守护者定期净化。下次封印松动，将在千年之后，届时需万宇文明共同守护。”
战斗结束后，联盟与夹缝文明在虚空本源圣殿召开“万宇联盟成立大会”，夹缝文明正式加入联盟，虚空之域被改造为“万宇本源枢纽”，由联盟各派精英驻守。机械族的工程师们用净化后的虚空晶石改造战舰，石灵族的工匠们构建“万宇锚晶阵”，稳定虚空之域的空间结构；自然族的精灵们培育“万宇生命之树”，扎根在圣殿周围；神圣族的翼卫们净化着残留的虚空能量；星蕴、灵韵、星律、光韵族构建“万宇预警网络”，监测虚空之主的封印状态。
一个月后，万宇联盟的第一支“万宇探索舰队”启航，舰队由联盟各种族的精英组成，目标是探索未知的宇宙，吸纳更多文明加入联盟。陈默站在起源号的舰桥，看着窗外的金色虚空之域，掌心的起源平衡印与万宇本源之心同步闪烁。寒、冬凌、林羽、阿混沌、苏瑶、伊洛、科伦、银纹站在他身边，八人的手掌叠在一起，金色的能量直冲云霄。“平衡之道，万宇同心。”陈默的声音传遍舰队，“探索之路，永不停止；守护之责，万宇共担！”起源号的引擎轰鸣，朝着未知的宇宙驶去，身后的万宇本源枢纽释放出金色光芒，照亮了整个虚空之域——万宇文明的新篇章，就此开启。