两天的寻晶任务结束后，联盟舰队完成了最后的战前准备。永恒级战舰的“本源秩序炮”已装载了两枚秩序之心碎片的能量；机械族的攻坚工程舰修复了堡垒的防御系统，加装了数十门凝序净化炮；石灵族的锚晶堡垒舰在堡垒周围构建了“秩序锚晶阵”，能稳定空间，阻止寂灭能量的侵蚀；自然舰队培育出大面积的“抗寂灭生命林”，环绕在堡垒周围，提供源源不断的生命能量；神圣舰队的圣光舰释放出“圣光秩序场”，与堡垒的防护盾融合，形成金白交织的双层防护；星蕴舰队的定位晶锁定了圣树核心的位置，标记出寂灭领主的坐标；灵韵舰队的意识核心与所有联盟成员建立了精神连接，能实时共享战场信息。
第三天清晨，联盟舰队朝着圣树核心区域进发。沿途的寂灭云越来越浓郁，寂灭电弧的频率也越来越高，永恒级战舰的能量反哺护盾不断吸收着寂灭能量，护盾的光芒越来越亮。当舰队抵达圣树核心时，眼前的景象让众人震撼——枯萎的秩序圣树虚影高达百万公里，主干被墨黑色的寂灭能量贯穿，形成一道巨型能量柱，能量柱的顶端，漂浮着第三枚秩序之心碎片，碎片的周围，站着一位身着墨黑色寂灭铠甲、手持“寂灭吞噬杖”的身影——虚无寂灭领主。他的躯体由纯粹的寂灭能量构成，没有固定的形态，体表不断流淌着能吞噬光线的墨色能量，头部是两颗闪烁着银灰色光芒的侵蚀眼，能看透一切能量的流动。
“跨宇联盟的蝼蚁，竟敢觊觎秩序之心！”寂灭领主的声音充满了虚无的嘶吼，手中的寂灭吞噬杖挥动，一道巨型寂灭能量束朝着联盟舰队袭来，能量束所过之处，连空间都被彻底吞噬，形成一道黑色的轨迹。“永恒级舰队，本源秩序炮反击！”陈默的起源平衡印释放出两枚秩序之心碎片的能量，融入起源号的本源秩序炮，炮口凝聚出银白色的巨型能量束，与寂灭能量束碰撞。两道能量束碰撞的瞬间，整个宇宙都在剧烈震动，寂灭能量被秩序能量不断净化，化作无数的能量粒子，本源秩序炮的能量束逐渐占据上风，击中寂灭领主的铠甲，铠甲上出现一道裂痕。
“寂灭云，同化！”寂灭领主的身体融入贯穿圣树的能量柱，整个寂灭云开始剧烈翻滚，无数的寂灭生物从云中涌出，朝着联盟舰队袭来，数量多达数万只。“各舰队执行防御阵型！”陈默的命令通过精神连接传遍舰队，永恒级舰队形成环形防御圈，本源秩序炮不断开火，净化着靠近的寂灭生物；平衡级战舰的凝序净化炮形成密集的火力网，阻止生物突破；后卫舰队的能量屏障链不断加固，生命能量、圣光能量、星蕴能量、灵韵能量交织成七彩光芒，净化着漏网的寂灭生物。
“攻坚组，随我潜入圣树核心！”陈默带领攻坚组和艾瑞乘坐登陆舱，朝着圣树的主干飞去。圣树的主干表面布满了寂灭能量形成的触手，触手不断攻击登陆舱，林羽的抗寂灭生命藤缠绕住触手，将其净化；寒的冰控能量冻结住主干的表面，阻止触手再生；阿混沌的机械臂变形为秩序裂解锯，在主干上开辟出一道通道；登陆舱顺着通道驶入圣树内部，抵达核心区域。
圣树核心是一个巨大的能量空间，空间的中央，第三枚秩序之心碎片悬浮在半空中，周围环绕着一道由寂灭能量构成的巨型屏障，屏障的顶端，寂灭领主的身影正漂浮着。“你们以为能进入核心就赢了吗？”寂灭领主的寂灭吞噬杖挥动，空间中出现无数的寂灭触手，朝着众人袭来。艾瑞的秩序权杖释放出白光，形成一道秩序屏障，挡住触手的攻击：“圣树的核心有‘秩序本源场’，在这里，秩序能量会大幅增强，寂灭能量会被压制！”陈默的起源平衡印释放出两枚碎片的能量，与秩序本源场产生共鸣，空间中浮现出无数的秩序符文，符文融入众人的武器，武器的光芒瞬间增强。
“冬凌，图腾阵封锁空间！”冬凌的图腾骨插入地面，橙色的跨宇图腾阵与秩序本源场融合，形成一道金橙银三色交织的能量场，将寂灭领主的活动范围限制在屏障周围。“寒，冻结屏障！”寒的冰控能量融入秩序能量，化作无数银白色的冰刺，刺入屏障的表面，屏障的能量流动明显减缓。“阿混沌，秩序裂解炮！”阿混沌的机械臂展开秩序裂解炮，炮束击中屏障的能量节点，屏障出现裂痕。“林羽，生命能量修复圣树！”林羽的抗寂灭生命藤顺着圣树的主干蔓延，绿色的生命能量不断修复着被寂灭能量侵蚀的枝干，圣树的虚影逐渐变得清晰，散发出淡淡的白光。
陈默抓住机会，朝着屏障冲去，起源平衡剑劈出一道巨型能量斩，劈开屏障的裂痕，冲进屏障内部。寂灭领主的寂灭吞噬杖朝着陈默刺来，杖尖的寂灭能量形成一道小型黑洞，试图吞噬陈默的能量。陈默的起源平衡印释放出两枚秩序之心碎片的能量，形成一道银白色的能量盾，挡住黑洞的吞噬。“你的秩序能量确实能克制我，但我的寂灭能量是‘虚无本源’，能吞噬一切！”寂灭领主的身体膨胀，化作一道巨型寂灭能量体，将陈默包裹其中，能量体内部的寂灭能量不断吞噬着陈默的能量，起源平衡印的光芒逐渐暗淡。
“陈默！”众人发出惊呼，林羽的生命能量顺着圣树的枝干涌入能量体，绿色的能量不断修复着陈默的伤势；寒的冰控能量融入秩序能量，冻结住能量体的表面，阻止寂灭能量的进一步吞噬；冬凌的秩序图腾阵释放出橙色能量，与陈默的能量产生共鸣；阿混沌的秩序裂解炮不断轰击能量体，试图打开缺口；灵韵之主的意识核心释放出精神能量，干扰着寂灭领主的意识；艾瑞的秩序权杖释放出圣树的本源能量，融入能量体，增强陈默的秩序能量。
能量体内部，陈默的身体被寂灭能量不断侵蚀，意识开始变得模糊，但起源平衡印中的两枚秩序之心碎片与第三枚碎片产生了强烈共鸣，第三枚碎片的能量顺着圣树的本源能量涌入印体。“秩序归源·平衡永恒·寂灭净化！”陈默的吼声震彻整个秩序宇宙，起源平衡印爆发出前所未有的银白色光芒，三枚秩序之心碎片在印中融合，形成一颗完整的“秩序之心”，印体与秩序之心、混沌本源核心彻底融合，形成一道贯穿天地的“终极归序光束”。光束从寂灭能量体内部爆发，寂灭领主发出痛苦的嘶吼，身体被彻底净化，化作无数的秩序能量粒子。
终极归序光束击中秩序圣树的主干，被寂灭能量侵蚀的枝干开始快速修复，枯萎的树叶重新抽出嫩芽，圣树的虚影逐渐变得实体化，散发出浓郁的秩序能量。圣树的顶端释放出一道巨型秩序能量场，覆盖整个秩序宇宙，墨黑色的寂灭云开始快速消散，被吞噬的区域重新恢复光明，残破的秩序建筑残骸开始自我修复，无数被寂灭能量侵蚀的秩序生物恢复了原本的形态，朝着联盟舰队发出友好的意识波动。
战斗结束后，联盟舰队在秩序宇宙的中心建立了“跨宇秩序枢纽”，用秩序之心和混沌本源核心的能量构建了“跨宇平衡场”，能实时监测周边宇宙的能量平衡状态。艾瑞带领秩序宇宙的幸存者开始重建家园，陈默将起源平衡印中的秩序之心能量注入秩序圣树，圣树的能量场进一步增强，能为周边的宇宙提供稳定的秩序能量。机械族的工程师们帮助秩序生物修复建筑，石灵族的工匠们在秩序宇宙的边缘构建了“跨宇锚晶阵”，自然维度的精灵们培育出能适应秩序宇宙的生命植物，神圣舰队的翼卫们净化着残留的寂灭能量，星蕴和灵韵舰队则构建了连接秩序宇宙与其他友好宇宙的跨宇通道。
在联盟舰队返回维度宇宙的途中，陈默的起源平衡印突然亮起，秩序圣树的能量投射出一道覆盖整个跨宇星图的光芒，星图上所有友好宇宙的坐标都闪烁着白光，形成一道“跨宇平衡网络”。艾瑞的意识流传入陈默的脑海：“秩序之心与混沌本源核心融合后，跨宇平衡场已覆盖所有友好宇宙，今后不会再有大规模的能量失衡危机。但在跨宇平衡网络的边缘，还存在着无数未被探索的未知宇宙，那里可能有新的文明，也可能有新的危机——跨宇平衡守护者的使命，是探索与守护并存。”
陈默站在起源号的舰桥，看着星图上闪烁的无数坐标，眼中闪过坚定。联盟各维度的使者通过通讯频道传来声音：“无论你决定前往哪里，我们都将与你并肩作战！”机械族的舰长表示会建造能进行超远距离探索的“探索级跨宇战舰”；石灵族的首领表示会在未知宇宙的边缘构建“临时锚晶堡垒”；自然维度的精灵会培育能适应未知环境的“适应性生命植物”；神圣维度的翼卫会炼制能抵御未知能量的“圣光探索卷轴”；星蕴和灵韵族会构建“未知宇宙预警网络”，实时监测未知区域的能量波动。
当起源号驶入维度宇宙的边界时，迎接他们的是各维度生物组成的盛大欢迎庆典。冰棱古墟的跨宇守护塔顶端，起源平衡印的光芒与跨宇平衡核心的光芒融合，形成一道七彩的光柱，直冲云霄。陈默站在塔顶端，看着下方欢庆的人群，感受到掌心起源平衡印的温暖跳动，他知道，跨宇平衡守护者的使命远未结束，但只要联盟同心，就能应对任何未知的挑战。
三个月后，跨宇守护联盟召开了第三次全员大会，大会上确定了“跨宇探索计划”：联盟将组建十支跨宇探索舰队，每支舰队由永恒级战舰、探索级战舰、补给舰组成，配备各维度的精英成员，前往未知宇宙进行探索，同时传播跨宇平衡的理念，吸纳新的友好文明加入联盟。陈默在大会上发表讲话：“平衡不是静止的，是在探索中不断维系的；守护不是封闭的，是在团结中共同实现的。我们的联盟，将成为跨宇文明交流的桥梁，成为宇宙和平的守护者！”
大会结束后，陈默独自一人来到镇锚寒晶的顶端，看着天空中交织的无数跨宇通道。寒、冬凌、林羽、阿混沌、苏瑶走到他身边，六人并肩而立，眼中都闪烁着对未知的期待。陈默的起源平衡印再次亮起，一道新的未知宇宙坐标浮现在空中，坐标旁标注着“友好文明信号”。陈默的嘴角扬起微笑，他知道，新的探索之旅即将开始。
一周后，十支跨宇探索舰队在维度枢纽广场集结。起源号作为旗舰，舰身的秩序平衡装甲泛着银白色的光芒，舰首的本源秩序炮已完成充能。陈默站在舰桥，看着下方挥手告别的人群，握紧了手中的起源平衡剑：“跨宇探索舰队，出发！”舰队的引擎同时轰鸣，朝着新的未知宇宙驶去，身后的跨宇通道如彩虹般延伸，照亮了通往未来的道路——跨宇平衡的故事，还在继续。