返回星核方舟后，跨维联盟的医疗团队立刻对队员们进行治疗 —— 苏瑶的九源生命草释放出治愈光粒，快速修复陈默与赵阳的伤口；星核维度的机械师则对突击舰与双解析系统进行全面修复，确保下次任务能正常执行。凌越与其他维度的首领则围绕 “十二本源能量图谱” 展开讨论，制定新的探索计划。
“根据图谱显示，剩余的光明、黑暗、虚空三源，分别藏在宇宙深渊的‘光明封印层’‘黑暗封印层’‘虚空封印层’。” 凌越的星核长枪释放出淡金色的能量，在屏幕上勾勒出宇宙深渊的三层结构，“每层封印都有‘远古守护兽’守护，实力远超之前的超维指挥官，而且需要对应的本源能量才能打开封印，比如光明封印层需要光明本源的钥匙，黑暗封印层需要黑暗本源的钥匙，虚空封印层需要虚空本源的钥匙，这些钥匙藏在已知的九个维度中。”
自然维度的 “自然领主”（人身绿植，体表覆盖淡青的自然能量，手持自然法杖）率先发言：“自然维度的古老遗迹中，藏有‘光明钥匙’的线索，根据遗迹记载，钥匙与‘自然之树’的核心能量相关，需要用九源能量激活自然之树，才能获取钥匙。”
金属维度的 “金属领主”（身体由淡灰的金属构成，手持金属战锤）补充道：“金属维度的‘金属神殿’中，有‘黑暗钥匙’的下落，钥匙被‘金属守护兽’保护，只有通过金属神殿的‘金属试炼’，才能获得守护兽的认可，拿到钥匙。”
灵魂维度的 “灵魂领主”（身体由淡白的灵魂能量构成，手持灵魂权杖）则说：“灵魂维度的‘灵魂深渊’中，藏有‘虚空钥匙’，钥匙与远古跨维联盟的灵魂战士意识绑定，需要唤醒战士的意识，通过‘灵魂考验’，才能获取钥匙。”
陈默的多元刃与十二本源能量图谱产生共鸣，剑身上的九源能量释放出淡金、暗黑、深紫三色光粒 —— 分别对应光明、黑暗、虚空三源的能量波动。“我们需要分三路行动，同时寻找三把钥匙，节省时间。” 他的眼神坚定，“我带领一队前往自然维度，寻找光明钥匙；赵阳带领二队前往金属维度，寻找黑暗钥匙；苏瑶带领三队前往灵魂维度，寻找虚空钥匙；林羽则留在星核方舟，继续分析宇宙深渊的封印数据，为后续探索做准备。”
凌越批准了陈默的计划，为三支队伍配备了最新的 “十二源探测仪” 与 “十二源防御装备”—— 探测仪能精准定位钥匙的位置，防御装备则能抵御远古守护兽的攻击，同时配备了 “跨维通讯器”，确保三支队伍能随时共享信息，相互支援。
三天后，三支队伍分别乘坐 “十二源探索舰”，朝着各自的目标维度飞去 ——
陈默的一队前往自然维度：自然维度的表面覆盖着茂密的 “自然森林”，森林中央的 “自然之树” 高达万米，树干上缠绕着淡青的自然能量，树冠能释放出覆盖整个维度的 “自然防护网”。探索舰降落在自然之树的底部，自然领主早已等候在那里，手中拿着 “自然之树激活仪式” 的古老卷轴：“激活自然之树需要九源能量与自然本源能量的融合，仪式过程中会出现‘自然守护兽’，只有通过守护兽的考验，才能获取光明钥匙。”
赵阳的二队前往金属维度：金属维度的表面是一望无际的 “金属平原”，平原中央的 “金属神殿” 由纯金属构成，神殿周围环绕着 “金属风暴”，风暴中的金属碎片能穿透普通的防御装备。金属领主带领二队穿过金属风暴，来到神殿入口：“金属试炼分为三关，分别考验‘力量’‘技巧’‘意志’，每关都有金属守护兽把守，只有全部通过，才能获得黑暗钥匙。”
苏瑶的三队前往灵魂维度：灵魂维度的表面是淡白的 “灵魂云海”，云海下方的 “灵魂深渊” 中，漂浮着无数沉睡的灵魂战士意识。灵魂领主带领三队来到深渊边缘：“唤醒灵魂战士需要九源能量与灵魂本源能量的融合，战士醒来后会提出三个关于‘守护’的问题，只有回答正确，通过灵魂考验，才能获取虚空钥匙。”
星核方舟的观测台上，凌越与林羽望着三支队伍消失的方向，表情严肃。“千年的时间，我们必须争分夺秒。” 凌越的星核长枪释放出淡金色的光粒，“希望他们能顺利获取钥匙，早日集齐十二本源能量，加固超维始祖的封印，守护所有维度的未来。”
林羽的双解析系统则与三支队伍的探测仪连接，实时显示他们的进度 —— 陈默的一队已开始激活自然之树，自然之树的树干逐渐亮起；赵阳的二队已进入金属神殿，正在接受第一关力量考验；苏瑶的三队已唤醒第一个灵魂战士，正在回答考验问题。屏幕上的十二本源能量图谱，随着三支队伍的进展，逐渐亮起对应的符文，预示着跨维联盟离最终目标越来越近。
但就在此时，林羽的双解析系统突然捕捉到一道异常的超维信号，信号来自宇宙深渊的方向，带着超维始祖的气息，却比之前更加强烈。“超维始祖的能量波动正在增强！” 他快速分析信号，“似乎是因为我们获取了十二本源能量图谱，刺激到了它的苏醒进程，千年倒计时可能会提前！”
凌越的脸色瞬间变得凝重，他立刻通过跨维通讯，将这一消息传递给三支队伍：“超维始祖的苏醒可能提前，加快获取钥匙的速度，我们没有太多时间了！”
陈默的多元刃加快注入九源能量，自然之树的激活速度大幅提升，树干上的符文全部亮起，树冠中突然出现 “自然守护兽” 的身影 —— 那是只由自然能量构成的巨鹰，翅膀展开超过百米，能释放出 “自然风暴”，实力相当于超维指挥官的两倍。“准备战斗！” 陈默握紧多元刃，九源能量在剑身上凝聚，准备迎接新的挑战。
赵阳的铁甲犀牛则在金属神殿的第一关，与 “金属力量守护兽” 展开激战 —— 守护兽是只由金属构成的巨熊，力量是赵阳的三倍，却在他的九源土石能量面前逐渐落于下风，犀角的土石锤正不断击中守护兽的核心，金属碎片在神殿中飞溅。
苏瑶的三队则成功回答了灵魂战士的第一个问题，战士的意识释放出淡白的灵魂能量，为虚空钥匙的获取增加了一分希望。她的九源生命草释放出治愈光粒，帮助队员们恢复能量，准备迎接接下来的两个问题。
跨维联盟的新征程已经开启，十二本源能量的收集之路充满挑战，但所有人都没有退缩 —— 他们的初心是守护所有维度，即使面对超维始祖的提前苏醒，即使前方有更强大的敌人，也会坚定地走下去，直到彻底阻止维度吞噬，迎来宇宙的永久和平。