小寒时节，幽冥殿主遭反噬重伤遁走。但他在逃亡前种下恶咒，令村中井水泛毒。此后每逢月缺之夜，必有村民魂体不稳。
大寒朔风，刘镇南发现唯有特定安魂草能解此咒。于是带领村民广植魂草，将青牛村变成安魂福地。魂草日夜生长，恶咒渐失效用。
立春清晨，第一株安魂草开花时，天降七彩霞光。光中走出一位魂袍老者，正是药神谷当代谷主。他感念村民守护魂道，欲授刘镇南炼魂秘术。
雨水时节，刘镇南婉拒谷主美意。他选择留在青牛村，继续钻研安魂之道。谷主临行前留下药神谷传承，并告知幽冥殿正在各地作乱，更大的劫难即将来临。
惊蛰春雷，刘镇南在魂井边静坐九日。第九日井水倒映北斗移位，水底浮出一块养魂玉。玉中封存着林素衣的一缕命魂，以及幽冥殿下一步的阴谋。
芒种午夜，刘镇南炼丹时忽感心悸。丹炉中的安魂丹竟渗出黑血，炉壁浮现狰狞鬼面。他取林素衣留下的验魂符贴于炉身，符纸触邪即燃，燃起的青烟显出一道残缺阵图。
夏至黎明，村中所有修士同时魂魄震荡。白芷御剑而来，剑尖挑破虚空露出阵眼。二人循迹追踪至后山寒潭，发现潭底沉着半面摄魂幡。幡中困着数百生魂，正是近日失踪的村民。
大暑三更，幡中怨魂突然暴动。白芷取出定魂罗盘，指针疯狂旋转指向村祠堂。刘镇南破开祠堂地砖，发现砖下埋着九具青铜棺，每具棺椁都刻着不同的噬魂咒文。
立秋薄暮，正当二人欲解咒时，幽冥殿高手突然现身。黑袍人冷笑，两个小辈，正好做阵眼。危急时刻，养魂玉突放清光，林素衣残魂显现，以最后魂力助他们看清阵法破绽。
寒露子时，刘镇南依循破绽，以自身为引，将安魂丹力注入阵眼。白芷同时祭出九九八十一根定魂针，针落阵破，数百生魂得释。但阵破的反噬也让刘镇南魂魄受损，昏迷三日。
霜降拂晓，刘镇南在梦中见到林素衣完整的命魂。原来她当年为护青牛村，将一魂一魄散入地脉。如今需集齐三样圣物，千年养魂木，万年定魂珠，以及真心泪，方能助她重聚魂魄。
此后三月，刘镇南与白芷踏上寻物之旅。他们在幽冥涧找到养魂木，在九天之上取得定魂珠，唯独真心泪难以寻觅。直至月圆之夜，刘镇南望着林素衣消散之地落泪，泪珠滴入养魂玉，竟使玉中残魂重凝。
然福兮祸所伏，魂魄重聚的异象引来了幽冥殿主。此次他携镇宗之宝万魂鼎而来，誓要炼化这一缕完整魂体。青牛村上空，黑云压城，最终决战即将展开。
决战前夜，刘镇南独坐老槐树下。月光透过枝叶，在他掌心投下斑驳光影。他想起林素衣生前最爱在这树下捣药，那时她总说草木有灵，万物有情。如今槐树依旧，人已难寻。
子时三刻，养魂玉突然发热。玉中浮现林素衣模糊的身影，她指向村南荒冢，唇瓣微动似在诉说什么。刘镇南福至心灵，连夜掘开荒冢，发现冢下竟埋着一卷药神谷失传的《渡魂经》。
经中记载，欲破万魂鼎，需以真心为引，以善念为火，重燃轮回灯。而轮回灯的核心，正是养魂木与定魂珠融合所化的同心结。此法凶险万分，施术者可能魂飞魄散。
黎明时分，幽冥殿大军压境。万魂鼎悬于云端，鼎中冤魂哀嚎不绝。刘镇南将养魂木与定魂珠置于心口，以心血温养。白芷率村民布下七星护魂阵，为他争取时间。
正午烈日当空，万魂鼎倾泻而下。刘镇南猛然睁眼，心口飞出七彩光华。光华与鼎气相撞，天地为之震颤。僵持之际，养魂玉突然碎裂，林素衣的残魂化作青烟，融入光华之中。
光华骤盛，如旭日东升。万魂鼎寸寸碎裂，幽冥殿主惨叫遁走。而刘镇南抱着养魂玉的碎片，跪倒在老槐树下。碎片中，一缕微弱的魂火轻轻跳动，仿佛故人未远。
此后每年惊蛰，老槐树都会开出银白花朵。村人说，那是药灵娘子回来看望她守护的这片土地。而刘镇南依旧每日采药炼丹，只是眼中多了几分沧桑，几分期许。
青牛村的炊烟依旧袅袅升起，药香弥漫的村庄里，新的故事正在悄悄萌芽。