就在林星于北海道的深山中潜心修行，梳理自身力量与情感的同时，外面的世界并未停止运转。KOF98大赛以卢卡尔被击败、草薙京被S掳走的惨烈结局收场，余波仍在格斗界乃至更广阔的黑暗中回荡。
南镇，某酒吧。
特瑞·博加德将帽子压得很低，面前摆着一杯几乎没动过的啤酒。东丈在一旁喋喋不休地抱怨着最近的无聊，而安迪则显得比以往更加沉默，眼神中带着化不开的忧郁和一丝自责——不仅因为大赛的失利，更因为不知火舞那日病房里的泪水和质问。
“听说最近有些不太平。”特瑞忽然开口，打断了东丈的絮叨，他抬起头，眼神锐利，“有几个不太出名的格斗家，最近莫名其妙地失踪了。”
“失踪？”东丈愣了一下，“不会是输不起躲起来了吧？”
“不像。”特瑞摇头，“其中有一个，是我认识的一个挺硬气的小子，不会轻易认输。而且，失踪得很彻底，一点线索都没有。”
安迪也抬起了头，眉头微蹙。格斗家失踪，这可不是小事。他们本能地联想到了那个神秘而危险的S组织。
神乐财团，密室。
神乐千鹤与哈迪伦相对而坐，中间的茶几上摆放着一些零散的情报文件。
“确认了，失踪的格斗家数量在增加，而且手法干净利落，不像普通势力所为。”哈迪伦指着文件上的照片和数据，语气沉重，“我们追踪到一些蛛丝马迹，最终都指向了S。”
“他们抓走京还不够，现在又开始对其他的格斗家下手了吗？”神乐千鹤面若寒霜，八咫镜放在膝上，散发着微光，“他们的目的究竟是什么？”
“根据我们目前掌握的情报，S似乎在推进一个名为‘Project Y’的计划，具体内容不详，但可以肯定与基因改造和人体强化有关。这些失踪的格斗家，很可能成为了他们的‘实验素材’。”哈迪伦的声音带着压抑的怒火。
世界各地的格斗家圈子。
类似的传闻开始悄然流传。除了那些彻底失踪的，还有一些格斗家声称遭到了不明身份、装备精良的战斗人员的袭击，对方目的明确，似乎是为了测试他们的实力，或者采集数据。一股不安的暗流在格斗界涌动。
极限流空手道场。
坂崎良刚刚结束与一名弟子的对练，由莉急匆匆地跑了过来，手里挥舞着一封华丽的信函。
“哥！又来了！KOF的邀请函！”