苏小蕊在地府的“观景台”上，一边嗑着瓜子，一边将目光投向《生化危机》世界更早的时间线。那里，一场由保护伞公司自身引发的灾难正悄然拉开序幕，而这个世界的“原生主角”爱丽丝的故事，也正从一片迷茫中开始。
说是灾难拉开序幕，其实只是保护伞对克隆体进行的记忆重现，主角爱丽丝本人此刻正躺在实验室的床上。
爱丽丝在一间奢华却陌生的浴室中缓缓醒来。冰冷的大理石地面刺激着她的皮肤，剧烈的头痛让她蹙紧眉头。她茫然地环顾四周，华丽的浴缸、镀金的水龙头、朦胧的镜子…一切都显得那么陌生。
“我是谁？这是哪里？”她捂住额头，脑海中只有一片空白和些许令人不安的碎片幻影——红色的警报、刺耳的尖叫、冰冷的玻璃容器…
她身上只裹着一件洁白的浴袍。
踉跄着走出浴室，她发现这栋别墅空无一人，寂静得可怕。一种本能的危机感萦绕着她。她发现自己身体异常敏捷，力量也远超普通女性，但对这些能力的来源毫无记忆。
突然，别墅外侧传来轻微的响动！
爱丽丝警惕地躲到窗帘后，只见一队身着黑色作战服、装备精良、行动矫健的人员正破窗而入！他们战术手势干练，枪口警惕地扫视着每一个角落。
同时，另一个方向，一个穿着环保t恤、神情紧张警惕的年轻男子（马特·艾迪森）也被这队人发现并迅速制服，按在了地上。
“发现目标！爱丽丝·安布雷拉！还有一名闯入者！”为首的队员雷恩·奥坎波通过头盔通讯汇报道。
“带走他们！动作快！”另一个声音传来，是队员詹姆斯·薛德。
爱丽丝和马特被这支U.S.S.（安布雷拉快速反应安全部队）特遣队迅速控制、戴上手铐，押解出了别墅。爱丽丝试图挣扎，却发现对方训练有素，力量极大。
“你们是谁？这是怎么回事？”爱丽丝质问。
“安静！到了地方你自然会知道！”雷恩冷冰冰地回应。
特遣队押着两人，通过别墅隐藏的入口，进入了一座通往地下的高速列车站台。列车启动，向着地底深处疾驰。
途中，爱丽丝的记忆开始零星闪回——她似乎认识那个叫马特的人，他们好像计划要揭露什么…还有那个红白相间的标志（安布雷拉Logo）…
列车到达终点——一座极具未来科技感、标识着“蜂巢（the hive）”的地下大型研究设施入口。但这里异常寂静，所有工作人员都仿佛…消失了。
“我们的任务是进入蜂巢主机房，关闭失控的人工智能‘红后’。”詹姆斯·薛德向队员们以及两个“俘虏”简要说明情况，“红后封锁了蜂巢，并杀死了所有工作人员。原因不明。”
特遣队技术员利用设备强行打开了通往蜂巢内部的气密门。
门开的瞬间，一股混合着消毒水和…淡淡腐臭的气息扑面而来。
蜂巢内部，灯光忽明忽暗，应急红灯旋转，地上偶尔可见散落的文件和…触目惊心的血迹！但依旧没有尸体。
特遣队谨慎地推进，爱丽丝和马特被夹在中间。他们穿过办公区、实验室、来到一条被水淹没的走廊（b餐厅管道泄漏）。
就在这里，恐怖的一幕发生了！
一具穿着白大褂的“尸体”突然从浑浊的水中浮起，猛地扑向最近的队员！