联盟看中了玄骨界的灵魂技术和微观灵械技术，这可能对“人工智能器灵进化”、“纳米修复机器人”的智能化、乃至理解“反物质”的负能量属性有巨大启发。而玄骨界则对联盟的“丹道”、“大规模灵力应用”和“空间技术”垂涎已久，这能极大改善其族群的“灵骸”续航、能量来源和活动范围。
经过艰苦的外交磋商，第一个“玄骨-流云联合高等研究院” 在位于两界交界处的、新建设的“万法边疆”中立区正式成立。研究院由林枫担任联盟方院长，玄骨界的首席灵械宗师“骸骨大公”担任对方院长。
合作伊始，差异带来的冲击远超想象。
联盟的科学家习惯用数据、模型、可重复实验来验证一切；而玄骨界的学者则更依赖灵魂直感、幽能共鸣和某种难以言传的“工艺美学”。联盟的丹师试图用灵力模型分析“灵骸”的能耗曲线；玄骨界的匠师则觉得联盟的丹药充满“野蛮的生命力”，与他们的“死寂美学”格格不入。第一次联合设计一种能同时兼容灵力和幽能的“双能源核心”时，双方团队吵得不可开交，联盟方认为玄骨界的结构过于复杂脆弱，玄骨界则嘲笑联盟的设计“毫无灵魂的韵律感”。
转机出现在一次意外。研究院的一台高精度“幽能探测灵械”在调试中突然失控暴走，其释放的狂暴幽能不仅干扰了所有灵能设备，更开始侵蚀研究人员的神魂！联盟的“力场护盾”在幽能面前效果大减，常规丹药也无法化解神魂侵蚀。危急关头，玄骨界的“骸骨大公”出手了。他没有使用任何复杂仪器，而是徒手（灵骸之手）插入幽能乱流中，凭借其精妙绝伦的灵魂编码技术，如同解开一团乱麻般，精准地找到了失控的核心灵魂印记，并将其瞬间“格式化”！危机解除，但联盟方多位研究员神魂受损。
就在联盟方束手无策时，苏晓带领的医疗团队到了。他们没有使用传统的安神丹药，而是带来了最新研发的、基于“灵植基因库”和“纳米机器人”技术的“生机唤魂液”。这种药剂并非强行镇压或修复，而是释放出特殊的生命信息素，引导受损的神魂进行“自我溯源”和“有序生长”。同时，微小的纳米机器人携带修复因子，直接作用于神魂损伤的微观结构。几天后，受损研究员纷纷痊愈，甚至感觉神识比之前更加凝练！
这次意外，让双方都亲眼目睹了对方技术的不可思议之处。玄骨界震惊于联盟对“生命”和“物质”的精妙操控，联盟则叹服于玄骨界对“灵魂”和“能量”的本质理解。隔阂在共同的战斗中消融，真正的尊重开始建立。
合作由此步入快车道。联盟的“人工智能器灵”专家，与玄骨界的“灵魂编码师”坐在一起，尝试将逻辑算法与灵魂直感结合，开发拥有更强“直觉”和“创造性”的新一代器灵。玄骨界的“微观灵械”大师，则对联盟的“纳米修复机器人”产生了浓厚兴趣，试图将灵械的极致精度与纳米机器人的集群智能结合，制造出能进行分子级别操作的“万能工蜂”。
最大的突破，来自于对“能量本质”的联合研究。联盟的科学家一直无法理解“幽能”这种负能量的稳定存在和利用方式，而玄骨界也对灵力的“活性”与“生长性”感到困惑。在一次高风险的理论碰撞中，一位年轻的联盟灵能物理学家大胆提出：“或许，灵力和幽能并非截然对立，而是同一‘本源能量’在不同规则下的两种‘相态’！就像水的固态和液态！” 这一想法得到了玄骨界一位理论家的呼应，他们联想到玄骨界古籍中关于“生死轮转，能量一体”的记载。
双方联合团队废寝忘食，利用研究院最先进的“规则模拟场”，尝试构建一个能同时容纳灵力和幽能的统一模型。无数次失败后，他们终于发现了一种极其罕见的“时空褶皱”效应，在这种效应下，灵力和幽能表现出惊人的对称性和可转换性！虽然距离实际应用还遥不可及，但这理论上的突破，为未来开发出同时利用正负能量的“混沌炉心”提供了可能，其意义不亚于当年发现核聚变！
“玄骨-流云联合研究院”的成功，产生了巨大的示范效应。看到实实在在的好处，其他位面文明也纷纷向联盟抛来橄榄枝。与“晶歌丛林”（植物文明）合作研究“灵植基因的宇宙适应性”，与“熔岩之心”（元素文明）合作探索“极端环境下的材料合成”，与“虚空鲸族”（星空巨兽文明）合作进行“超远距离心灵感应”研究……
一个以联盟为核心、连接多个位面文明的 “跨位面科技合作网络” 初具雏形。知识、技术、人才以前所未有的速度和广度流动、碰撞、融合。联盟的科技树，不再是单一主干的疯狂生长，而是生出了许多充满异域风情的、可能性无限的枝杈。联盟的文明视野，也被极大地拓宽了。
然而，在这片繁荣合作的景象之下，林枫和苏晓却保持着异常的清醒。合作越深入，接触的文明越多，他们越感觉到宇宙的深邃与莫测。玄骨界在灵魂领域的造诣令人惊叹，但其社会结构的高度集权和个体意识的淡漠，也让人不安；晶歌丛林的植物网络智慧超群，但其缓慢的思维模式和与人类迥异的价值观，沟通起来障碍重重。
更重要的是，随着合作范围的扩大，联盟无可避免地会接触到更强大、更古老、甚至可能抱有敌意的文明。当前的合作对象，大多是实力弱于或与联盟相当的文明。一旦遇到科技水平远高于联盟的文明，当前的合作模式是否还能适用？“平等互利”是否会变成“与虎谋皮”？
就在“跨位面科技合作”如火如荼地进行时，灵枢-玄玑的深空监测网络，再次捕捉到了一组来自“碎星带”方向的、更加清晰、更加复杂的信号。这次，信号中不仅包含了规则波动，似乎还夹杂着一段……经过编译的、指向性明确的数学语言！其内容，像是在询问，又像是在……试探。
“它们……越来越近了。”林枫站在研究院的观星台上，望着深邃的星空，对身边的苏晓沉声道，“我们的合作网络，既是机遇，也可能成为它们观察我们的窗口。必须在真正的接触到来之前，让我们的联盟变得更加强大，也让我们的合作网络，更加牢固。”
“跨位面科技合作”的大门已经打开，联盟正式步入了群星闪耀的大舞台。但这舞台之下，是深不可测的暗流。下一步，当这合作网络触及到某个临界点，引来真正意义上的、智慧等级相当的“外星文明的接触”时，联盟将如何应对？是携手共进，还是黑暗森林？波澜壮阔的“星际丹修”时代，正伴随着机遇与危险，加速到来。