这一天，万军正在基地里面和队员们，总结上次战斗的经验，突然，警报声再次响起。
原来，之前那支外星舰队，虽被打败，但有一艘漏网的，战舰在宇宙深处，悄悄恢复了能量，还引来了一支更庞大、更邪恶的，黑暗军团。
这支军团，由一种全身散发着幽黑光芒、形似巨大章鱼的，外星生物统领，它们所到之处，星球都会被吞噬殆尽。
万军迅速召集队员，驾驶着升级后的飞船，再次出征。这次战斗，比以往更加艰难，黑暗军团的武器，威力惊人，地球舰队的，防线被一次次突破。
万军看着战友们不断倒下，心急如焚。就在这时，神秘智者发现黑暗军团的，能量核心，存在一个短暂的弱点。
万军当机立断，带领敢死队冲向核心。他们在枪林弹雨中穿梭，终于成功破坏了核心。
黑暗军团瞬间大乱，地球舰队乘胜追击，将其彻底击退。
万军望着远去的敌人，深知守护宇宙和平的道路，永无止境，但他和队员们，会一直坚守下去。
然而，就在万军，以为能稍作喘息时，宇宙监测系统，检测到一股前所未有的，强大能量波动，正以极快的速度，朝着地球逼近。
这股能量波动比之前遇到的，任何敌人都要强大，仿佛是来自宇宙深处的，恐怖巨兽。
万军和队员们，不敢有丝毫懈怠，紧急召开会议，商讨对策。可就在他们，还未制定出完善的计划时，那股能量已抵达地球附近。
一个巨大的，黑色球体出现在众人视野中，球体表面不断闪烁着，诡异的光芒，从中涌出无数细小的，黑色触手，朝着地球和宇宙飞船，蔓延而来。
这些触手所过之处，一切物质，都被迅速腐蚀。万军下令全力攻击，可常规武器，对这黑色球体和触手，几乎毫无作用。
神秘智者快速分析，发现这黑色球体，似乎是某种高等文明的，毁灭武器。
就在局势愈发危急时，万军突然想起了之前，在神秘遗迹中，发现的一些古老文献，也许其中隐藏着破解之法……
万军立刻，让神秘智者调出古老文献，进行比对分析。
经过紧张的研究，他们发现文献中，记载了一种特殊的，能量共振频率，或许能瓦解黑色球体。