三月，尉氏县下血雨，妖星出现在南方，太白星在白天出现，中台星分裂。张华的小儿子张韪劝张华退位，张华不听，还说：“天道深远，不如静观其变。”
太子被废后，众人情绪愤怒。卫督司马雅、常从督许超，都曾在东宫任职，他们和殿中郎士猗等人谋划废黜贾后，以恢复太子的地位。因张华、裴頠安于现状、保全职位，难以和他们一起采取权宜行动，而右军将军赵王司马伦掌握兵权，性格贪婪，可借他的力量成事。于是劝孙秀说：“皇后凶狠善妒、做事没有道义，和贾谧等人一起诬陷废黜太子。如今国家没有嫡嗣，社稷将要危险，大臣们将要发起大事，而您名义上侍奉皇后，和贾、郭两家亲近交好，太子被废，都说您事先知道，一旦大事发生，灾祸必定会牵连到您，为什么不提前谋划呢！”孙秀答应了，并把这话告诉了司马伦，司马伦采纳了他的意见，于是告知通事令史张林和省事张衡等人，让他们做内应。
事情将要发动时，孙秀对司马伦说：“太子聪明刚猛，如果回到东宫，必定不会受制于别人。明公您一向依附贾后，这是路人皆知的事，如今即使为太子立下大功，太子也会认为您只是迫于百姓的期望，反复无常来免除罪责罢了，虽然他会忍着旧日的怨恨，但必定不会深深感激您，要是有了嫌隙，您还是免不了被杀。不如拖延时间，贾后必定会加害太子，然后我们在废黜贾后，为太子报仇，这样做岂止是免除灾祸，还能更进一步实现志向！”司马伦认为他说得对。
孙秀趁机派人施行反间计，散布谣言说宫殿里的人想废黜皇后，迎接太子复位。贾后多次派宫女乔装到民间探听，听到这些话后非常害怕。司马伦、孙秀于是劝贾谧等人早点除掉太子，以断绝众人的期望。
癸未日，贾后让太医令程据调配毒药，假传诏令派宦官孙虑到许昌毒杀太子。太子自从被废黜后，担心被下毒，常常自己在面前煮饭吃。孙虑把这事告诉刘振，刘振就把太子迁到小房间里，断绝他的食物，宫里的人还偷偷从墙上递食物给他。孙虑逼迫太子服毒，太子不肯，孙虑就用捣药的木杵把他打死了。有关部门请求按庶人礼仪安葬太子，贾后却上表请求按广陵王的礼仪安葬。
夏季，四月辛卯朔日，发生了日食。
太子死后，赵王司马伦、孙秀就准备讨伐贾后，并把这事告诉了右卫佽飞督闾和，闾和表示同意，双方约定在癸巳日三更时分，以鼓声为信号。
癸巳日，孙秀派司马雅告诉张华：“赵王想和您一起匡扶社稷，为天下除害，特让我来告知您。”张华拒绝了。司马雅愤怒地说：“刀刃都要架到脖子上了，还说这种话！”于是头也不回地走了。
到了约定时间，司马伦假传诏令给三部司马说：“皇后和贾谧等人杀害了我的太子，现在派车骑将军进宫废黜皇后，你们都要听从命令，事情结束后，赐爵关中侯，不听从的诛灭三族。”众人为了活命都听从了。又假传诏令打开宫门，夜里进入宫中，在道路南侧布兵，派翊军校尉齐王司马冏带领一百人推开门进入，华林令骆休做内应，迎接惠帝到东堂，用诏令在殿前召见贾谧，准备诛杀他。贾谧跑到西钟
贾后见到齐王司马冏，吃惊地问：“你为什么来这里？”司马冏说：“有诏令要逮捕你。”贾后说：“诏令应该从我这里发出，哪来的什么诏令！”贾后走到上合，远远呼喊惠帝说：“陛下有妻子，却让人废黜她，这也是在自己废黜自己啊。”当时，梁王司马肜也参与了谋划，贾后问司马冏：“起事的是谁？”司马冏说：“梁王和赵王。”贾后说：“拴狗应该拴脖子，反倒拴了尾巴，怎么能不这样呢！”于是就把贾后废为庶人，并囚禁在建立始殿，又派人去逮捕赵粲、贾午等人关进暴室拷问致死。
诏令尚书逮捕贾氏的亲族党羽，并召集中书监、侍中、黄门侍郎、八座官员都连夜进入宫殿。尚书起初怀疑诏令有诈，郎官师景用不封口的文书上奏请求核对皇帝手诏，司马伦等人斩杀了他示众。
司马伦暗中与孙秀谋划篡位，想先除掉朝廷中有声望的人，并且报复旧日的怨恨，于是在殿前逮捕了张华、裴頠、解系、解结等人。张华对张林说：“你想加害忠臣吗？”张林声称有诏令责问他：“你身为宰相，太子被废黜时，不能以死尽节，这是为什么？”张华说：“式乾殿的议论，我劝谏的事情都有记载，你可以复查。”张林说：“劝谏不被听从，为什么不辞职？”张华无言以对。于是这些人都被斩杀，并且被灭了三族。解结的女儿嫁给裴家，第二天就要出嫁，灾祸却发生了，裴家想认下她让她活下来，女儿说：“家里都成这样了，我还活着干什么！”最终也被牵连处死。朝廷因此商议改革旧制度，规定女子不受娘家牵连而死。
甲午日，司马伦坐在端门，派尚书和郁持符节送贾庶人到金墉城；又诛杀了刘振、董猛、孙虑、程据等人；司徒王戎以及朝廷内外官员中因是张华、裴頠亲族党羽而被罢黜免职的有很多。阎缵抚摸着张华的尸体痛哭说：“早就劝您退位您不肯，今天果然免不了灾祸，这就是命啊！”
于是赵王司马伦假传诏令大赦天下，自己担任使持节、都督中外诸军事、相国、侍中，完全依照宣帝、文帝辅佐曹魏的旧例。设置府兵一万人，让他的世子散骑常侍司马荂兼任冗从仆射，儿子司马馥任前将军，封为济阳王；司马虔任黄门郎，封为汝阴王；司马诩任散骑侍郎，封为霸城侯。孙秀等人都被封在大郡，并且掌握兵权，文武官员被封侯的有几千人，百官都总摄己职听从司马伦的命令。司马伦一向平庸愚蠢，又受制于孙秀。孙秀任中书令，威势权力震动朝廷，天下人都攀附孙秀而不求助于司马伦。
诏令追复已故太子司马遹的位号，又派尚书和郁率领东宫官属到许昌迎接太子的灵柩，追封司马遹的儿子司马虨为南阳王，封司马虨的弟弟司马臧为临淮王，司马尚为襄阳王。
有关部门上奏说：“尚书令王衍身为大臣，在太子被诬陷时，一心只想苟且免祸，请求将他终身禁锢。”朝廷批准了这一奏请。
相国司马伦想笼络人心，选用天下有名望德行的人，便任命前平阳太守李重、荥阳太守荀组为左、右长史，东平人王堪、沛国人刘谟为左、右司马，尚书郎阳平人束皙为记室，淮南王文学荀嵩、殿中郎陆机为参军。荀组是荀勖的儿子，荀嵩是荀彧的玄孙。李重知道司马伦有篡权的野心，便称病不肯就职，司马伦不停地逼迫他，李重忧愤成疾，被人搀扶着接受任命，几天后就去世了。
丁酉日，任命梁王司马肜为太宰，左光禄大夫何劭为司徒，右光禄大夫刘寔为司空。
太子司马遹被废时，朝廷曾打算立淮南王司马允为皇太弟，因群臣意见不一致而作罢。等到赵王司马伦废黜贾后，就任命司马允为骠骑将军、开府仪同三司，兼任中护军。
己亥日，相国司马伦假传诏令，派尚书刘弘携带金屑酒，到金墉城赐死贾后。（这个恶毒的女人终于得到了自己应有的报应）
五月己巳日，诏令立临淮王司马臧为皇太孙，让太子妃王氏回宫做他的母亲；太子的官属随即转为太孙的官属，相国司马伦兼任太孙太傅。
己卯日，朝廷给已故太子定谥号为“愍怀”；六月壬寅日，将他安葬在显平陵。
清河康王司马遐去世。
中护军淮南王司马允，性格沉稳坚毅，宫中警卫将士都敬畏服从他。司马允知道相国司马伦和孙秀有篡权的野心，便在暗中培养敢死之士，谋划讨伐他们；司马伦、孙秀非常忌惮他。秋季八月，调司马允任太尉，表面上是表示优待尊崇，实际上是要剥夺他的兵权。司马允称病不接受任命。孙秀派御史刘机逼迫司马允，收捕他的官属及下属，弹劾他抗拒诏令，犯了大逆不敬之罪。司马允查看诏书，发现是孙秀的亲笔书写，勃然大怒，随即逮捕御史，就准备斩首，御史逃脱，司马允杀了他的两名令史。司马允神色严厉地对身边的人说：“赵王想灭我全家！”于是率领封国的士兵及帐下亲信七百多人径直冲出，并大声呼喊：“赵王谋反，我要讨伐他，愿意跟随我的袒露左臂。”当时归附他的人很多。司马允准备奔赴皇宫，尚书左丞王舆关闭了掖门，司马允无法进入，于是包围了相府。司马允率领的士兵都是精锐，司马伦与他交战，多次战败，死亡一千多人。太子左率陈徽率领东宫的士兵，在宫内击鼓呐喊以响应司马允。司马允在承华门前摆开阵势，弓弩齐发，射向司马伦，箭如雨下。主书司马眭秘用身体掩护司马伦，箭射中他的背部而死。司马伦的官属都躲在树后，每棵树都被射中几百箭。从辰时到未时，中书令陈淮是陈徽的哥哥，想响应司马允，就对惠帝说：“应该派白虎幡来解除争斗。”于是派司马督护伏胤率领四百名骑兵持幡从宫中出发。侍中汝阴王司马虔在门下省，暗中与伏胤发誓说：“富贵后我会和你共享。”伏胤于是怀揣空白诏书出去，谎称有诏令帮助淮南王。司马允没有察觉，便打开军阵让他进来，自己下车接受诏令，伏胤趁机杀了他，同时杀死司马允的儿子秦王司马郁、汉王司马迪，因司马允而被灭族的有几千人。随后，特赦洛阳。当初，孙秀曾做小吏，侍奉黄门郎潘岳，潘岳多次鞭打他。卫尉石崇的外甥欧阳建一向与相国司马伦有矛盾，石崇有个爱妾叫绿珠，孙秀派人前去索要，但石崇不给。等到淮南王司马允失败，孙秀便趁机称石崇、潘岳、欧阳建拥戴司马允作乱，就收捕了他们。石崇感叹说：“奴才们是贪图我的财物罢了！”收捕的人说：“知道财物会带来灾祸，为什么不早点散发出去？”石崇无法回答。当初，潘岳的母亲常责备他说：“你应当知足，却要贪得无厌吗！”等到失败，潘岳向母亲谢罪说：“儿子辜负了母亲。”于是石崇、潘岳、欧阳建都被灭族，石崇家被抄没。相国司马伦收捕了淮南王的同母弟弟吴王司马晏，想杀他，光禄大夫傅祗在朝堂上争辩，众人也都劝谏阻止，司马伦才将司马晏贬为宾徒县王。
齐王司马冏因功升任游击将军，他心里不满，面露怨恨。孙秀察觉到这一点，且担心他在朝中会生事，就把他外调为平东将军，镇守许昌。
随后，任命光禄大夫陈准为太尉，录尚书事；没过多久，陈准去世。
此时，孙秀提议给相国司马伦加授九锡，朝中百官没人敢提出异议。吏部尚书刘颂说：“从前汉朝赐九锡给曹魏，曹魏赐九锡给晋朝，都是一时的权宜之举，不能作为通例。周勃、霍光的功劳极大，也没听说有加九锡的命令。”张林对刘颂积怨已久，认为他是张华的同党，就想杀了他。孙秀说：“杀了张华、裴頠已经损害了声望，不能再杀刘颂了。”张林这才作罢。随后，朝廷任命刘颂为光禄大夫。随后下诏加授司马伦九锡，又加授他的儿子司马荂为抚军将军，司马虔为中军将军，司马诩为侍中。还加授孙秀为侍中、辅国将军，依旧担任相国司马、右率。张林等人都身居显要职位。相府的兵力增加到两万人，与皇宫禁军人数相同，加上私下隐藏的士兵，总数超过三万。
九月，朝廷改司徒为丞相，任命梁王司马肜担任，司马肜坚决推辞不接受。
司马伦和他的儿子们都愚昧浅薄、没有见识，孙秀则狡猾奸诈、贪婪荒淫，和他们一起共事的，都是奸邪谄媚之徒，这些人只知竞相追逐名利，没有深谋远虑，志趣各不相同，还互相憎恨嫉妒。孙秀的儿子孙会担任射声校尉，身材矮小、相貌丑陋，就像地位低下的奴仆，孙秀却让他娶了晋惠帝的女儿河东公主。
冬季，十一月甲子日，册立羊氏为皇后，同时大赦天下。皇后是尚书郎泰山人羊玄之的女儿。她的外祖父平南将军乐安人孙旗，和孙秀关系很好，所以孙秀拥立她为皇后。并任命羊玄之为光禄大夫、特进、散骑常侍，封兴晋侯。
朝廷下诏征召益州刺史赵廞为大长秋，任命成都内史中山人耿滕为益州刺史。赵廞是贾后的姻亲，听说要被征召，心里十分害怕，而且他看到晋朝王室衰败混乱，便在暗中有占据蜀地的打算，于是打开粮仓，救济流民，以此收买人心。他因为李特兄弟有才能、武力过人，他们的同党都是巴西郡人，和自己是同乡，就优厚地对待他们，并把他们当作爪牙。李特等人依仗赵廞的势力，专门聚集众人做强盗，蜀地百姓都以此为患。耿滕多次秘密上表说：“流民强悍勇猛，蜀地百姓软弱，主人控制不了客人，必定会成为祸乱的根源，应该让流民返回原籍。如果把他们留在地势险要的地方，恐怕秦州、雍州的祸乱会转移到梁州、益州来。”赵廞听到后，十分厌恶耿滕。
益州接到诏书后，就派文武官员一千多人去迎接耿滕。当时，成都郡的治所在少城，益州的治所在太城，赵廞还在太城，没有离开。耿滕打算进入太城，功曹陈恂劝谏说：“如今州、郡之间的矛盾一天比一天深，进城必定会有大祸，不如留在少城观察局势变化，发布檄文让各县联合村堡防备秦地的氐人，西夷校尉的军队就要到了，暂且先等他们来。不然的话，就退守犍为，向西渡过江源，以防备意外情况。”但耿滕没有听从。当天，耿滕率领众人进入太城，赵廞派兵迎击，双方在西门交战，耿滕战败被杀。郡里的官吏都逃跑了，只有陈恂反绑双手去见赵廞，请求为耿滕收尸，赵廞认为他讲义气，就答应了。
赵廞又派兵迎击西夷校尉陈总。陈总到达江阳，听说赵廞有叛乱的想法，主簿蜀郡人赵模说：“如今州、郡不和，必定会发生大变故，应当迅速前进奔赴那里。您的府衙是军事要地，帮助顺从朝廷的人讨伐叛逆，谁敢乱动！”陈总却沿途停留，等到达南安鱼涪津时，已经遇上了赵廞的军队。赵模对陈总说：“散发财物招募士兵来抵抗，要是打败了州里的军队，就能占据益州；如果打不赢，顺流而退，也必定没有危险。”陈总说：“赵益州是怨恨耿侯，所以才杀了他，和我没有仇怨，为什么要这样对我！”赵模说：“现在他不是发动叛乱，就必定会杀了您来树立威信。即使不交战，也没有好处啊！”说着就泪流满面，陈总还是不听，众人于是自行溃散。陈总逃到草丛中，赵模穿上陈总的衣服与敌军格斗；赵廞的士兵杀了赵模，发现不是陈总，又四处搜寻抓到了陈总，最终把他杀了。
随后，赵廞自称大都督、大将军、益州牧，并设置属官，更换郡守县令。朝廷任命的官员被召见，没有敢不去的。李庠率领妹夫李含、天水人任回、上官昌、扶风人李攀、始平人费他、氐人苻成、隗伯等四千骑兵归附赵廞。赵廞任命李庠为威寇将军，封阳泉亭侯，并把他当作心腹，让他招集六郡的壮勇之士，达到一万多人，用来截断通往北方的道路。