但平静的日子没有持续太久。新世界树生长过程中，根系无意间穿透了一个被遗忘的古老结界。结界中封印着鸿蒙时代残留的混沌元灵，这些元灵感应到世界树的气息，开始苏醒。
最先醒来的是一团清气化身的元灵，自称秩序之主。它认为世界树的存在破坏了宇宙的自然秩序，要将其连根拔起。秩序之主挥手间，万界法则开始重组，许多宇宙的天道出现紊乱。
归真以情理之道应对，指出秩序不是僵化的规则，而是动态的平衡。她在世界树下开设论道坛，邀请秩序之主参与辩论。经过九日九夜的论道，秩序之主被情理之道折服，化身成为书院的秩序导师。
紧接着，浊气所化的混沌元灵也苏醒过来。混沌元灵崇尚绝对自由，反对任何形式的约束。它化作滔天巨浪，要淹没世界树。归真不惊不惧，引导学子们以情润物，以理导流，将混沌之力转化为创造能量。
混沌元灵在情理之道的感化下，变成书院的创新导师，教导学子如何在规则与自由之间找到平衡点。秩序与混沌的共存，让情理之道达到新的高度。
然而，最强大的元灵迟迟没有现身。它是清浊未分时的鸿蒙本源碎片，拥有创造和毁灭的双重力量。这块碎片一直潜伏在世界树的根系中，等待合适的时机。
归真通过玉符感应到本源碎片的存在，但她没有强行收服，而是以诚相待。每日在世界树下讲道时，她都会留出一个空位，等待本源碎片的到来。她的诚意最终打动了碎片，碎片化形成一位白发老者。
老者坦言，他见证了太多宇宙的兴衰，对新生事物总是抱有戒心。但归真持之以恒的善念，让他看到了希望。他自愿融入世界树，成为树的年轮，记录万界情理的演变。
世界树因此产生质变，枝叶间开始凝结情理结晶。这些结晶是各个宇宙的情理精华，持有者能洞悉情理的奥秘。归真将结晶分发给优秀学子，让他们带回本宇宙传播正道。
但结晶也引来了贪婪之辈。某个科技宇宙的机械帝国研制出情理收割机，企图批量夺取结晶。归真没有动用武力，而是派遣学子前往该宇宙，展示情理之道的真正价值。
学子们以德服人，让机械帝国的统治者认识到，情理结晶的真正力量在于分享而非独占。帝国最终放弃掠夺，转为情理之道的忠实拥护者，并将科技与情理结合，开创出新的文明形态。
在归真的经营下，万界情理体系日趋完善。但她在静修时总是心绪不宁，预感到更大的考验即将来临。这考验不在外界，而在情理体系内部，当体系过于完美时，可能会催生新的问题。
这一日，世界树无风自动，所有情理结晶同时发光。光芒中浮现四个大字：过满则溢。归真明白，这是情理之道即将面临的反噬。但她不知道的是，这场反噬的源头，竟来自她最信任的人。
露珠中的那双眼睛，终于完全睁开。